GLA домен
| GLA домен | |||
|---|---|---|---|
 Привязка коагуляционного фактора VIIA на мембрану через ее домен GLA | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Гла | ||
| Pfam | PF00594 | ||
| InterPro | IPR000294 | ||
| PROSITE | PDOC00011 | ||
| Краткое содержание | 1cfi / scope / supfam | ||
| OPM Суперсемейство | 89 | ||
| OPM белок | 1pfx | ||
| Мембраном | 342 | ||
| |||
Витамин K-зависимый карбоксилирование/гамма-карбоксиглютамический ( GLA ) домен является белковым доменом , который содержит посттрансляционные модификации многих остатков глутамата с помощью витамина k для карбоксилирования формирования γ-карбоксиглутамата (GLA). Белки с этим доменом неформально известны как белки GLA . Остатки GLA ответственны за связывание ионов кальция с высокой аффинностью. [ 1 ] [ 2 ]
Домен GLA связывает ионы кальция, хелатируя их между двумя остатками карбоновой кислоты . Эти остатки являются частью области, которая начинается с N-концевой конечности зрелой формы белков GLA, и которая заканчивается консервативным ароматическим остатком. Это приводит к консервативному мотиву GLA-X (3) -GLA-X-CYS [ 3 ] Это найдено в середине домена и, по -видимому, важно для распознавания субстрата карбоксилазой.
3D -структуры нескольких доменов GLA были решены. [ 4 ] [ 5 ] Ионы кальция вызывают конформационные изменения в домене GLA и необходимы для правильной складывания домена GLA. Общей структурной особенностью функциональных доменов GLA является кластеризация N-концевых гидрофобных остатков в гидрофобный участок, который опосредует взаимодействие с мембраной клеточной поверхности. [ 5 ]
В настоящее время следующие белки, содержащие GLA человека (белки GLA), были охарактеризованы на уровне первичной структуры: факторы коагуляции крови II (протромбин), VII, IX и X, антикоагулянтные белки C и S и фактор X-Targeting Protein Z. белка костяного GLA Остеокальцин -ингибификации, ингибирующий кальцификацию , матричный белок GLA белок GLA (MGP), регулирование роста клеток «Остановка роста специфический ген 6-дюймовый белок -газ6 , периостин (коэффициент, необходимый для миграции и адгезии эпителиальных клеток), плюс два пролина GLA-белок (PRGP) и два трансмембранных белка GLA (TMGP), функции которых неизвестны. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Во всех случаях, когда их функция была известна, наличие остатков GLA в этих белках оказалось необходимым для функциональной активности. [ 9 ]
Подсемейства
[ редактировать ]- Фактор коагуляции , GLA Region InterPro : IPR002383
Человеческие белки, содержащие этот домен
[ редактировать ]- Тромбин (F2) (он же фактор коагуляции II; также его предшественник протромбин) - участвует в коагуляции
- Фактор VII (F7) - участвует в коагуляции
- Фактор IX (F9) - участвует в коагуляции
- Фактор X (F10) - участвует в коагуляции
- Белок C (Proc) - Роли в регуляции антикоагуляции , воспаления , гибели клеток и поддержания проницаемости стен кровеносного сосуда
- Белок S (Pros1) - участвует в коагуляции
- Белок Z (Proz) - участвует в коагуляции
- Остеокальцин (BGLAP) - участвует в минерализации кости .
- Матричный белок GLA (MGP) - ингибитор кальцификации мягких тканей и играет роль в организации кости
- GAS6 - считается, что он участвует в стимуляции пролиферации клеток
- Транстиретин (TTR), ранее известный как преалбумин - несет тирокксин (T4) в крови и в мозговую спинной жидкость
- Ингибитор ингибитора между альфа-трипсином тяжелой цепи H2 ( ITIH2 )-играет роль в островках поджелудочной железы и многих других клеток
- Периостин -фактор, необходимый для миграции клеток ( эмбриональное развитие и иммунные ответы ) и адгезию эпителиальных клеток , чрезмерно экспрессируется при некоторых раковых заболеваниях
- Пролиновый белок GLA 1 ( PRRG1 или PRGP1) [ 6 ] [ 7 ]
- Пролиновый белок GLA 2 ( PRRG2 или PRGP2) [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
- Трансмембранный γ-карбокси глутамил белок 3 ( PRRG3 или TMG3, PRGP3) [ 7 ]
- Трансмембранный γ-карбокси глутамил белок 4 ( PRRG4 или TMG4, PRGP4) [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Friedman PA, Przysiecki CT (1987). «Витамин K-зависимый карбоксилирование». Инт. J. Biochem . 19 (1): 1–7. doi : 10.1016/0020-711x (87) 90116-9 . PMID 3106112 .
- ^ Вермеер С. (1990). «Гамма-карбоксиглютамат-содержащие белки и витамин K-зависимая карбоксилаза» . Биохимия. Дж . 266 (3): 625–636. doi : 10.1042/bj2660625 . PMC 1131186 . PMID 2183788 .
- ^ Прайс П.А., Фрейзер Д.Д., Метц-Вирка Г. (1987). «Молекулярное клонирование матричного белка GLA: последствия для распознавания субстрата с помощью витамина K-зависимой гамма-карбоксилазы» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 84 (23): 8335–8339. Bibcode : 1987pnas ... 84.8335p . doi : 10.1073/pnas.84.23.8335 . PMC 299537 . PMID 3317405 .
- ^ Freedman SJ, Furie BC, Furie B, Baleja JD (1995). «Структура без металла гамма-карбоксиглютаминовой кислоты, богатой области связывания мембраны, фактора IX с помощью двухмерной ЯМР-спектроскопии» . Дж. Биол. Химический 270 (14): 7980–7987. doi : 10.1074/jbc.270.14.7980 . PMID 7713897 .
- ^ Jump up to: а беременный Freedman SJ, Furie BC, Furie B, Baleja JD, Blostein MD, Jacobs M (1996). «Идентификация сайта связывания фосфолипидов в витамине K-зависимого белкового коагуляционного фактора крови» . Дж. Биол. Химический 271 (27): 16227–16236. doi : 10.1074/jbc.271.27.16227 . PMID 8663165 .
- ^ Jump up to: а беременный в Kulman JD, Harris JE, Haldeman BA, Davie EW (август 1997 г.). «Первичная структура и распределение тканей двух новых пролиновых белков гамма-карбоксиглютаминовой кислоты» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (17): 9058–62. Bibcode : 1997pnas ... 94.9058K . doi : 10.1073/pnas.94.17.9058 . PMC 23027 . PMID 9256434 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Kulman JD, Harris Je, Xie L, Davie EW (февраль 2001 г.). «Идентификация двух новых трансмембранных гамма-карбоксиглютаминовых белков кислоты, которые широко экспрессируются в тканях плода и взрослого» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 98 (4): 1370–5. Bibcode : 2001pnas ... 98.1370K . doi : 10.1073/pnas.98.4.1370 . PMC 29263 . PMID 11171957 .
- ^ Jump up to: а беременный Kulman JD, Harris Je, Xie L, Davie EW (май 2007). «Пролиновый белок GLA 2 является клеточным витамином K-зависимым белком, который связывается с транскрипционным коактиватором DES-ассоциированным белком» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 104 (21): 8767–72. Bibcode : 2007pnas..104.8767k . doi : 10.1073/pnas.0703195104 . PMC 1885577 . PMID 17502622 .
- ^ Suttie, JW (1993-03-01). «Синтез витамина K-зависимых белков» (PDF) . FASEB Journal . 7 (5). Федерация американских обществ по экспериментальной биологии: 445–52. doi : 10.1096/fasebj.7.5.8462786 . PMID 8462786 . S2CID 805045 . Получено 2014-11-17 .
 | Эта статья, связанная с мембранным белком, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |