Малая ядрышковая РНК SNORD87
Малая ядрышковая РНК SNORD87 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD87 | |
Идентификаторы | |
Символ | ШНУР87 |
Альт. Символы | U87 |
Рфам | RF00439 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORD87 ( также известный как U87 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Модифицирующая РНК этого типа обычно расположена в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U87 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] [ 2 ]
U87 был идентифицирован путем очистки от дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae ). [ 3 ] и является ортологом мышиного MBII-276. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Маленькие ядрышковые РНК: обширная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями» . Клетка . 109 (2): 145–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00718-3 . ПМИД 12007400 . S2CID 8968788 .
- ^ Гоголевская И.К., Макарова Ю.А., Гаузе Л.Н., Куличкова В.А., Константинова И.М., Крамеров Д.А. (июнь 2002 г.). «РНК U87, новая малая ядрышковая РНК C/D-бокса из клеток млекопитающих». Джин . 292 (1–2): 199–204. CiteSeerX 10.1.1.510.4087 . дои : 10.1016/S0378-1119(02)00678-9 . ПМИД 12119114 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]