Малая ядрышковая РНК SNORD82
| Малая ядрышковая РНК SNORD82 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD82 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ШНУР82 |
| Альт. Символы | U82 |
| Рфам | RF00158 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U82 (также известная как SNORD82 или Z25 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U82/Z25 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
мякРНК U82 была идентифицирована как у людей, так и у мышей: [ 2 ] он расположен в пятом интроне гена нуклеолина у обоих видов . Две дополнительные мякРНК (мякРНК U20 C/D-бокса и мякРНК H/ACA U23) также кодируются в интронах гена нуклеолина. [ 3 ]
Предполагается, что U82 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 18S рибосомальной РНК (рРНК) A1678. [ 3 ]
Другая, другая мякРНК, названная U82, была предсказана в интронах гена рибосомального белка L3 (RPL3) у людей и коров. [ 4 ] Однако экспрессию этой мякРНК не удалось подтвердить с помощью нозерн-блоттинга или полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), и ее не следует путать с этой мякРНК, расположенной в гене нуклеолина.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Ребане А, Метспалу А (сентябрь 1999 г.). «U82, новая мякРНК, идентифицированная из пятого интрона гена нуклеолина человека и мыши». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1446 (3): 426–30. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00093-7 . ПМИД 10524220 .
- ^ Jump up to: а б Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Дуга С., Ассельта Р., Малковати М., Тенчини М.Л., Рончи С., Симоник Т. (февраль 2000 г.). «Ген рибосомального белка L3, содержащий интрон (RPL3): анализ последовательности и идентификация U43 и двух новых интронных малых ядрышковых РНК». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1490 (3): 225–36. дои : 10.1016/S0167-4781(99)00237-7 . ПМИД 10684968 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |