RAD54L
| RAD54L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | Rad54l , Hr54, Rad54a, Hhr54, Hrad54, Rad54-подобные (S. cerevisiae), Rad54, как (S. cerevisiae), Rad54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 603615 ; MGI : 894697 ; Гомологен : 48227 ; GeneCards : Rad54l ; OMA : RAD54L - Ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Репарация ДНК и рекомбинационный белок RAD54-подобный -это белок , который у людей кодируется RAD54L геном . [ 5 ] [ 6 ]
Белок, кодируемый этим геном, принадлежит мертвой суперсемейству геликазы и имеет сходство с Saccharomyces cerevisiae Rad54, белком, который, как известно, участвует в гомологичной рекомбинации и восстановлении ДНК. Было показано, что этот белок играет роль в гомологичной рекомбинации, связанном с репарацией двойных разрывов ДНК. Связывание этого белка с двойной цепью ДНК индуцирует топологическое изменение ДНК, которое, как полагают, облегчает сочетание гомологичной ДНК и стимулирует рекомбинацию ДНК. [ 6 ]
RAD54 является одним из ключевых белков, необходимых для гомологичной рекомбинации и репарации ДНК во многих организмах. Без функционального RAD54 развитие опухоли более вероятно. RAD54 был первоначально описан в почкуенных дрожжах Saccharomyces cerevisiae как член эволюционно консервативной группы эпистаза Rad52 , которая дополнительно включает в себя факторы Rad51, Rad52, Rad55 и Rad57. Считается, что эта группа участвует в событиях рекомбинации ДНК и механизмах восстановления, особенно те, которые включают двухцепочечные разрывы ДНК во время митоза и мейоза . Недавно был обнаружен человеческий гомолог дрожжевого RAD54 и назван HRAD54.
Человеческий ген
[ редактировать ]Человеческий RAD54, или HRAD54, связан с хромосомой 1P32. Он кодирует белок, состоящий из 747 аминокислот, который на 52% идентичен его дрожжевой аналоге. Эти два белка также имеют много функциональных сходств. Кодированный продукт RAD54 является членом семейства белков SWI2/SNF2, члена подсемейства SWI2/SNF2 АТФаз . Эти белковые продукты имеют гомологию в семи консервативных мотивах геликазы. Было показано, что очищенный HRAD54 специфически демонстрирует ДНК-зависимую АТФазу и суперклейки . Транскрипты HRAD54 экспрессируются главным образом в яичке и тимусе, причем более низкие уровни обнаруживаются также в тонком кишечнике, толстой кишке, груди и простате. Мутанты HRAD54 чрезвычайно чувствительны к рентгеновским снимкам, а также метилметаносульфонат (MMS). Эти мутанты, скорее всего, дефектны как в процессах спонтанных, так и в индуцированных процессах митотической рекомбинации.
Функция
[ редактировать ]Взаимодействие между RAD54 и RAD51, еще одним членом группы эпистаза RAD52, у людей опосредовано N-концевым доменом белка HRAD54. Этот N-концевой конец взаимодействует как со свободными, так и со связанными концами белка RAD51. RAD54 перемещается по длине ДНК, производя положительные супер -ловкие майты перед движением белка репликации и отрицательным суперклейным местами, тянущимися к комплексу. Взаимодействие с RAD51 усиливает способность RAD54 выполнять эту суперклейкующую и напряженную активность открытия. Эти белки также работают вместе, чтобы сформировать суставы ДНК, причем RAD54 специфически расширяет суставы и стабилизирует образованные D-петли . Альтернативной функцией RAD54 может быть удаление белков RAD51 после того, как произошло образование суставов и инициация рекомбинации.
Инактивация и восприимчивость к раку
[ редактировать ]Известно, что дефекты RAD51 связаны с развитием опухоли. Обычно RAD51 взаимодействует с белковыми продуктами BRCA1 и BRCA2, чтобы вызвать подавление опухоли. Это приводит к предположению, что другие члены группы Epistasis Rad52, включая RAD54, также важны для развития и подавления опухоли из -за их гомологичных отношений. Участие RAD54 в качестве необходимого рекомбинационного белка подтверждается в обнаружении того, что существуют мутации RAD54 в небольшом проценте изученных карциномов молочной железы и толстой кишки, а также несколько лимфом.
Мейоз
[ редактировать ]Частота спонтанных хромосом разрывов во время мейоза была измерена в сперматоцитах мышей дикого типа и Rad54/Rad54b . мышей [ 7 ] У мышей, нокаутированных на RAD54/RAD54B , частота спонтанной аберрации хромосом , обнаруженная при метафазе 1 мейоза, была более чем в 10 раз выше, чем у мышей дикого типа. Это открытие и дополнительные экспериментальные результаты показали, что белки RAD54/RAD54B играют роль в поддержании стабильного кариотипа во время мейоза мужского пола. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000085999 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000028702 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Kanar R, Troelstra C, Swagemakers SM, Essers J, Smit B, Franssen JH, et al. (Июль 1996 г.). «Гомологи человека и мыши сахар -коревизии РАД54 Ген репарации ДНК: доказательства функционального сохранения» Текущая биология 6 (7): 828–8 Doi : 10.1016/s0960-9822 (02) 00606-1 HDL : 1765/3104 PMID 8805304 2195913S2CID
- ^ Jump up to: а беременный "Entrez Gene: Rad54l Rad54-подобный (S. cerevisiae)" .
- ^ Jump up to: а беременный Руссо А., Кордели Э., Сальвитти Т., Палумбо Е., Пакчиеротти Ф (октябрь 2018 г.). «Дефицит RAD54/RAD54B связан с увеличением поломки хромосом в сперматоцитах мыши » Мутагенез 33 (4): 323–3 Doi : 10.1093/ mutage/ gey0 30204892PMID
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Rasio D, Murakumo Y, Robbins D, Roth T, Silver A, Negrini M, et al. (Июнь 1997 г.). «Характеристика человеческого гомолога RAD54: гена, расположенного на хромосоме 1P32 в области высокой потери гетерозиготности в опухолях молочной железы». РАНКА . 57 (12): 2378–2383. PMID 9192813 .
- Golub EI, Kovalenko OV, Gupta RC, Ward DC, Radding CM (октябрь 1997 г.). «Взаимодействие белков рекомбинации человека RAD51 и RAD54» . Исследование нуклеиновых кислот . 25 (20): 4106–4110. doi : 10.1093/nar/25.20.4106 . PMC 147015 . PMID 9321665 .
- Swagemakers SM, Essers J, De Wit J, Hoeijmakers JH, Kanaar R (октябрь 1998). «Рекомбинационный ДНК-белок RAD54 человека представляет собой двухцепочечную ДНК-зависимую АТФазу» . Журнал биологической химии . 273 (43): 28292–28297. doi : 10.1074/jbc.273.43.28292 . HDL : 1765/8917 . PMID 9774452 .
- Matsuda M, Miyagawa K, Takahashi M, Fukuda T, Kataoka T, Asahara T, et al. (Июнь 1999 г.). «Мутации в гене рекомбинации RAD54 при первичном раке». Онкоген . 18 (22): 3427–3430. doi : 10.1038/sj.onc.1202692 . PMID 10362365 . S2CID 36652599 .
- Карлинг Т., Иманиши Ю., Газ Р.Д., Арнольд А (сентябрь 1999 г.). «Анализ гена RAD54 на хромосоме 1p в качестве потенциального гена-супрессора опухоли при аденомах паращитовидной железы» . Международный журнал рака . 83 (1): 80–82. doi : 10.1002/(SICI) 1097-0215 (19990924) 83: 1 <80 :: AID-IJC15> 3.0.CO; 2-E . PMID 10449612 .
- Ковбой Дж., Руис-Барнезе П., Кусак М.Е., Сараса Дж.Л., Кинг Дж. Анализ в олигодендендроглиомах. Генетика рака и цитогена 116 (2): 142–147. два 10.1016/S0165-4608(99)00122-3: 10640146PMID
- Pluth JM, Fried LM, Kirchgessner CU (март 2001 г.). «Тяжелые комбинированные иммунодефицитные клетки, экспрессирующие мутант HRAD54, демонстрируют заметную репарацию разрыва с двумя целями ДНК и дефект восстановления хромосом». РАНКА . 61 (6): 2649–2655. PMID 11289143 .
- Ristic D, Wyman C, Paulusma C, Kanaar R (июль 2001 г.). «Архитектура комплекса RAD54-ДНК человека предоставляет доказательства транслокации белка вдоль ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (15): 8454–8460. Bibcode : 2001pnas ... 98.8454R . doi : 10.1073/pnas.151056798 . PMC 37457 . PMID 11459989 .
- Рен Б., Кэм Х., Такахаши Ю., Волкерт Т., Террагни Дж., Янг Р.А., Динахт Б.Д. (январь 2002 г.). «E2F интегрирует прогрессирование клеточного цикла с восстановлением, репликацией ДНК и контрольно -пропускными пунктами G (2)/M» . Гены и развитие . 16 (2): 245–256. doi : 10.1101/gad.949802 . PMC 155321 . PMID 11799067 .
- Sigurdsson S, Van Komen S, Petukhova G, Sung P (ноябрь 2002 г.). «Гомологичное спаривание ДНК с помощью факторов рекомбинации человека RAD51 и RAD54» . Журнал биологической химии . 277 (45): 42790–42794. doi : 10.1074/jbc.m208004200 . PMID 12205100 .
- Leone PE, Mendiola M, Alonso J, Paz-Y-Miño C, Pestaña A (март 2003 г.). «Последствия полиморфизма RAD54L (2290C/T) в менингиомах человека в качестве фактора риска и/или генетического маркера» . BMC Рак . 3 : 6. doi : 10.1186/1471-2407-3-6 . PMC 152652 . PMID 12614485 .
- Ким Дж., Брин А.А., Морган XC, Iyer VR (январь 2005 г.). «Картирование взаимодействия ДНК-белок в больших геномах с помощью анализа последовательности тега геномного обогащения». Природные методы . 2 (1): 47–53. doi : 10.1038/nmeth726 . PMID 15782160 . S2CID 6135437 .
- Тома Н.Х. , Чизевский Б.К., Алексев А.А., Мазин А.В., Ковальчековский С.С., Павлич Н.П. (апрель 2005 г.). «Структура домена хроматина SWI2/SNF2-восстановления эукариотического RAD54». Природа структурная и молекулярная биология . 12 (4): 350–356. doi : 10.1038/nsmb919 . PMID 15806108 . S2CID 3226377 .
- Al-Wahiby S, Wong HP, Slijepcevic P (октябрь 2005 г.). «Сокращенные теломеры в мышиных клетках SCID, экспрессирующих мутант HRAD54, совпадают с восстановлением рекомбинации у теломер». Мутационные исследования . 578 (1–2): 134–142. doi : 10.1016/j.mrfmmm.2005.04.008 . PMID 15975611 .
- Bugreev DV, Mazina OM, Mazin AV (август 2006 г.). «Белок RAD54 способствует миграции ветвей в холлидейских соединениях». Природа . 442 (7102): 590–593. Bibcode : 2006natur.442..590b . doi : 10.1038/nature04889 . PMID 16862129 . S2CID 4324847 .
- Акияма К., Юса К., Хасимото Х., Пунепалли А., Ханде М.П., Каказу Н. и др. (Ноябрь 2006 г.). «RAD54 доступен для Alt Tail». Гены к клеткам . 11 (11): 1305–1315. doi : 10.1111/j.1365-2443.2006.01020.x . PMID 17054727 . S2CID 34879148 .