Малая ядрышковая РНК snR60/Z15/Z230/Z193/J17
Малая ядрышковая РНК snR60/Z15/Z230/Z193/J17 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snosnR60_Z15 | |
Идентификаторы | |
Символ | сноснР60_Z15 |
Альт. Символы | сноЗ193 |
Рфам | RF00309 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК snR60 представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК. мякРНК snR60 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] мякРНК snR60 была первоначально обнаружена с помощью компьютерного скрининга генома Saccharomyces cerevisiae , [ 2 ] последующие экспериментальные скрининги обнаружили растительные гомологи Z15, Z230, Z193 и J17. [ 3 ] и человек U80/SNORD80.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Лоу Т.М., Эдди С.Р. (февраль 1999 г.). «Вычислительный скрининг мякРНК, направляющих метилирование, в дрожжах». Наука . 283 (5405): 1168–71. Бибкод : 1999Sci...283.1168L . дои : 10.1126/science.283.5405.1168 . ПМИД 10024243 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (май 2003 г.). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .