Растение малой ядрышковой РНК snoR9
Малая ядрышковая РНК snoR9 | |
---|---|
![]() | |
Идентификаторы | |
Символ | snoR9_plant |
Рфам | RF00348 |
Другие данные | |
РНК Тип | Ген; мяРНК; гид; CD-бокс; |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии snoR9 представляет собой некодирующую РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют «направляющей РНК».
R9 является членом класса C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
Эта растительная мякРНК была идентифицирована у Arabidopsis thaliana посредством компьютерного скрининга и экспериментально подтверждена с помощью анализа удлинения праймера. [ 2 ] Эта мякРНК не родственна мякРНК, идентифицированной у гипертермофилов, также называемой snoR9 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Барнеш Ф., Гаспин С., Гайо Р., Эчеверрия М. (2001). «Идентификация 66-боксовых мякРНК C/D у Arabidopsis thaliana : обширные дупликации генов привели к образованию множества изоформ, предсказывающих новые сайты 2'-O-метилирования рибосомальной РНК». Дж. Мол. Биол . 311 (1): 57–73. дои : 10.1006/jmbi.2001.4851 . ПМИД 11469857 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]