Cops2

Cops2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4D10, 4D18, 4WSN
Идентификаторы
Псевдонимы	COPS2 , Alien, CSN2, SGN2, Trip15, SOP9 SignalOsome Subunit 2
Внешние идентификаторы	Омим : 604508 ; MGI : 1330276 ; Гомологен : 134283 ; GeneCards : Cops2 ; OMA : COPS2 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	49,155,661 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	125,701,059 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	cartilage tissue; ; thoracic diaphragm; ; Achilles tendon; ; parietal pleura; ; gingival epithelium; ; tail of epididymis; ; glutes; ; amniotic fluid; ; corpus epididymis; ; germinal epithelium;
	Top expressed in
	otic placode; ; saccule; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; otic vesicle; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; abdominal wall; ; cumulus cell; ; somite;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; signal transducer activity; transcription corepressor activity;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus; COP9 signalosome; cytoplasm; cytosol;
Biological process	negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; neuron differentiation; cell population proliferation; signal transduction; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; skeletal muscle cell differentiation; transcription-coupled nucleotide-excision repair; neurogenesis; negative regulation of transcription, DNA-templated; protein deneddylation; post-translational protein modification; protein phosphorylation; inner cell mass cell proliferation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9318
	12848
	ENSG00000166200
	Ensmusg00000027206
	P61201
	P61202
	NM_004236 ; NM_001143887
	NM_001285507 ; NM_001285512 ; NM_001285513 ; NM_009939
	NP_001137359 ; NP_004227
	NP_001272436 ; NP_001272441 ; NP_001272442 ; NP_034069
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Комплексная субъединица 2 COP9 - это белок , который у людей кодируется COPS2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Он кодирует субъединицу сигнальной зоны COP9 .

Взаимодействия

Показано, что Cops2 взаимодействует :

Dix1 , ^{[ 8 ]}
IRF8 , ^{[ 9 ]}
Nif3l1 , ^{[ 10 ]} и
THRAЧерез ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000166200 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027206 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (июль 1995 г.). «Два класса белков, зависящих либо от присутствия, либо от отсутствия гормона щитовидной железы для взаимодействия с рецептором гормона щитовидной железы» . Мол Эндокринол . 9 (2): 243–54. doi : 10.1210/mend.9.2.7776974 . PMID 7776974 .
^ Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в трансдукции сигнала, обладающий сходством с 26S -субъединицами протеасом» . Faseb j . 12 (6): 469–78. doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219 . S2CID 25424324 .
^ «Ген Entrez: COPS2 COP9 Конститутивный фотоморфогенный гомолог Субъединица 2 (Arabidopsis)» .
^ Atlcicicek B, Tenbaum SP, Dressel U, Thormeyer D, Renkawitz R, Baniahmad A (март 2000 г.). «Взаимодействие корепрессора инопланетян с DAX-1 отменено мутациями DAX-1, участвующих в подростке гипоплазии надпочечников» . Дж. Биол. Химический 275 (11): 7662–7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7662 . PMID 10713076 .
^ Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Оцчир Д., Крафт Р., Дубиэль В., Леви Бз (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие между интерфероном консенсусной последовательности связывающего белка и субъединицей COP9/сигнала CSN2 (TRIP15). Возможная связь между передачей сигналов регуляторного фактора интерферона и сигнальной передачей COP9/Signalosome» . Дж. Биол. Химический 275 (50): 39081–9. doi : 10.1074/jbc.m004900200 . PMID 10991940 .
^ Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Й., Таканабе Н., Сугияма А., Таширо Ф. (март 2003 г.). «Роль транскрипционного корепрессора NIF3L1 на ранней стадии нейронной дифференцировки посредством сотрудничества с Trip15/CSN2» . Дж. Биол. Химический 278 (12): 10752–62. doi : 10.1074/jbc.m209856200 . PMID 12522100 .
^ Дрессель У, Тормейер Д., Аллицинк Б., Паулулат А., Эггерт М., Шнайдер С., Тенбаум С.П., Ренкавиц Р., Баньахмад А (май 1999). «Чужой, высоко консервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства рецептора ядерного гормона» . Мол Клетка. Биол . 19 (5): 3383–94. doi : 10.1128/mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .

Внешние ссылки

Местоположение генома Human Cops2 и Cops2 страница гена в браузере UCSC Genome .
человека Расположение генома CSN2 и CSN2 страница сведений генов в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (2004). «Сигнал COP9: платформа сборки и технического обслуживания для Ubiquitin Ligases Cullin?». НАТ Клеточная биол . 5 (12): 1029–33. doi : 10.1038/ncb1203-1029 . PMID 14647295 . S2CID 37458780 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, Deng XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется между растениями и млекопитающими и связан с регуляторным комплексом протеасом 26S» . Карт Биол . 8 (16): 919–22. Bibcode : 1998cbio .... 8..919W . doi : 10.1016/s0960-9822 (07) 00372-7 . PMID 9707402 .
Schaefer L, Beermann ML, Miller JB (1999). «Кодирующая последовательность, геномная организация, хромосомная локализация и паттерн экспрессии компонента сигнальной компонента COPS2: гомолог мыши дрозофилы инопланетянина». Геномика . 56 (3): 310–6. doi : 10.1006/Geno.1998.5728 . PMID 10087198 .
Дрессель У, Тормейер Д., Аллицинк Б., Паулулат А., Эггерт М., Шнайдер С., Тенбаум С.П., Ренкавиц Р., Баникмад А. (1999). «Чужой, высоко консервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства рецептора ядерного гормона» . Мол Клетка. Биол . 19 (5): 3383–94. doi : 10.1128/mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .
Науманн М., Бех-Отсир Д., Хуан Х, Феррелл К., Дубиэль В. (2000). «Активация/стабилизация COP9, направленная на сигнал, не зависит от JNK» . Дж. Биол. Химический 274 (50): 35297–300. doi : 10.1074/jbc.274.50.35297 . PMID 10585392 .
Atlicicicek B, Tenbaum SP, Dressel U, Thormeyer D, Renkawitz R, Baniahmad A (2000). «Взаимодействие корепрессора инопланетян с DAX-1 отменено мутациями DAX-1, участвующих в подростке гипоплазии надпочечников» . Дж. Биол. Химический 275 (11): 7662–7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7662 . PMID 10713076 .
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao Gf, Rong R R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Rong R, Ронг Р. , Ye M, Zhou J, Xu Sh, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang Gy, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). «Профилирование экспрессии генов у человеческой гипоталамус-гипофизационной оси и клонирования кДНК в полноразмерной длине» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000pnas ... 97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Оцчир Д., Крафт Р., Дубиэль В., Леви Бз (2001). «Взаимодействие между интерфероном консенсусной последовательности связывающего белка и субъединицей COP9/сигнала CSN2 (TRIP15). Возможная связь между передачей сигналов регуляторного фактора интерферона и сигнальной передачей COP9/Signalosome» . Дж. Биол. Химический 275 (50): 39081–9. doi : 10.1074/jbc.m004900200 . PMID 10991940 .
Tsuge T, Matsui M, Wei N (2001). «Субъединица 1 сигнала COP9 подавляет экспрессию генов через его N-концевой домен и включает в комплекс через домен PCI». J. Mol. Биол . 305 (1): 1–9. doi : 10.1006/jmbi.2000.4288 . PMID 11114242 . S2CID 14434381 .
Bech-otschir D, Kraft R, Huang X, Henklein P, Kapelari B, Pollmann C, Dubiel W (2001). «COP9, специфичная для специфического фосфорилирования, нацеленное на распад P53 с помощью системы убиквитина» . Embo j . 20 (7): 1630–9. doi : 10.1093/emboj/20.7.1630 . PMC 145508 . PMID 11285227 .
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf Da, Wei N, Shevchenko A, Deshaies RJ (2001). «Продвижение конъюгатного расщепления NEDD-CUL1 по сигнале COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. Bibcode : 2001sci ... 292.1382L . doi : 10.1126/science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (2002). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами EIF3, сигнальной сигналом COP9 и протеасомой 26S» . Фебс Летт . 527 (1–3): 15–21. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 03147-2 . PMID 12220626 .
Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Ю., Таканабе Н., Сугияма А., Таширо Ф. (2003). «Роль транскрипционного корепрессора NIF3L1 на ранней стадии нейронной дифференцировки посредством сотрудничества с Trip15/CSN2» . Дж. Биол. Химический 278 (12): 10752–62. doi : 10.1074/jbc.m209856200 . PMID 12522100 .
Serino G, Su H, Peng Z, Tsuge T, Wei N, Gu H, Deng XW (2003). «Характеристика последней субъединицы сигнала Arabidopsis COP9: последствия для общей структуры и происхождения комплекса» . Растительная ячейка . 15 (3): 719–31. doi : 10.1105/tpc.009092 . PMC 150025 . PMID 12615944 .
Уле С., Медали О., Уолдрон Р., Думдей Р., Хенкляйн П., Бех-Отсир Д., Хуан Х, Берсе М., Сперлинг Дж., Шаде Р., Дубиэль В. (2003). «Протеинкиназа CK2 и протеинкиназа D связаны с сигнальной передачей COP9» . Embo j . 22 (6): 1302–12. doi : 10.1093/emboj/cdg127 . PMC 151059 . PMID 12628923 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 15 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000166200 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027206 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7776974-5] Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (июль 1995 г.). «Два класса белков, зависящих либо от присутствия, либо от отсутствия гормона щитовидной железы для взаимодействия с рецептором гормона щитовидной железы» . Мол Эндокринол . 9 (2): 243–54. doi : 10.1210/mend.9.2.7776974 . PMID 7776974 .

[pmid9535219-6] Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, Gordon C, Naumann M, Dubiel W (апрель 1998 г.). «Новый белковый комплекс, участвующий в трансдукции сигнала, обладающий сходством с 26S -субъединицами протеасом» . Faseb j . 12 (6): 469–78. doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219 . S2CID 25424324 .

[entrez-7] «Ген Entrez: COPS2 COP9 Конститутивный фотоморфогенный гомолог Субъединица 2 (Arabidopsis)» .

[pmid10713076-8] Atlcicicek B, Tenbaum SP, Dressel U, Thormeyer D, Renkawitz R, Baniahmad A (март 2000 г.). «Взаимодействие корепрессора инопланетян с DAX-1 отменено мутациями DAX-1, участвующих в подростке гипоплазии надпочечников» . Дж. Биол. Химический 275 (11): 7662–7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7662 . PMID 10713076 .

[pmid10991940-9] Коэн Х., Азриэль А., Коэн Т., Мераро Д., Хашмуэли С., Бех-Оцчир Д., Крафт Р., Дубиэль В., Леви Бз (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие между интерфероном консенсусной последовательности связывающего белка и субъединицей COP9/сигнала CSN2 (TRIP15). Возможная связь между передачей сигналов регуляторного фактора интерферона и сигнальной передачей COP9/Signalosome» . Дж. Биол. Химический 275 (50): 39081–9. doi : 10.1074/jbc.m004900200 . PMID 10991940 .

[pmid12522100-10] Акияма Х., Фудзисава Н., Таширо Й., Таканабе Н., Сугияма А., Таширо Ф. (март 2003 г.). «Роль транскрипционного корепрессора NIF3L1 на ранней стадии нейронной дифференцировки посредством сотрудничества с Trip15/CSN2» . Дж. Биол. Химический 278 (12): 10752–62. doi : 10.1074/jbc.m209856200 . PMID 12522100 .

[pmid10207062-11] Дрессель У, Тормейер Д., Аллицинк Б., Паулулат А., Эггерт М., Шнайдер С., Тенбаум С.П., Ренкавиц Р., Баньахмад А (май 1999). «Чужой, высоко консервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства рецептора ядерного гормона» . Мол Клетка. Биол . 19 (5): 3383–94. doi : 10.1128/mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]