Домен FYVE
| FYVE цинковый палец | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ПЯТЬ | ||
| Пфам | PF01363 | ||
| ИнтерПро | IPR000306 | ||
| PROSITE | PDOC50178 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1вфы / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 59 | ||
| белок OPM | 1vfy | ||
| CDD | cd00065 | ||
| |||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца FYVE назван в честь четырех цистеином богатых белков : Fab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), Y OTB, Vac 1 (белок-переносчик пузырьков) и E EA1 , в которых он был обнаружен. . Домены FYVE связывают фосфатидилинозитол-3-фосфат , [ 2 ] способом, зависящим от координации его ионов металлов и основных аминокислот. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH. [ 3 ] Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом . [ 4 ]
Структура
[ редактировать ]Домен FYVE состоит из двух небольших бета-шпильок (или цинковых костяшек), за которыми следует альфа-спираль . [ 5 ] Палец FYVE связывает два иона цинка . Палец FYVE имеет восемь потенциальных положений цистеина, координирующих цинк, и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеинов. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:
Палец FYVE структурно похож на домен RING и палец PHD .
Примеры
[ редактировать ]Ниже приводится список белков человека, содержащих этот домен:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5 , FGD6 , FYCO1 , HGS , MTMR3 , MTMR4 , PIKFYVE , PLEKHF1 , PLEKHF2
- RUFY1 , RUFY2 , RUFY3 , RUFY4 , WDFY1 , WDFY2 , WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE9 , ZFYVE16 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , ZFYVE28 , ZFYVE19
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дюма Дж. Дж., Меритью Э., Судхаршан Э. и др. (ноябрь 2001 г.). «Мультивалентное нацеливание на эндосомы с помощью гомодимерного EEA1» . Мол. Ячейка 8 (5): 947–58. дои : 10.1016/S1097-2765(01) 00385-9 ПМИД 11741531 .
- ^ Голье Ж.М., Симонсен А., Д'Арриго А., Бремнес Б., Стенмарк Х., Осланд Р. (июль 1998 г.). «ПЯТЬ ПАЛЬЦЕВ связывают PtdIns(3)P». Природа . 394 (6692): 432–3. дои : 10.1038/28767 . ПМИД 9697764 . S2CID 4385768 .
- ^ Хе Дж., Вора М., Хейни Р.М. и др. (сентябрь 2009 г.). «Мембранная вставка домена FYVE модулируется pH» . Белки . 76 (4): 852–60. дои : 10.1002/прот.22392 . ПМК 2909462 . ПМИД 19296456 .
- ^ Ливерс С.Дж., Ванхезебрук Б., Уотерфилд, доктор медицинских наук (апрель 1999 г.). «Передача сигналов через фосфоинозитид-3-киназы: липиды занимают центральное место». Курс. Мнение. Клеточная Биол . 11 (2): 219–25. дои : 10.1016/S0955-0674(99)80029-5 . ПМИД 10209156 .
- ^ Мисра С., Херли Дж. Х. (май 1999 г.). «Кристаллическая структура фосфатидилинозитол-3-фосфат-специфического мотива, нацеленного на мембрану, домена FYVE Vps27p» . Клетка . 97 (5): 657–66. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80776-X . ПМИД 10367894 . S2CID 15448444 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Стенмарк Х., Осланд Р., То Б.Х., Д'Арриго А. (сентябрь 1996 г.). «Эндосомальная локализация аутоантигена EEA1 опосредуется цинк-связывающим пальцем FYVE» . Ж. Биол. Хим . 271 (39): 24048–54. дои : 10.1074/jbc.271.39.24048 . ПМИД 8798641 .
- Стенмарк Х., Осланд Р. (декабрь 1999 г.). «Белки FYVE-пальцы - эффекторы инозитолового липида». Дж. Клеточная наука . 112 (Часть 23): 4175–83. ПМИД 10564636 .