Малая ядрышковая РНК R38
Малая ядрышковая РНК R38 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snoR38 | |
Идентификаторы | |
Символ | сноР38 |
Рфам | RF00213 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК R38 представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК. мякРНК R38 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] мякРНК R38 была идентифицирована у человека, дрожжей, [ 2 ] Арабидопсис Талиана [ 3 ] и Ориза сатива . [ 4 ] мякРНК R38 управляет метилированием сайтов 2'-О-рибозы в 28S рРНК .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Bachellerie JP, Мишо Б, Николозо М, Балакин А, Ни Дж, Фурнье МЖ (1995). «Антисмысловые мякРНК: семейство ядрышковых РНК с длинной комплементарностью рРНК». Тенденции биохимии. Наука . 20 (7): 261–4. дои : 10.1016/S0968-0004(00)89039-8 . PMID 7667877 .
- ^ Цюй Л.Х., Мэн Ц., Чжоу Х. и др. (2001). «Идентификация 10 новых кластеров генов мякРНК из Arabidopsis thaliana» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (7): 1623–30. дои : 10.1093/нар/29.7.1623 . ПМК 31268 . ПМИД 11266566 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (2003). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК R38 в Rfam
- Страница мякРНК дрожжей для малой ядрышковой РНК R38
- Страница SGD для малой ядрышковой РНК R38
- Страница snoRNABase для snR38A человека