Малая ядрышковая РНК SNORA65
Малая ядрышковая РНК SNORA65 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORA65 | |
Идентификаторы | |
Символ | SNORA65 |
Альт. Символы | U65 |
Рфам | RF00302 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; H/ACA-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000594 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORA65 (также известный как U65) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки , которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют «направляющей РНК».
U65 первоначально был клонирован из HeLa. клеток [ 1 ] и принадлежит к классу мякРНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост» и имеет консервативные мотивы H/ACA-бокса. [ 2 ] Предполагается, что мякРНК U65 управляет псевдоуридилированием остатков U4373 и U4427 28S рибосомальной РНК (рРНК). [ 3 ] Псевдоуридилирование — это изомеризация нуклеозида уридина в псевдоуридин (Ψ). U65 родственен мякРНК MBII-351, идентифицированной у мышей. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гано П., Кайзерг-Феррер М., Кисс Т. (апрель 1997 г.). «Семейство малых ядрышковых РНК бокса ACA определяется эволюционно консервативной вторичной структурой и повсеместными элементами последовательности, необходимыми для накопления РНК» . Гены и развитие . 11 (7): 941–56. дои : 10.1101/gad.11.7.941 . ПМИД 9106664 .
- ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Маленькие ядрышковые РНК: обширная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями» . Клетка . 109 (2): 145–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00718-3 . ПМИД 12007400 . S2CID 8968788 .
- ^ Запись для U65 на snoRNABase.
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]