НОД1

НОД1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2B1W, 2DBD, 2NSN, 2NZ7, 4E9M, 4JQW
Идентификаторы
Псевдонимы	NOD1 , CARD4, CLR7.1, NLRC1, нуклеотидсвязывающий домен олигомеризации, содержащий 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605980 ; МГИ : 1341839 ; Гомологен : 4440 ; Генные карты : NOD1 ; ОМА : NOD1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	30,478,784 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	54,949,597 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; left ovary; ; right lobe of thyroid gland; ; right ovary; ; gingival epithelium; ; upper lobe of left lung; ; left lobe of thyroid gland; ; apex of heart; ; subcutaneous adipose tissue; ; spleen;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; granulocyte; ; subcutaneous adipose tissue; ; sciatic nerve; ; right lung; ; spleen; ; cervix; ; myocardium of ventricle; ; islet of Langerhans; ; stroma of bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein homodimerization activity; protein binding; peptidoglycan binding; identical protein binding; cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process; CARD domain binding; ATP binding; protein-containing complex binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; plasma membrane; basolateral plasma membrane; apical plasma membrane;
Biological process	regulation of apoptotic process; defense response; detection of biotic stimulus; intracellular signal transduction; positive regulation of cell death; immune system process; positive regulation of JNK cascade; positive regulation of xenophagy; positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; cellular response to muramyl dipeptide; JNK cascade; positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; positive regulation of nitric-oxide synthase activity; defense response to bacterium; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; protein complex oligomerization; detection of bacterium; positive regulation of interleukin-1 beta production; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; positive regulation of interleukin-6 production; positive regulation of tumor necrosis factor production; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; inflammatory response; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; signal transduction; positive regulation of stress-activated MAPK cascade; defense response to Gram-positive bacterium; apoptotic process; innate immune response; interleukin-1-mediated signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10392
	107607
	ENSG00000106100
	ENSMUSG00000038058
	Q9Y239
	Q8BHB0
	НМ_006092 ; НМ_001354849
	НМ_001171007 ; НМ_172729
	НП_006083 ; НП_001341778
	НП_001164478 ; НП_766317
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, содержащий домен олигомеризации, связывающий нуклеотиды ( NOD1 ), представляет собой белковый рецептор, который у человека кодируется NOD1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он распознает бактериальные молекулы и стимулирует иммунную реакцию. ^{[ 7 ]}

Белок NOD1 содержит домен рекрутирования каспазы (CARD). NOD1 является членом семейства белков NOD-подобных рецепторов и близким родственником NOD2 . NOD1 представляет собой внутриклеточный рецептор распознавания образов , который по структуре аналогичен устойчивым белкам растений и опосредует врожденный и приобретенный иммунитет путем распознавания молекул, содержащих фрагмент D-глутамил-мезо-диаминопимелиновой кислоты (iE-DAP), включая бактериальный пептидогликан . Nod1 взаимодействует с RIPK2 через CARD обеих молекул (см. структуру CARD NOD1 на правой панели). Стимуляция NOD1 молекулами, содержащими iE-DAP, приводит к активации транскрипционного фактора NF-κB .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106100 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038058 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бертин Дж., Нир В.Дж., Фишер К.М., Тайбер О.В., Эррада П.Р., Грант Дж.Р., Кейлти Дж.Дж., Госселин М.Л., Робисон К.Е., Вонг Г.Х., Глюксманн М.А., ДиСтефано П.С. (май 1999 г.). «Человеческий белок CARD4 представляет собой новый член семейства клеточных смертей CED-4/Apaf-1, который активирует NF-каппаВ» . Журнал биологической химии . 274 (19): 12955–8. дои : 10.1074/jbc.274.19.12955 . ПМИД 10224040 .
^ Инохара Н., Косеки Т., дель Песо Л., Ху Ю, Йи С., Чен С., Каррио Р., Мерино Дж., Лю Д., Ни Дж., Нуньес Дж. (май 1999 г.). «Nod1, Apaf-1-подобный активатор каспазы-9 и ядерного фактора каппаB» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14560–7. дои : 10.1074/jbc.274.21.14560 . ПМИД 10329646 .
^ Махла Р.С., Редди MC, Прасад Д.В., Кумар Х (сентябрь 2013 г.). «Подслащивающие PAMP: роль PAMP в комплексе с сахаром во врожденном иммунитете и биологии вакцин» . Границы в иммунологии . 4 : 248. дои : 10.3389/fimmu.2013.00248 . ПМЦ 3759294 . ПМИД 24032031 .

Дальнейшее чтение

Мартинон Ф., Чопп Дж. (август 2005 г.). «NLR присоединяются к TLR как врожденные сенсоры патогенов». Тенденции в иммунологии . 26 (8): 447–54. дои : 10.1016/j.it.2005.06.004 . ПМИД 15967716 .
Стробер В., Мюррей П.Дж., Китани А., Ватанабэ Т. (январь 2006 г.). «Сигнальные пути и молекулярные взаимодействия NOD1 и NOD2» . Обзоры природы. Иммунология . 6 (1): 9–20. дои : 10.1038/nri1747 . ПМИД 16493424 . S2CID 33505741 .
Инохара Н., Косеки Т., Лин Дж., дель Песо Л., Лукас П.С., Чен Ф.Ф., Огура Ю., Нуньес Г. (сентябрь 2000 г.). «Модель индуцированной близости для активации NF-каппа B в сигнальных путях Nod1/RICK и RIP» . Журнал биологической химии . 275 (36): 27823–31. дои : 10.1074/jbc.M003415200 . ПМИД 10880512 .
Инохара Н., Огура Й., Чен Ф.Ф., Муто А., Нуньес Г. (январь 2001 г.). «Человеческий Nod1 обеспечивает чувствительность к бактериальным липополисахаридам» . Журнал биологической химии . 276 (4): 2551–4. дои : 10.1074/jbc.M009728200 . ПМИД 11058605 .
Чу З.Л., Пио Ф., Се З., Уэлш К., Краевска М., Краевски С., Годзик А., Рид Дж.К. (март 2001 г.). «Новый усилитель апоптосомы Apaf1, участвующий в активации цитохрома с-зависимой каспазы и апоптозе» . Журнал биологической химии . 276 (12): 9239–45. дои : 10.1074/jbc.M006309200 . ПМИД 11113115 .
Ю Нью-Джерси, Пак В.С., Ким С.Ю., Рид Дж.К., Сон С.Г., Ли Дж.И., Ли Ш.Х. (декабрь 2002 г.). «Nod1, белок CARD, усиливает процессинг про-интерлейкина-1бета за счет взаимодействия с прокаспазой-1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 299 (4): 652–8. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02714-6 . ПМИД 12459189 .
Мацуда А, Сузуки Й, Хонда Г, Мурамацу С, Мацузаки О, Нагано Й, Дой Т, Симотоно К, Харада Т, Нисида Е, Хаяси Х, Сугано С (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика генов человека, которые активируют сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген . 22 (21): 3307–18. дои : 10.1038/sj.onc.1206406 . ПМИД 12761501 . S2CID 38880905 .
Стелик С., Хаяши Х., Пио Ф., Годзик А., Рид Дж.К. (август 2003 г.). «CARD6 является модулятором активации NF-каппа B по путям Nod1 и Cardiak» . Журнал биологической химии . 278 (34): 31941–9. дои : 10.1074/jbc.M300009200 . ПМИД 12775719 .
Жирардин С.Е., Бонека И.Г., Карнейро Л.А., Антиньяк А., Жеханно М., Виала Дж., Тедин К., Таха М.К., Лабинь А., Церингер Ю., Койл А.Дж., ДиСтефано П.С., Бертин Дж., Сансонетти П.Дж., Филпотт Дж. (июнь 2003 г.). «Nod1 обнаруживает уникальный муропептид из пептидогликана грамотрицательных бактерий». Наука . 300 (5625): 1584–7. Бибкод : 2003Sci...300.1584G . дои : 10.1126/science.1084677 . ПМИД 12791997 . S2CID 1320864 .
Хисамацу Т., Сузуки М., Подольский Д.К. (август 2003 г.). «Интерферон-гамма усиливает экспрессию гена и белка CARD4/NOD1 посредством регуляторного фактора интерферона-1 в эпителиальных клетках кишечника» . Журнал биологической химии . 278 (35): 32962–8. дои : 10.1074/jbc.M304355200 . ПМИД 12813035 .
Жирарден С.Е., Травассос Л.Х., Эрве М., Блано Д., Бонека И.Г., Филпотт Д.Д., Сансонетти П.Дж., Менжен-Лекрелькс Д. (октябрь 2003 г.). «Молекулярные требования к пептидогликанам, позволяющие обнаруживать их с помощью Nod1 и Nod2» . Журнал биологической химии . 278 (43): 41702–8. дои : 10.1074/jbc.M307198200 . ПМИД 12871942 .
Ким Дж.Г., Ли С.Дж., Кагнофф М.Ф. (март 2004 г.). «Nod1 является важным преобразователем сигнала в эпителиальных клетках кишечника, инфицированных бактериями, которые избегают распознавания толл-подобными рецепторами» . Инфекция и иммунитет . 72 (3): 1487–95. дои : 10.1128/IAI.72.3.1487-1495.2004 . ПМК 356064 . ПМИД 14977954 .
Дамиано Дж.С., Оливейра В., Уэлш К., Рид Дж.С. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов» . Биохимический журнал . 381 (Часть 1): 213–9. дои : 10.1042/BJ20031506 . ПМЦ 1133779 . ПМИД 15107016 .

Внешние ссылки

NOD1 Расположение гена человека в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека NOD1 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106100 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038058 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10224040-5] Бертин Дж., Нир В.Дж., Фишер К.М., Тайбер О.В., Эррада П.Р., Грант Дж.Р., Кейлти Дж.Дж., Госселин М.Л., Робисон К.Е., Вонг Г.Х., Глюксманн М.А., ДиСтефано П.С. (май 1999 г.). «Человеческий белок CARD4 представляет собой новый член семейства клеточных смертей CED-4/Apaf-1, который активирует NF-каппаВ» . Журнал биологической химии . 274 (19): 12955–8. дои : 10.1074/jbc.274.19.12955 . ПМИД 10224040 .

[pmid10329646-6] Инохара Н., Косеки Т., дель Песо Л., Ху Ю, Йи С., Чен С., Каррио Р., Мерино Дж., Лю Д., Ни Дж., Нуньес Дж. (май 1999 г.). «Nod1, Apaf-1-подобный активатор каспазы-9 и ядерного фактора каппаB» . Журнал биологической химии . 274 (21): 14560–7. дои : 10.1074/jbc.274.21.14560 . ПМИД 10329646 .

[7] Махла Р.С., Редди MC, Прасад Д.В., Кумар Х (сентябрь 2013 г.). «Подслащивающие PAMP: роль PAMP в комплексе с сахаром во врожденном иммунитете и биологии вакцин» . Границы в иммунологии . 4 : 248. дои : 10.3389/fimmu.2013.00248 . ПМЦ 3759294 . ПМИД 24032031 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и NOD-подобных рецепторов Семейство
CARD domain containing	NOD1/NLRC1 NOD2/NLRC2 NLRC3 NLRC4 NLRC5
Pyrin domain containing	NLRP1 NLRP2 NLRP3 NLRP4 NLRP5 NLRP6 NLRP7 NLRP8 NLRP9 NLRP10 NLRP11 NLRP12 NLRP13 NLRP14
Apoptosis inhibitory protein	NAIP
Family member X1	NLRX1