НАИП (ген)

НАИП
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2VM5
Идентификаторы
Псевдонимы	NAIP , BIRC1, NLRB1, семейство psiNLR, белок, ингибирующий апоптоз, белок, ингибирующий апоптоз семейства NLR
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600355 ; МГИ : 1298226 ; Гомологен : 136092 ; GeneCards : НАИП ; ОМА : НАИП - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	71,025,339 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	100,338,600 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; spleen; ; granulocyte; ; appendix; ; bone marrow cells; ; right uterine tube; ; epithelium of colon; ; ganglionic eminence; ; right lung; ; blood;
	Top expressed in
	granulocyte; ; left colon; ; ileum; ; Paneth cell; ; jejunum; ; epithelium of small intestine; ; intestinal villus; ; duodenum; ; urethra; ; male urethra;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	peptidase inhibitor activity; nucleotide binding; cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; ATP binding; cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process;
Cellular component	perikaryon; neuronal cell body; basolateral plasma membrane; neuron projection; cytoplasm; nucleus;
Biological process	negative regulation of neuron apoptotic process; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; response to amino acid; negative regulation of peptidase activity; immune system process; nervous system development; response to axon injury; innate immune response; inflammatory response; apoptotic process; protein ubiquitination; positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; mitotic spindle assembly; inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; negative regulation of apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4671
	17948
	ENSG00000278613 ; ENSG00000276068 ; ENSG00000249437
	ENSMUSG00000078945
	Q13075
	Q9QUK4
	НМ_004536 ; НМ_022892 ; НМ_001346870
	НМ_001126182 ; НМ_010872
	НП_001333799 ; НП_004527 ; НП_075043
	НП_001119654 ; НП_035002
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бакуловирусный белок 1, содержащий повтор IAP, представляет собой белок , который у человека кодируется NAIP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген является частью инвертированной дупликации размером 500 т.п.н. на хромосоме 5q 13. Эта дублированная область содержит по меньшей мере четыре гена и повторяющиеся элементы, которые делают ее склонной к перегруппировкам и делециям. Повторяемость и сложность последовательности также вызвали трудности в определении организации этой геномной области. Эта копия гена полноразмерная; дополнительные копии с укороченными и внутренними делециями также присутствуют в этом участке хромосомы 5q13. Считается, что этот ген является модификатором спинальной мышечной атрофии, вызванной мутациями в соседнем гене SMN1 . Белок, кодируемый этим геном, содержит участки гомологии с двумя бакуловирусными белками- ингибиторами апоптоза и способен подавлять апоптоз, индуцируемый различными сигналами. альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы . Для этого гена были обнаружены ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000276068, ENSG00000249437 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000278613, ENSG00000276068, ENSG00000249437 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078945 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Рой Н., Махадеван М.С., Маклин М., Шатлер Г., Яраги З., Фарахани Р., Бэрд С., Беснер-Джонстон А., Лефевр С., Канг X и др. (февраль 1995 г.). «Ген белка, ингибирующего апоптоз нейронов, частично удален у людей со спинальной мышечной атрофией» . Клетка . 80 (1): 167–78. дои : 10.1016/0092-8674(95)90461-1 . ПМИД 7813013 . S2CID 15141092 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство NAIP NLR, белок, ингибирующий апоптоз» .

Дальнейшее чтение

ван дер Стиге Г., Драайерс Т.Г., Гроотшольтен П.М. и др. (1995). «Предварительная карта транскриптов критической области спинальной мышечной атрофии (СМА)». Евро. Дж. Хум. Жене . 3 (2): 87–95. дои : 10.1159/000472281 . ПМИД 7552146 . S2CID 46083524 .
Листон П., Рой Н., Тамай К. и др. (1996). «Подавление апоптоза в клетках млекопитающих с помощью NAIP и родственного семейства генов IAP». Природа . 379 (6563): 349–53. Бибкод : 1996Natur.379..349L . дои : 10.1038/379349a0 . ПМИД 8552191 . S2CID 4305853 .
Чен К., Бэрд С.Д., Махадеван М. и др. (1998). «Последовательность области 5q13.1 размером 131 т.п.н., содержащей гены-кандидаты спинальной мышечной атрофии SMN и NAIP». Геномика . 48 (1): 121–7. дои : 10.1006/geno.1997.5141 . ПМИД 9503025 .
Монани У.Р., Лорсон К.Л., Парсонс Д.В. и др. (1999). «Разница в один нуклеотид, которая изменяет структуру сплайсинга, отличает ген SMA SMN1 от копии гена SMN2». Хм. Мол. Жене . 8 (7): 1177–83. дои : 10.1093/hmg/8.7.1177 . ПМИД 10369862 .
Ямамото К., Сакаи Х., Хадано С. и др. (1999). «Идентификация двух различных транскриптов гена белка, ингибирующего апоптоз нейронов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 264 (3): 998–1006. дои : 10.1006/bbrc.1999.1615 . ПМИД 10544044 .
Мерсер Е.А., Корхонен Л., Скоглёса Ю. и др. (2000). «NAIP взаимодействует с гиппокальцином и защищает нейроны от гибели клеток, вызванной кальцием, посредством каспазо-3-зависимых и независимых путей» . ЭМБО Дж . 19 (14): 3597–607. дои : 10.1093/emboj/19.14.3597 . ПМК 313967 . ПМИД 10899114 .
Санна М.Г., да Силва Коррейя Дж., Дюкри О. и др. (2002). «Подавление апоптоза IAP включает в себя различные механизмы: сигнальный каскад TAK1/JNK1 и ингибирование каспаз» . Мол. Клетка. Биол . 22 (6): 1754–66. дои : 10.1128/MCB.22.6.1754-1766.2002 . ПМЦ 135597 . ПМИД 11865055 .
Акуцу Т., Нисио Х., Сумино К. и др. (2002). «Молекулярная генетика спинальной мышечной атрофии: вклад гена NAIP в тяжесть клинической картины». Кобе Журнал медицинских наук . 48 (1–2): 25–3 ПМИД 11912351 .
Сюй М., Окада Т., Сакаи Х. и др. (2002). «Функциональные регуляторные элементы транскрипции промотора NAIP человека для генов NAIP и PsiNAIP». Биохим. Биофиз. Акта . 1574 (1): 35–50. дои : 10.1016/S0167-4781(01)00343-8 . ПМИД 11955612 .
Нотарбартоло М., Сервелло М., Дюсонше Л., Д'Алессандро Н. (2002). «NAIP-deltaEx10-11: новый сплайсинговый вариант ингибитора апоптоза NAIP, по-разному экспрессируемый в чувствительных к лекарству и множественно-резистентных к лекарственным средствам клетках лейкемии HL60». Лейк. Рез . 26 (9): 857–62. дои : 10.1016/S0145-2126(02)00016-4 . ПМИД 12127562 .
Линдхольм Д., Мерсер Е.А., Ю.Л.Ю. и др. (2002). «Белок, ингибирующий апоптоз нейронов: структурные требования к связыванию гиппокальцина и влияние на выживаемость NGF-зависимых симпатических нейронов». Биохим. Биофиз. Акта . 1600 (1–2): 138–47. дои : 10.1016/S1570-9639(02)00454-5 . ПМИД 12445469 .
Дамиано Дж.С., Оливейра В., Уэлш К., Рид Дж.С. (2004). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов» . Биохим. Дж . 381 (Часть 1): 213–9. дои : 10.1042/BJ20031506 . ПМЦ 1133779 . ПМИД 15107016 .
Давуди Дж., Лин Л., Келли Дж. и др. (2004). «Белок, ингибирующий апоптоз нейронов, не взаимодействует с Smac и требует АТФ для связывания каспазы-9» . Ж. Биол. Хим . 279 (39): 40622–8. дои : 10.1074/jbc.M405963200 . ПМИД 15280366 .
Обен Д., Ганьон А., Грюндер Л. и др. (2004). «Уровни адипогенного и антиапоптотического белка в жировых стромальных клетках человека после потери веса» . Обес. Рез . 12 (8): 1231–4. дои : 10.1038/oby.2004.156 . ПМИД 15340105 .
Шмутц Дж., Мартин Дж., Терри А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 5-й хромосомы человека» . Природа . 431 (7006): 268–74. Бибкод : 2004Natur.431..268S . дои : 10.1038/nature02919 . ПМИД 15372022 .
Романиш М.Т., Локк В.М., ван де Лагемаат Л.Н. и др. (2007). «Повторное привлечение ретротранспозонов LTR в качестве промоторов антиапоптотическим локусом NAIP во время эволюции млекопитающих» . ПЛОС Генет . 3 (1): е10. дои : 10.1371/journal.pgen.0030010 . ПМЦ 1781489 . ПМИД 17222062 .
Майер Дж.К., Балабанян С., Коффилл С.Р. и др. (2007). «Распределение белка, ингибирующего апоптоз нейронов, в тканях человека» . Дж. Гистохим. Цитохим . 55 (9): 911–23. дои : 10.1369/jhc.6A7144.2007 . ПМИД 17510375 .

Внешние ссылки

Нейрональный + ингибирующий апоптоз + белок Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13075 (белок 1, содержащий бакуловирусный IAP) на PDBe-KB .

Эта трансмембранным рецепторам статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000276068, ENSG00000249437 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000278613, ENSG00000276068, ENSG00000249437 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078945 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7813013-5] Рой Н., Махадеван М.С., Маклин М., Шатлер Г., Яраги З., Фарахани Р., Бэрд С., Беснер-Джонстон А., Лефевр С., Канг X и др. (февраль 1995 г.). «Ген белка, ингибирующего апоптоз нейронов, частично удален у людей со спинальной мышечной атрофией» . Клетка . 80 (1): 167–78. дои : 10.1016/0092-8674(95)90461-1 . ПМИД 7813013 . S2CID 15141092 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: семейство NAIP NLR, белок, ингибирующий апоптоз» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

v т и NOD-подобных рецепторов Семейство
CARD domain containing	NOD1/NLRC1 NOD2/NLRC2 NLRC3 NLRC4 NLRC5
Pyrin domain containing	NLRP1 NLRP2 NLRP3 NLRP4 NLRP5 NLRP6 NLRP7 NLRP8 NLRP9 NLRP10 NLRP11 NLRP12 NLRP13 NLRP14
Apoptosis inhibitory protein	NAIP
Family member X1	NLRX1