Малая ядрышковая РНК TBR17
| Малая ядрышковая РНК TBR17 | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и консервативность последовательности snoTBR17 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | сноТБР17 |
| Рфам | RF00294 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК TBR17 представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), идентифицированную у Trypanosoma brucei , которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК TBR17 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
TBR17 был одной из семнадцати мякРНК, идентифицированных у Trypanosoma brucei методом иммунопреципитации с антителами против фибрилларина. [ 2 ] Вместе с TBR5 и TBR7 он входит в состав тандемно повторяющегося кластера генов мякРНК, расположенного внутри сплайсированной лидерной РНК (SLA). [ 3 ] Кластерные гены продуцируются в виде полицистронных РНК. [ 4 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Данбар Д.А., Уормсли С., Лоу Т.М., Басерга С.Дж. (2000). «Связанные с фибрилларином малые ядрышковые РНК бокса C/D у Trypanosoma brucei. Сохранение последовательности и значение метилирования 2'-O-рибозы рРНК» . Ж. Биол. Хим . 275 (19): 14767–14776. дои : 10.1074/jbc.M001180200 . ПМИД 10747997 .
- ^ Робертс, Т.Г.; Штурм, Северная Каролина; Да, БК; Ю, MC; Хартшорн, Т.; Агабян Н.; Кэмпбелл, Д.А. (август 1998 г.). «Три небольшие ядрышковые РНК, идентифицированные из сплайсированного локуса РНК, связанного с лидером, у кинетопластидных простейших» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (8): 4409–4417. дои : 10.1128/mcb.18.8.4409 . ISSN 0270-7306 . ПМК 109026 . ПМИД 9671450 .
- ^ Данбар, округ Колумбия; Чен, А.А.; Уормсли, С.; Басерга, С.Дж. (1 августа 2000 г.). «Гены малых ядрышковых РНК у Trypanosoma brucei организованы в кластеры и транскрибируются как полицистронная РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (15): 2855–2861. дои : 10.1093/нар/28.15.2855 . ISSN 1362-4962 . ПМК 102681 . ПМИД 10908346 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |