ГАЗ5
ГАЗ5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | GAS5 , NCRNA00030, SNHG2, специфичный для остановки роста 5 (небелковое кодирование) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 608280 ; Генные карты : GAS5 ; ОМА : GAS5 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Специфичная для остановки роста 5 представляет собой небелково-кодирующую РНК , которая у человека кодируется геном GAS5 . [ 3 ] [ 4 ]
GAS5 Некодирующая РНК , которая накапливается в клетках с остановкой роста, действует как элемент гормонального ответа- ловушки для глюкокортикоидного рецептора (GR) и, следовательно, блокирует усиление экспрессии генов активированным GR. [ 5 ] [ 6 ]
Ряд исследований связал GAS5 с апоптозом , и он может играть роль в прогрессировании некоторых типов рака . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Интроны GAS5 содержат несколько мякРНК последовательностей , включая SNORD81 , SNORD47 , SNORD80 , SNORD79 , SNORD78 , SNORD44 , SNORD77 , SNORD76 , SNORD75 и SNORD74 . [ 4 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Эти интронные последовательности более консервативны, чем экзоны гена-хозяина, такие гены часто называют «генами наизнанку». [ 13 ]
Недавно было обнаружено, что нонсенс-опосредованный путь деградации может регулировать функцию GAS5 в клетках млекопитающих. [ 14 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000234741 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ген Энтрез: специфичный для остановки роста 5 (небелковое кодирование)» .
- ^ Jump up to: а б Смит К.М., Стейц Дж.А. (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с множеством малых ядрышковых РНК (snoRNA) и члена семейства генов 5'-концевых олигопиримидинов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897–6909. дои : 10.1128/mcb.18.12.6897 . ПМК 109273 . ПМИД 9819378 .
- ^ Кино Т., Хёрт Д.Э., Ичидзё Т., Надер Н., Хрусос Г.П. (2010). «Некодирующая РНК Gas5 является репрессором глюкокортикоидного рецептора, связанным с остановкой роста и голоданием» . Научный сигнал . 3 (107): ра8. дои : 10.1126/scisignal.2000568 . ПМК 2819218 . ПМИД 20124551 .
- ^ Гарабедян М.Ю., Логан С.К. (2010). «Приманка, связывающая ДНК глюкокортикоидного рецептора, представляет собой газ». Научный сигнал . 3 (108): пе5. дои : 10.1126/scisignal.3108pe5 . ПМИД 20145207 . S2CID 21089519 .
- ^ Муртада-Маарабуни М., Пикард М.Р., Хедж В.Л., Фарзане Ф., Уильямс Г.Т. (2009). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз, и его активность снижается при раке молочной железы». Онкоген . 28 (2): 195–208. дои : 10.1038/onc.2008.373 . ПМИД 18836484 . S2CID 9209496 .
- ^ Накамура Ю, Такахаши Н, Какегава Э, Ёсида К, Ито Ю, Каяно Х, Ниицу Н, Джиннай И, Бесшо М (2008). «Ген GAS5 (транскрипт 5, специфичный для остановки роста) сливается с BCL6 в результате t(1;3)(q25;q27) у пациента с B-клеточной лимфомой». Рак Генета Цитогенет . 182 (2): 144–9. doi : 10.1016/j.cancergencyto.2008.01.013 . ПМИД 18406879 .
- ^ Муртада-Маарабуни М., Хедж В.Л., Киркхэм Л., Фарзане Ф., Уильямс Г.Т. (2008). «Задержка роста Т-клеток человека контролируется некодирующим транскриптом 5, специфичным для задержки роста РНК (GAS5)». J Cell Sci . 121 (Часть 7): 939–46. дои : 10.1242/jcs.024646 . ПМИД 18354083 . S2CID 218512 .
- ^ Танака Р., Сато Х., Морияма М., Сато К., Моришита Й., Ёсида С., Ватанабэ Т., Накамура Й., Мори С. (2000). «Ген хозяина интронной малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50, не имеющий потенциала кодирования белка, картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) B-клеточной лимфомы человека» . Генные клетки . 5 (4): 277–87. дои : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . ПМИД 10792466 .
- ^ Рахо Дж., Бароне В., Росси Д., Филипсон Л., Соррентино В. (2000). «Ген газа 5 демонстрирует четыре альтернативных паттерна сплайсинга, не кодируя белок». Джин . 256 (1–2): 13–7. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00363-2 . ПМИД 11054530 .
- ^ Хиросе Т., Стейц Дж. А. (2001). «Положение внутри интрона хозяина имеет решающее значение для эффективного процессинга мякРНК бокса C/D в клетках млекопитающих» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (23): 12914–9. Бибкод : 2001PNAS...9812914H . дои : 10.1073/pnas.231490998 . ПМК 60799 . ПМИД 11606788 .
- ^ Эдди С.Р. (1999). «Некодирующие РНК-гены». Текущее мнение в области генетики и развития . 9 (6): 695–9. дои : 10.1016/S0959-437X(99)00022-2 . ПМИД 10607607 .
- ^ Тани Х, Торимура М, Акимицу Н (2013). «Путь деградации РНК регулирует функцию GAS5, некодирующей РНК в клетках млекопитающих» . ПЛОС ОДИН . 8 (1): e556884. Бибкод : 2013PLoSO...855684T . дои : 10.1371/journal.pone.0055684 . ПМЦ 3559549 . ПМИД 23383264 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .