Малая ядрышковая РНК SNORD46
| Малая ядрышковая РНК SNORD46 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD46 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД46 |
| Альт. Символы | U40 |
| Рфам | RF00218 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U46 (также известная как SNORD46 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U46 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U46 кодируется в интроне 2 гена рибосомального белка S8 у человека и, как предполагается, управляет метилированием остатков 2'-О-рибозы на 28S рибосомальной РНК (рРНК). [ 2 ] [ 3 ] Гомолог этой мякРНК у Arabidopsis thaliana называется snoZ153. [ 4 ] Некоторые последовательности человеческого U40 были помечены в базах данных последовательностей (Genbank) как U46.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Николозо М., Цюй Л.Х., Мишо Б., Bachellerie JP (июль 1996 г.). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Журнал молекулярной биологии . 260 (2): 178–95. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Чен CL, Лян Д., Чжоу Х., Чжо М., Чен Ю., Цюй Л.Х. (май 2003 г.). «Высокое разнообразие мякРНК у растений: идентификация и сравнительное исследование 120 генов мякРНК Oryza sativa» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (10): 2601–13. дои : 10.1093/нар/gkg373 . ПМК 156054 . ПМИД 12736310 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |