Домен Gla
Домен GLA | |||
---|---|---|---|
![]() Закрепление фактора свертывания крови VIIa на мембране через его домен GLA. | |||
Идентификаторы | |||
Символ | Гла | ||
Пфам | PF00594 | ||
ИнтерПро | IPR000294 | ||
PROSITE | PDOC00011 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1cfi / SCOPe / СУПФАМ | ||
Суперсемейство OPM | 89 | ||
белок OPM | 1pFX | ||
Мембраном | 342 | ||
|
витамин К-зависимого карбоксилирования/гамма-карбоксиглутаминовой ( GLA ) Домен представляет собой белковый домен , который содержит посттрансляционные модификации многих остатков глутамата путем витамин К -зависимого карбоксилирования с образованием γ-карбоксиглутамата (Gla). Белки с этим доменом неофициально известны как Gla-белки . Остатки Gla отвечают за высокоаффинное связывание ионов кальция. [ 1 ] [ 2 ]
Домен GLA связывает ионы кальция, хелатируя их между двумя остатками карбоновой кислоты . Эти остатки являются частью области, которая начинается на N-концевом конце зрелой формы белков Gla и заканчивается консервативным ароматическим остатком. Это приводит к консервативному мотиву Gla-x(3)-Gla-x-Cys. [ 3 ] который находится в середине домена и, по-видимому, важен для распознавания субстрата карбоксилазой.
Были решены трехмерные структуры нескольких доменов Gla. [ 4 ] [ 5 ] Ионы кальция вызывают конформационные изменения в домене Gla и необходимы для правильного сворачивания домена Gla. Общей структурной особенностью функциональных доменов Gla является кластеризация N-концевых гидрофобных остатков в гидрофобный участок, который обеспечивает взаимодействие с мембраной клеточной поверхности. [ 5 ]
В настоящее время на уровне первичной структуры охарактеризованы следующие Gla-содержащие белки человека (Gla-белки): факторы свертывания крови II (протромбин), VII, IX и X, белки-антикоагулянты C и S, фактор X-нацеленный белок Z. Костный Gla-белок остеокальцин , ингибирующий кальцификацию матриксный Gla-белок (MGP), , регулирующий рост клеток «специфического гена остановки роста 6» белок GAS6 , периостин (фактор, необходимый для миграции и адгезии эпителиальных клеток), а также два богатых пролином Gla-белки (PRGP) и два трансмембранных Gla-белка (TMGP), функции которых неизвестны. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Во всех случаях, когда была известна их функция, наличие остатков Gla в этих белках оказалось существенным для функциональной активности. [ 9 ]
Подсемейства
[ редактировать ]- Фактор свертывания крови , область Gla InterPro : IPR002383
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]- Тромбин (F2) (он же фактор свертывания крови II; также его предшественник протромбин) - участвует в свертывании крови.
- Фактор VII (F7) – участвует в свертывании крови.
- Фактор IX (F9) – участвует в свертывании крови.
- Фактор X (F10) – участвует в свертывании крови.
- Белок C (PROC) – роль в регулировании антикоагуляции , воспаления , гибели клеток и поддержании проницаемости стенок кровеносных сосудов.
- Белок S (PROS1) – участвует в свертывании крови.
- Белок Z (PROZ) – участвует в коагуляции.
- Остеокальцин (BGLAP) – участвует в минерализации костей .
- Белок матрикса gla (MGP) – ингибитор кальцификации мягких тканей, играет роль в организации кости.
- GAS6 – считается, что он участвует в стимуляции пролиферации клеток.
- Транстиретин (ТТР), ранее известный как преальбумин, переносит тироксин (Т4) в кровь и в спинномозговую жидкость.
- ингибитора интер-альфа-трипсина Тяжелая цепь H2 ( ITIH2 ) – играет роль в островках поджелудочной железы и многих других клетках.
- Периостин – фактор, необходимый для миграции клеток ( эмбрионального развития и иммунных реакций ) и адгезии эпителиальных клеток , сверхэкспрессируется при некоторых видах рака.
- Богатый пролином gla-белок 1 ( PRRG1 или PRGP1) [ 6 ] [ 7 ]
- Богатый пролином gla-белок 2 ( PRRG2 или PRGP2) [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
- Трансмембранный γ-карбоксиглутамиловый белок 3 ( PRRG3 или TMG3, PRGP3) [ 7 ]
- Трансмембранный γ-карбоксиглутамиловый белок 4 ( PRRG4 или TMG4, PRGP4) [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Фридман П.А., Пшисецкий К.Т. (1987). «Витамин К-зависимое карбоксилирование». Межд. Дж. Биохим . 19 (1): 1–7. дои : 10.1016/0020-711X(87)90116-9 . ПМИД 3106112 .
- ^ Вермеер С (1990). «Гамма-карбоксиглутаматсодержащие белки и витамин К-зависимая карбоксилаза» . Биохим. Дж . 266 (3): 625–636. дои : 10.1042/bj2660625 . ПМЦ 1131186 . ПМИД 2183788 .
- ^ Прайс П.А., Фрейзер Дж.Д., Мец-Вирка Г. (1987). «Молекулярное клонирование матричного белка Gla: значение для распознавания субстрата витамин К-зависимой гамма-карбоксилазой» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 84 (23): 8335–8339. Бибкод : 1987PNAS...84.8335P . дои : 10.1073/pnas.84.23.8335 . ПМК 299537 . ПМИД 3317405 .
- ^ Фридман С.Дж., Фьюри Б.К., Фьюри Б., Баледжа Дж.Д. (1995). «Структура мембраносвязывающей области фактора IX, не содержащей металлов, богатой гамма-карбоксиглутаминовой кислотой, методом двумерной ЯМР-спектроскопии» . Ж. Биол. Хим . 270 (14): 7980–7987. дои : 10.1074/jbc.270.14.7980 . ПМИД 7713897 .
- ^ Jump up to: а б Фридман С.Дж., Фьюри Б.К., Фьюри Б., Балея Дж.Д., Блостейн М.Д., Джейкобс М. (1996). «Идентификация сайта связывания фосфолипидов в витамин К-зависимом белке свертывания крови факторе IX» . Ж. Биол. Хим . 271 (27): 16227–16236. дои : 10.1074/jbc.271.27.16227 . ПМИД 8663165 .
- ^ Jump up to: а б с Кулман Дж.Д., Харрис Дж.Э., Холдеман Б.А., Дэви Э.В. (август 1997 г.). «Первичная структура и распределение в тканях двух новых белков гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, богатых пролином» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (17): 9058–62. Бибкод : 1997PNAS...94.9058K . дои : 10.1073/pnas.94.17.9058 . ПМК 23027 . ПМИД 9256434 .
- ^ Jump up to: а б с д и Кулман Дж.Д., Харрис Дж.Э., Се Л., Дэви Э.В. (февраль 2001 г.). «Идентификация двух новых трансмембранных белков гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, широко экспрессируемых в тканях плода и взрослого человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (4): 1370–5. Бибкод : 2001PNAS...98.1370K . дои : 10.1073/pnas.98.4.1370 . ПМК 29263 . ПМИД 11171957 .
- ^ Jump up to: а б Кулман Дж.Д., Харрис Дж.Э., Се Л., Дэви Э.В. (май 2007 г.). «Богатый пролином Gla-белок 2 представляет собой витамин К-зависимый белок клеточной поверхности, который связывается с коактиватором транскрипции Yes-ассоциированным белком» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 104 (21): 8767–72. Бибкод : 2007PNAS..104.8767K . дои : 10.1073/pnas.0703195104 . ПМЦ 1885577 . ПМИД 17502622 .
- ^ Сатти, JW (1 марта 1993 г.). «Синтез витамин К-зависимых белков» (PDF) . Журнал ФАСЭБ . 7 (5). Федерация американских обществ экспериментальной биологии: 445–52. дои : 10.1096/fasebj.7.5.8462786 . ПМИД 8462786 . S2CID 805045 . Проверено 17 ноября 2014 г.