НЛРК5

НЛРК5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2MJM
Идентификаторы
Псевдонимы	NLRC5 , CLR16.1, NOD27, NOD4, семейство NLR, домен CARD, содержащий 5, домен CARD семейства NLR, содержащий 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 613537 ; МГИ : 3612191 ; Гомологен : 88935 ; GeneCards : NLRC5 ; OMA : NLRC5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	57,083,531 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	95,253,900 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; spleen; ; bone marrow cells; ; blood; ; appendix; ; lymph node; ; monocyte; ; mucosa of ileum; ; trabecular bone; ; epithelium of nasopharynx;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; subcutaneous adipose tissue; ; blood; ; spleen; ; submandibular gland; ; thymus; ; Paneth cell; ; lens; ; white adipose tissue; ; skin of abdomen;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein binding; ATP binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; centrosome; nucleus; cytosol;
Biological process	positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; negative regulation of type I interferon production; positive regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; positive regulation of MHC class I biosynthetic process; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of kinase activity; immune system process; innate immune response; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; response to bacterium; intracellular signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84166
	434341
	ENSG00000140853
	ENSMUSG00000074151
	Q86WI3
	C3VPR6
	НМ_032206 ; НМ_001330552
	НМ_001033207
	НП_001317481 ; НП_115582
	НП_001028379
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

NLRC5 , сокращение от NOD-подобных рецепторов, семейства домена CARD содержащего 5, представляет собой внутриклеточный белок, который играет роль в иммунной системе . NLRC5 представляет собой рецептор распознавания образов , участвующий во врожденном иммунитете к вирусам , потенциально регулируя активность интерферона . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Он также действует как врожденный иммунный сенсор, вызывающий гибель воспалительных клеток (ПАНОптоз) . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} У человека белок NLRC5 кодируется NLRC5 геном . ^{[ 10 ]} Его также называли NOD27, NOD4 и CLR16.1.

Структура

Структурно NLRC5 имеет предполагаемый домен рекрутирования каспазы ( CARD ), за которым следует домен NACHT и область C-концевого богатого лейцином повтора ( LRR ).

Функция

Благодаря своим структурным особенностям NLRC5 действует как ключевой регулятор главного класса гистосовместимости I (MHCI) молекул экспрессии . ^{[ 11 ]} играют важную роль в адаптивной иммунной системе. Этот аспект функции NLRC5 был дополнительно исследован с помощью , Nlrc5 мышей с дефицитом у которых наблюдалась сниженная экспрессия MHCI в лимфоцитах (особенно в T- , NK- и NKT- лимфоцитах). ^{[ 12 ]} В лимфоцитах NLRC5 локализуется в ядре и управляет экспрессией гена MHCI, занимая H-2D и H-2K промоторы генов . ^{[ 12 ]}

NLRC5 также функционирует как сенсор врожденного иммунитета, который при НАД ⁺ истощение формирует ПАНоптосому, вызывающую ПАНоптоз и воспаление . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} ПАНоптоз — это известный путь гибели врожденных иммунных, воспалительных и литических клеток , инициируемый врожденными иммунными сенсорами и управляемый каспазами и взаимодействующими с рецепторами протеинкиназами (RIPK) через PANоптосомы. ПАНоптосомы представляют собой мультибелковые комплексы, которые собираются рецепторами распознавания образов, кодируемыми зародышевой линией (PRR) (сенсорами врожденного иммунитета) в ответ на патогены, включая бактериальные, вирусные и грибковые инфекции, а также связанные с патогенами молекулярные паттерны , связанные с повреждением молекулярные паттерны , , цитокины и гомеостатические изменения во время инфекций, воспалительных состояний и рака . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} NLRC5 образует комплекс PANоптосом с другими NLR, включая NLRP12 и NLRP3, в ответ на NAD. ⁺ истощение, вызывающее PANoptosis через каспазу-8 и RIPK3 . Делеция Nlrc5 защищает мышей от летальности на моделях гемолитического, гемофагоцитарного лимфогистиоцитоза и колита. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140853 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074151 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нееринкс А., Лаутц К., Меннинг М., Креммер Э., Зигрино П., Хёзель М. и др. (август 2010 г.). «Роль человеческого нуклеотидсвязывающего домена, члена семейства NLRC5, содержащего богатые лейцином повторы, в противовирусных ответах» . Журнал биологической химии . 285 (34): 26223–26232. дои : 10.1074/jbc.M110.109736 . ПМК 2924034 . ПМИД 20538593 .
^ Цуй Дж., Чжу Л., Ся Х., Ван Х.И., Легра Х., Хун Дж. и др. (апрель 2010 г.). «NLRC5 отрицательно регулирует сигнальные пути NF-kappaB и интерферона I типа» . Клетка . 141 (3): 483–496. дои : 10.1016/j.cell.2010.03.040 . ПМК 3150216 . ПМИД 20434986 .
^ Куэнзель С., Тилль А., Винклер М., Хэслер Р., Липински С., Юнг С. и др. (февраль 2010 г.). «Нуклеотид-связывающий домен олигомеризации-подобный рецептор NLRC5 участвует в IFN-зависимых противовирусных иммунных ответах» . Журнал иммунологии . 184 (4): 1990–2000. doi : 10.4049/jimmunol.0900557 . ПМИД 20061403 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сундарам Б., Пандиан Н., Ким Х.Дж., Абделаал Х.М., Молл Р., Индари О. и др. (июль 2024 г.). «NLRC5 чувствует НАД ⁺ истощение, образование ПАНоптосомы и запуск ПАНоптоза и воспаления» . Cell . 187 (15): 4061–4077.e17. doi : 10.1016/ . PMC 11283362. . PMID 38878777 j.cell.2024.05.034
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ученые из Сент-Джуда раскрывают тайну сенсорной функции NLRC5, связанной с гибелью клеток и болезнями, которая длилась десятилетиями» . www.stjude.org . 14 июня 2024 г. Проверено 13 августа 2024 г.
^ Даудс Т.А., Масумото Дж., Чен Ф.Ф., Огура Ю., Инохара Н., Нуньес Г. (март 2003 г.). «Регуляция передачи сигналов криопирин/Pypaf1 с помощью пирина, продукта гена семейной средиземноморской лихорадки». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 302 (3): 575–580. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00221-3 . ПМИД 12615073 .
^ Мейснер Т.Б., Ли А., Бисвас А., Ли К.Х., Лю Ю.Дж., Байир Э. и др. (август 2010 г.). «Член семейства NLR, NLRC5, является регулятором транскрипции генов MHC класса I» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (31): 13794–13799. Бибкод : 2010PNAS..10713794M . дои : 10.1073/pnas.1008684107 . ПМЦ 2922274 . ПМИД 20639463 .
^ Jump up to: ^а ^б Сталь Ф., Людигс К., Хайнц Л.К., Сегин-Эстевес К., Ферреро И., Браун М. и др. (апрель 2012 г.). «Дефицит NLRC5 избирательно нарушает MHC-зависимое уничтожение лимфоцитов цитотоксическими Т-клетками» . Журнал иммунологии . 188 (8): 3820–3828. doi : 10.4049/jimmunol.1102671 . ПМИД 22412192 .
^ Самир П., Малиредди Р.К., Каннеганти Т.Д. (2020). «ПАНоптосома: смертельный белковый комплекс, вызывающий пироптоз, апоптоз и некроптоз (ПАНОптоз)» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 10 : 238. дои : 10.3389/fcimb.2020.00238 . ПМЦ 7283380 . ПМИД 32582562 .
^ Карки Р., Каннеганти Т.Д. (август 2023 г.). «Передача сигналов PANоптосом и терапевтическое значение при инфекции: центральная роль ZBP1 в активации воспаления и PANoptosis» . Современное мнение в иммунологии . 83 : 102348. doi : 10.1016/j.coi.2023.102348 . ПМЦ 10524556 . ПМИД 37267644 .

Эта трансмембранным рецепторам статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140853 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074151 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid20538593-5] Нееринкс А., Лаутц К., Меннинг М., Креммер Э., Зигрино П., Хёзель М. и др. (август 2010 г.). «Роль человеческого нуклеотидсвязывающего домена, члена семейства NLRC5, содержащего богатые лейцином повторы, в противовирусных ответах» . Журнал биологической химии . 285 (34): 26223–26232. дои : 10.1074/jbc.M110.109736 . ПМК 2924034 . ПМИД 20538593 .

[pmid20434986-6] Цуй Дж., Чжу Л., Ся Х., Ван Х.И., Легра Х., Хун Дж. и др. (апрель 2010 г.). «NLRC5 отрицательно регулирует сигнальные пути NF-kappaB и интерферона I типа» . Клетка . 141 (3): 483–496. дои : 10.1016/j.cell.2010.03.040 . ПМК 3150216 . ПМИД 20434986 .

[pmid20061403-7] Куэнзель С., Тилль А., Винклер М., Хэслер Р., Липински С., Юнг С. и др. (февраль 2010 г.). «Нуклеотид-связывающий домен олигомеризации-подобный рецептор NLRC5 участвует в IFN-зависимых противовирусных иммунных ответах» . Журнал иммунологии . 184 (4): 1990–2000. doi : 10.4049/jimmunol.0900557 . ПМИД 20061403 .

[Sundaram_2024-8] Jump up to: ^а ^б ^с Сундарам Б., Пандиан Н., Ким Х.Дж., Абделаал Х.М., Молл Р., Индари О. и др. (июль 2024 г.). «NLRC5 чувствует НАД ⁺ истощение, образование ПАНоптосомы и запуск ПАНоптоза и воспаления» . Cell . 187 (15): 4061–4077.e17. doi : 10.1016/ . PMC 11283362. . PMID 38878777 j.cell.2024.05.034

[www.stjude.org_2024-9] Jump up to: ^а ^б ^с «Ученые из Сент-Джуда раскрывают тайну сенсорной функции NLRC5, связанной с гибелью клеток и болезнями, которая длилась десятилетиями» . www.stjude.org . 14 июня 2024 г. Проверено 13 августа 2024 г.

[pmid12615073-10] Даудс Т.А., Масумото Дж., Чен Ф.Ф., Огура Ю., Инохара Н., Нуньес Г. (март 2003 г.). «Регуляция передачи сигналов криопирин/Pypaf1 с помощью пирина, продукта гена семейной средиземноморской лихорадки». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 302 (3): 575–580. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00221-3 . ПМИД 12615073 .

[pmid20639463-11] Мейснер Т.Б., Ли А., Бисвас А., Ли К.Х., Лю Ю.Дж., Байир Э. и др. (август 2010 г.). «Член семейства NLR, NLRC5, является регулятором транскрипции генов MHC класса I» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (31): 13794–13799. Бибкод : 2010PNAS..10713794M . дои : 10.1073/pnas.1008684107 . ПМЦ 2922274 . ПМИД 20639463 .

[pmid22412192-12] Jump up to: ^а ^б Сталь Ф., Людигс К., Хайнц Л.К., Сегин-Эстевес К., Ферреро И., Браун М. и др. (апрель 2012 г.). «Дефицит NLRC5 избирательно нарушает MHC-зависимое уничтожение лимфоцитов цитотоксическими Т-клетками» . Журнал иммунологии . 188 (8): 3820–3828. doi : 10.4049/jimmunol.1102671 . ПМИД 22412192 .

[Samir_2020-13] Самир П., Малиредди Р.К., Каннеганти Т.Д. (2020). «ПАНоптосома: смертельный белковый комплекс, вызывающий пироптоз, апоптоз и некроптоз (ПАНОптоз)» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 10 : 238. дои : 10.3389/fcimb.2020.00238 . ПМЦ 7283380 . ПМИД 32582562 .

[Karki_2023-14] Карки Р., Каннеганти Т.Д. (август 2023 г.). «Передача сигналов PANоптосом и терапевтическое значение при инфекции: центральная роль ZBP1 в активации воспаления и PANoptosis» . Современное мнение в иммунологии . 83 : 102348. doi : 10.1016/j.coi.2023.102348 . ПМЦ 10524556 . ПМИД 37267644 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

v т и NOD-подобных рецепторов Семейство
Домен CARD, содержащий	НОД1 /NLRC1 НОД2 /НЛРК2 НЛРК3 НЛРК4 НЛРК5
Я пытаюсь использовать домен, содержащий	НЛРП1 НЛРП2 НЛРП3 НЛРП4 НЛРП5 НЛРП6 НЛРП7 НЛРП8 НЛРП9 НЛРП10 НЛРП11 НЛРП12 НЛРП13 НЛРП14
апоптоз Белок, ингибирующий	НАИП
Член семьи X1	НЛРХ1