POLR2E

POLR2E
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5IY6, 5IY9, 5IY8, 5IYA, 5IYB, 5IY7, 5IYC, 5IYD
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2E , RPABC1, RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5, полимераза (РНК) II субъединица E, РНК-полимераза II субъединица E, РНК-полимераза II, I и III субъединица E
Внешние идентификаторы	Опустить : 180664 ; МГИ : 1913670 ; Гомологен : 2018 ; Генные карты : POLR2E ; OMA : POLR2E — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	1,095,380 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	79,875,629 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; right lobe of liver; ; prefrontal cortex; ; right frontal lobe; ; muscle of thigh; ; muscle layer of sigmoid colon; ; right adrenal gland; ; popliteal artery; ; abdominal fat; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	yolk sac; ; embryo; ; morula; ; embryo; ; somite; ; blastocyst; ; epiblast; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; otic placode;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; RNA polymerase II activity; RNA polymerase III activity; protein binding; RNA polymerase I activity; DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity;
Cellular component	cytosol; RNA polymerase I complex; RNA polymerase III complex; RNA polymerase II, core complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	termination of RNA polymerase I transcription; mRNA splicing, via spliceosome; epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; transcription initiation from RNA polymerase I promoter; transcription elongation from RNA polymerase II promoter; 7-methylguanosine mRNA capping; transcription by RNA polymerase II; transcription-coupled nucleotide-excision repair; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; viral process; transcription by RNA polymerase III; fibroblast growth factor receptor signaling pathway; snRNA transcription by RNA polymerase II; RNA metabolic process; regulation of gene silencing by miRNA; transcription, DNA-templated; transcription elongation from RNA polymerase I promoter; positive regulation of type I interferon production; somatic stem cell population maintenance; positive regulation of viral transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5434
	66420
	ENSG00000099817
	ENSMUSG00000004667
	P19388
	Q80UW8
	НМ_002695 ; НМ_001316323 ; НМ_001316324
	НМ_025554
	НП_001303252 ; НП_001303253 ; НП_002686
	НП_079830
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ДНК-направленных РНК-полимераз I, II и III RPABC1 представляет собой белок , который у человека кодируется POLR2E геном . ^{[ 5 ]}

Этот ген кодирует пятую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез информационной РНК у эукариот. Эта субъединица является общей для двух других ДНК-направленных РНК-полимераз и присутствует в двукратном молярном избытке по сравнению с другими субъединицами полимеразы. Было продемонстрировано взаимодействие между этой субъединицей и белком, трансактивирующим вирус гепатита, что позволяет предположить, что взаимодействие между активаторами транскрипции и полимеразой может происходить через эту субъединицу. Псевдоген расположен на 11 хромосоме. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что POLR2E взаимодействует с TAF15 . ^{[ 7 ]} ПОЛР2С , ^{[ 8 ]} ПОЛР2Г , ^{[ 8 ]} ПОЛР2Х , ^{[ 8 ]} ПОЛР2А , ^{[ 8 ]} ПОЛР2Б , ^{[ 8 ]} ПОЛР2Л ^{[ 8 ]} и GTF2F2 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000099817 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004667 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Акер Дж., Маттей М.Г., Винтцерит М., Рокель Н., Депетрис Д., Виньерон М., Кедингер С. (август 1994 г.). «Хромосомная локализация генов субъединицы РНК-полимеразы II человека». Геномика . 20 (3): 496–499. дои : 10.1006/geno.1994.1208 . ПМИД 8034326 .
^ «Ген Энтреза: полипептид Е полимеразы (РНК) II (ДНК) POLR2E, 25 кДа» .
^ Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делатр О., Тора Л. (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 1489–1497 гг. дои : 10.1128/mcb.18.3.1489 . ISSN 0270-7306 . ПМЦ 108863 . ПМИД 9488465 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Акер Дж., де Грааф М., Чейнель И., Хазак В., Кедингер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека» . Ж. Биол. Хим . 272 (27). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 16815–16821. дои : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9201987 .
^ Вэй В., Доржсурен Д., Линь Ю., Цинь В., Номура Т., Хаяши Н., Мураками С. (апрель 2001 г.). «Прямое взаимодействие между субъединицей RAP30 фактора транскрипции IIF (TFIIF) и субъединицей 5 РНК-полимеразы, что способствует ассоциации между TFIIF и РНК-полимеразой II» . Ж. Биол. Хим . 276 (15). США: 12266–12273. дои : 10.1074/jbc.M009634200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11278533 .

Дальнейшее чтение

Жанг КТ (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». Дж. Биомед. Наука . 5 (1): 24–27. дои : 10.1007/BF02253352 . ПМИД 9570510 .
Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транкрипционный контроль: кофакторы Tat и элонгация транскрипции» . Курс. Биол . 8 (13): Р447–9. Бибкод : 1998CBio....8.R447Y . дои : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . ПМИД 9651670 . S2CID 15480646 .
Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. и др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». Дж. Селл. Биохим . 75 (3): 357–368. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . ПМИД 10536359 . S2CID 43685090 .
Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции с помощью трансактиватора Tat ВИЧ-1» . ИУБМБ Жизнь . 51 (3): 175–181. дои : 10.1080/152165401753544241 . ПМИД 11547919 . S2CID 10931640 .
Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Медресе преп . 26 (5): 595–625. дои : 10.1002/мед.20081 . ПМЦ 7168390 . ПМИД 16838299 .
Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л. и др. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к созданию новых мишеней для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели по борьбе с наркотиками . 7 (12): 1595–1606. дои : 10.2174/138945006779025338 . PMID 17168834 .
Като Х., Сумимото Х., Поньонец П. и др. (1992). «Тат ВИЧ-1 действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточной элонгации» . Генс Дев . 6 (4): 655–666. дои : 10.1101/gad.6.4.655 . ПМИД 1559613 .
Пати Великобритания, Вайсман С.М. (1991). «Выделение и молекулярная характеристика кДНК, кодирующей субъединицу 23 кДа человеческой РНК-полимеразы II» . Ж. Биол. Хим . 266 (20): 13468. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98863-0 . ПМИД 2071613 .
Саутгейт С., Зепп М.Л., Грин М.Р. (1990). «Активация транскрипции белком Tat ВИЧ-1, привязанным к зарождающейся РНК через другой белок». Природа . 345 (6276): 640–642. Бибкод : 1990Natur.345..640S . дои : 10.1038/345640a0 . ПМИД 2190099 . S2CID 4233742 .
Пати Великобритания, Вайсман С.М. (1989). «Выделение и молекулярная характеристика кДНК, кодирующей субъединицу РНК-полимеразы II человека массой 23 кДа» . Ж. Биол. Хим . 264 (22): 13114–13121. дои : 10.1016/S0021-9258(18)51603-3 . ПМИД 2753903 .
Ву-Баер Ф., Сигман Д., Гейнор Р.Б. (1995). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (16): 7153–7157. Бибкод : 1995PNAS...92.7153W . дои : 10.1073/pnas.92.16.7153 . ПМК 41297 . ПМИД 7638159 .
Чеонг Дж. Х., Йи М, Лин Ю, Мураками С (1995). «Человеческий RPB5, субъединица, общая для эукариотических ядерных РНК-полимераз, связывает X-белок вируса гепатита B человека и может играть роль в трансактивации X» . ЭМБО Дж . 14 (1): 143–150. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb06984.x . ПМК 398061 . ПМИД 7828586 .
Херрманн Ч., Райс А.П. (1995). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой ТАК, которая гиперфосфорилирует карбоксил-концевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат на роль кофактора Tat» . Дж. Вирол . 69 (3): 1612–1620. дои : 10.1128/jvi.69.3.1612-1620.1995 . ЧВК 188757 . ПМИД 7853496 .
Кин, Нью-Джерси, Гейт М.Дж., Карн Дж. (1996). «Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (6): 2505–2510. Бибкод : 1996PNAS...93.2505K . дои : 10.1073/pnas.93.6.2505 . ПМК 39827 . ПМИД 8637904 .
Ян X, Херрманн CH, Райс А.П. (1996). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и для функционирования требуют карбоксильно-концевого домена РНК-полимеразы II» . Дж. Вирол . 70 (7): 4576–4584. doi : 10.1128/jvi.70.7.4576-4584.1996 . ПМК 190394 . ПМИД 8676484 .
Агостини И., Наварро Дж.М., Рей Ф. и др. (1996). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: сотрудничество со связанными с промотором активаторными доменами и связывание с TFIIB». Дж. Мол. Биол . 261 (5): 599–606. дои : 10.1006/jmbi.1996.0485 . ПМИД 8800208 .
Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1996). «Tat-SF1: кофактор стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–610. Бибкод : 1996Sci...274..605Z . дои : 10.1126/science.274.5287.605 . ПМИД 8849451 . S2CID 13266489 .
Окамото Х., Шелин К.Т., Корден Дж.Л. и др. (1996). «Транс-активация белка Tat вируса иммунодефицита человека требует С-концевого домена РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (21): 11575–11579. Бибкод : 1996PNAS...9311575O . дои : 10.1073/pnas.93.21.11575 . ПМК 38099 . ПМИД 8876177 .
Чун РФ, Жанг КТ (1996). «Требования к карбоксильному домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, Т-клеточного лимфотропного вируса человека I и ВИЧ-1» . Ж. Биол. Хим . 271 (44): 27888–27894. дои : 10.1074/jbc.271.44.27888 . ПМИД 8910388 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000099817 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004667 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8034326-5] Акер Дж., Маттей М.Г., Винтцерит М., Рокель Н., Депетрис Д., Виньерон М., Кедингер С. (август 1994 г.). «Хромосомная локализация генов субъединицы РНК-полимеразы II человека». Геномика . 20 (3): 496–499. дои : 10.1006/geno.1994.1208 . ПМИД 8034326 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: полипептид Е полимеразы (РНК) II (ДНК) POLR2E, 25 кДа» .

[pmid9488465-7] Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делатр О., Тора Л. (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 1489–1497 гг. дои : 10.1128/mcb.18.3.1489 . ISSN 0270-7306 . ПМЦ 108863 . ПМИД 9488465 .

[pmid9201987-8] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Акер Дж., де Грааф М., Чейнель И., Хазак В., Кедингер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека» . Ж. Биол. Хим . 272 (27). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 16815–16821. дои : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9201987 .

[pmid11278533-9] Вэй В., Доржсурен Д., Линь Ю., Цинь В., Номура Т., Хаяши Н., Мураками С. (апрель 2001 г.). «Прямое взаимодействие между субъединицей RAP30 фактора транскрипции IIF (TFIIF) и субъединицей 5 РНК-полимеразы, что способствует ассоциации между TFIIF и РНК-полимеразой II» . Ж. Биол. Хим . 276 (15). США: 12266–12273. дои : 10.1074/jbc.M009634200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11278533 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]