ЛИПЛАЛ1
 Кристаллическая структура человеческого LYPLAL1, код PDB 3u0v . Альфа-спирали показаны красным, бета-цепи — золотом, остатки каталитического центра — черным. | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | Лизофосфолипазоподобный белок 1 | ||
| Пфам | PF02230 | ||
| ИнтерПро | ИПР029058 | ||
| КАТ | 3u0v | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 3у0в / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Лизофосфолипазоподобный 1 — это белок человека, кодируемый геном LYPLAL1 . [ 1 ] Белок представляет собой α/β-гидролазу с неустановленной метаболической функцией. Полногеномные исследования на людях связали этот ген с распределением жира. [ 2 ] и соотношение талии к бедрам . [ 3 ] Ферментативная функция белка неясна. Сообщалось, что LYPLAL1 действует как триглицеридлипаза в жировой ткани. [ 4 ] а другое исследование показало, что этот белок может играть роль в депальмитоилировании калиевых каналов, активируемых кальцием . [ 5 ] Однако LYPLAL1 не депальмитоилирует онкоген Ras. [ 6 ] а структурное и ферментативное исследование пришло к выводу, что LYPLAL1 обычно не способен действовать как липаза и вместо этого представляет собой эстеразу , которая предпочитает короткоцепочечные субстраты, такие как ацетильные группы . [ 7 ] Структурные сравнения показали, что LYPLAL1 может быть протеиндеацетилазой, но это не было экспериментально проверено. [ 8 ]
Связь с ацилпротеинтиоэстеразами
[ редактировать ]Консервация последовательностей и структурная гомология предполагают тесную связь белков LYPLAL1 с ацил-протеинтиоэстеразами , и, следовательно, было высказано предположение, что LYPLAL1 может быть третьей ацил-протеинтиоэстеразой человека. [ 9 ] Однако основное структурное различие между обоими семействами белков было установлено в туннеле связывания гидрофобного субстрата , который был идентифицирован в тиоэстеразах ацил-протеина человека 1 [ 10 ] и 2, [ 11 ] а также у Zea mays ацилпротеинтиоэстераза 2. [ 12 ] В LYPLAL1 этот туннель закрыт из-за другой конформации петли специфичность фермента , изменяя субстратную на короткие ацильные цепи . [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Ген Энтреза: лизофосфолипазоподобный 1» . Проверено 27 февраля 2013 г.
- ^ Бенджамин А.М., Сучиндран С., Пирс К., Роуэлл Дж., Лиен Л.Ф., Гайтон Дж.Р., Маккарти Дж.Дж. (2011). «Взаимодействие генов по полу для оценки ожирения в исследовании сердца во Фрамингеме» . Журнал ожирения . 2011 : 329038. doi : 10.1155/2011/329038 . ПМК 3021872 . ПМИД 21253498 .
- ^ Хайд И.М., Джексон А.У., Рэндалл Дж.К., Винклер Т.В., Ци Л., Стейнторсдоттир В. и др. (ноябрь 2010 г.). «Метаанализ идентифицирует 13 новых локусов, связанных с соотношением талии и бедер, и выявляет половой диморфизм в генетической основе распределения жира» . Природная генетика . 42 (11): 949–60. дои : 10.1038/ng.685 . ПМК 3000924 . ПМИД 20935629 .
- ^ Стейнберг Г.Р., Кемп Б.Е., Ватт М.Дж. (октябрь 2007 г.). «Экспрессия триглицеридлипазы адипоцитов при ожирении у человека». Американский журнал физиологии. Эндокринология и обмен веществ . 293 (4): Е958-64. дои : 10.1152/ajpendo.00235.2007 . ПМИД 17609260 .
- ^ Тиан Л., Макклафферти Х., Кнаус Х.Г., Рут П., Шипстон М.Дж. (апрель 2012 г.). «Различные ацилпротеинтрансферазы и тиоэстеразы контролируют поверхностную экспрессию кальций-активируемых калиевых каналов» . Журнал биологической химии . 287 (18): 14718–25. дои : 10.1074/jbc.M111.335547 . ПМК 3340283 . ПМИД 22399288 .
- ^ Гёрмер К., Бюргер М., Круйцер Й.А., Веттер И., Вартак Н., Брунсвельд Л., Бастиенс П.И., Лискамп Р.М., Триола Г., Вальдманн Х. (май 2012 г.). «Химико-биологическое исследование возможностей техники рас-де- и репальмитоилирования». ХимБиоХим . 13 (7): 1017–23. дои : 10.1002/cbic.201200078 . ПМИД 22488913 . S2CID 37748152 .
- ^ Jump up to: а б Бюргер М., Циммерманн Т.Дж., Кондо Й., Стеге П., Ватанабэ Н., Осада Х., Вальдманн Х., Веттер И.Р. (январь 2012 г.). «Кристаллическая структура предсказанной фосфолипазы LYPLAL1 обнаруживает неожиданную функциональную пластичность, несмотря на близкое родство с ацилпротеинтиоэстеразами» . Журнал исследований липидов . 53 (1): 43–50. дои : 10.1194/jlr.M019851 . ПМЦ 3243480 . ПМИД 22052940 .
- ^ Бюргер М., Чори Дж. (2018). «Структурная и химическая биология деацетилаз углеводов, белков, малых молекул и гистонов» . Коммуникационная биология . 1 : 217. дои : 10.1038/s42003-018-0214-4 . ПМК 6281622 . ПМИД 30534609 .
- ^ Зейдман Р., Джексон К.С., Маги А.И. (январь 2009 г.). «Протеинацилтиоэстеразы (обзор)». Молекулярная мембранная биология . 26 (1): 32–41. дои : 10.1080/09687680802629329 . hdl : 10044/1/1452 . ПМИД 19115143 . S2CID 10591154 .
- ^ Деведжиев Ю., Даутер З., Кузнецов С.Р., Джонс Т.Л., Деревенда З.С. (ноябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура ацилпротеинтиоэстеразы I человека на основе одного набора рентгеновских данных до 1,5 А» . Структура . 8 (11): 1137–46. дои : 10.1016/s0969-2126(00)00529-3 . ПМИД 11080636 .
- ^ Вон С.Дж., Давда Д., Лабби К.Дж., Хван С.Ю., Прайсер Р., Маджмудар Дж.Д., Армакост К.А., Родригес Л.А., Родригес К.Л., Чонг Ф.С., Тороссян К.А., Палакурти Дж., Хур Э.С., Мигер Дж.Л., Брукс К.Л., Стаки Дж.А., Мартин Б.Р. (декабрь 2016 г.). «Молекулярный механизм изоформ-селективного ингибирования ацилпротеинтиоэстераз 1 и 2 (APT1 и APT2)» . АКС Химическая биология . 11 (12): 3374–3382. doi : 10.1021/acschembio.6b00720 . ПМЦ 5359770 . ПМИД 27748579 .
- ^ Бюргер М., Виллиге БК, Чори Дж. (декабрь 2017 г.). «Механизм гидрофобного якоря определяет семейство деацетилаз, которое подавляет реакцию хозяина на эффекторы YopJ» . Природные коммуникации . 8 (1): 2201. Бибкод : 2017NatCo...8.2201B . дои : 10.1038/s41467-017-02347-w . ПМЦ 5736716 . ПМИД 29259199 .