Малая ядрышковая РНК SNORD43
| Малая ядрышковая РНК SNORD43 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD43 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД43 |
| Альт. Символы | U43 |
| Рфам | RF00221 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U43 (также известная как SNORD43 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U43 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U43 кодируется в интроне 1 гена рибосомального белка L3 у человека и коровы. [ 2 ] Три другие мякРНК (U82, U83a и U83b) также кодируются тем же геном хозяина, но из разных интронов. [ 2 ] Гомолог Arabidopsis thaliana в общедоступных базах данных последовательностей (Genbank) называется snoR41. Гомолог риса экспрессируется из кластера, также содержащего snoR16. [ 3 ]
Предполагается, что U43 управляет метилированием остатков 2'-O-рибозы на 18S рибосомальной РНК. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Jump up to: а б Дуга С., Ассельта Р., Малковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (февраль 2000 г.). «Ген рибосомального белка L3, содержащий интрон (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1490 (3): 225–36. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00237-7 . ПМИД 10684968 .
- ^ Jump up to: а б Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (май 2003 г.). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |