Малая ядрышковая РНК SNORD88
| Малая ядрышковая РНК SNORD88 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD88 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ШНУР88 |
| Рфам | RF00604 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORD88 (также известная как HBII-180) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
SNORD88 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства C/D-боксов участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] Эта мякРНК является человеческим ортологом мышиной мякРНК MBII-180. [ 2 ] SNORD88 также родственен мышиной мякРНК MBII-211. Предполагается, что SNORD88 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 28S рибосомальной РНК (рРНК) C3680. [ 3 ]
Есть свидетельства того, что SNORD88 расщепляется на более мелкие фрагменты аналогично микроРНК и может подавлять экспрессию белка. [ 4 ] [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–2953. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Оно М., Ямада К., Аволио Ф., Скотт М.С., ван Конингсбрюгген С., Бартон Г.Дж., Ламонд А.И. (май 2010 г.). «Анализ малых ядрышковых РНК человека (мякРНК) и разработка модулятора мякРНК векторов экспрессии генов» . Молекулярная биология клетки . 21 (9): 1569–1584. дои : 10.1091/mbc.E10-01-0078 . ПМК 2861615 . ПМИД 20219969 .
- ^ Оно М., Скотт М.С., Ямада К., Аволио Ф., Бартон Г.Дж., Ламонд А.И. (май 2011 г.). «Идентификация предшественников микроРНК человека, которые напоминают мяРНК бокса C/D» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (9): 3879–3891. дои : 10.1093/нар/gkq1355 . ПМК 3089480 . ПМИД 21247878 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |