Малая ядрышковая РНК SNORD95
Малая ядрышковая РНК SNORD95 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD95 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД95 |
Альт. Символы | U95 |
Рфам | RF00189 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U95 (также известная как SNORD95 или Z38 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U95 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U95 был идентифицирован путем компьютерного скрининга интронов генов рибосомальных белков на предмет консервативных мотивов последовательности C/D-бокса и экспрессии, экспериментально подтвержденной нозерн-блоттингом . [ 2 ] Предполагается, что U95 управляет метилированием 2'O-рибозы остатков 28S рибосомальной РНК (рРНК) A2802 и C2811. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Jump up to: а б Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Бачеллери Дж.П., Хюттенхофер А., Кавайе Дж. (ноябрь 2003 г.). «Идентификация 13 новых направляющих РНК для модификации человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (22): 6543–51. дои : 10.1093/nar/gkg849 . ПМК 275545 . ПМИД 14602913 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]