Малая ядрышковая РНК SNORD32
Малая ядрышковая РНК SNORD32 | |
---|---|
![]() | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД32 |
Рфам | RF00219 |
Другие данные | |
РНК Тип | Ген; мяРНК; гид; CD-бокс; |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U32 (также известная как SNORD32 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U32 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U32 кодируется в интроне 2 гена рибосомального белка L13 у человека и мыши. [ 2 ] и, как предполагается, управляет метилированием 2'O-рибозы как остатка 18S рибосомальной РНК (рРНК) G1328, так и остатка 28S рРНК A1511. [ 2 ] [ 3 ] U32A имеет один и тот же ген-хозяин с мякРНК C/D-бокса U33, U34 и U35A (RPL13A). [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Перейти обратно: а б Николосо, М; Цюй ЛХ; Мишо Б; Холостяк JP (1996). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Дж Мол Биол . 260 (2): 178–195. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Перейти обратно: а б Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Дополнение 1: Проблема с базой данных): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]