Малый ядрышковый SNORD12/SNORD106
| Малый ядрышковый SNORD12/SNORD106 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD12 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД12 |
| Альт. Символы | СНОРД106; сноHBII-99 |
| Рфам | RF00581 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малые ядрышковые РНК SNORD106 и SNORD12 (также известные как U106 и HBII-99 соответственно) представляют собой две родственные мякРНК, которые принадлежат к классу C/D малых ядрышковых РНК (мякРНК). Оба содержат консервативные мотивы последовательности бокса C (UGAUGA) и D (CUGA). [ 1 ]
Человеческий SNORD12 (HBII-99) является гомологом мышиной мякРНК MBII-99. У человека мякРНК HB11-99 и U106 имеют один и тот же ген-хозяин. [ 2 ] [ 3 ]
Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. Предполагается, что HBII-99 управляет метилированием 2'O-рибозы 28S рРНК G3878. [ 4 ] U106 содержит консервативные антисмысловые элементы, которые позволяют предсказать, что U106 метилирует остатки G1536 и U1602 18S рРНК . [ 5 ] Однако эти мишени, по-видимому, не метилированы, и U106 может функционировать как шаперон РНК во время сворачивания рРНК. [ 2 ] Аналогичная роль была предложена для мякРНК H/ACA U17a и U17b. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Бачеллери Дж.П., Хюттенхофер А., Кавайе Дж. (ноябрь 2003 г.). «Идентификация 13 новых направляющих РНК для модификации человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 31 (22): 6543–51. дои : 10.1093/nar/gkg849 . ПМК 275545 . ПМИД 14602913 .
- ^ Jump up to: а б с Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Аскариан-Амири М.Э., Кроуфорд Дж., Френч Дж.Д., Смарт CE, Смит М.А., Кларк М.Б., Ру К., Мерсер Т.Р., Томпсон Э.Р., Лакхани С.Р., Варгас AC, Кэмпбелл И.Г., Браун М.А., Динджер М.Э., Мэттик Дж.С. (май 2011 г.) . «РНК-хозяин SNORD Zfas1 является регулятором развития молочной железы и потенциальным маркером рака молочной железы» . РНК . 17 (5): 878–91. дои : 10.1261/rna.2528811 . ПМК 3078737 . ПМИД 21460236 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
- ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Маленькие ядрышковые РНК: обширная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями» . Клетка . 109 (2): 145–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00718-3 . ПМИД 12007400 . S2CID 8968788 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |