Малая ядрышковая РНК SNORD58
Малая ядрышковая РНК SNORD58 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD58 | |
Идентификаторы | |
Символ | ШНУР58 |
Альт. Символы | U58 |
Рфам | RF00151 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U58 (также известная как SNORD58 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U57 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
В геноме человека есть две близкородственные копии U85 (называемые U58A и U58B). Оба они кодируются в интронах гена рибосомального белка RPL17. Предполагается, что обе мякРНК направляют метилирование 2'O-рибозы большой субъединицы 28S рибосомальной РНК (рРНК) по остатку G4198. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кисс-Ласло З., Генри Ю., Бачеллери Ж.П., Кайзерг-Феррер М., Кисс Т. (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК» . Клетка . 85 (7): 1077–88. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . ПМИД 8674114 . S2CID 10418885 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD58 в Rfam
- Запись для SNORD58A на snoRNABase
- Запись для SNORD58B на snoRNABase