Малая ядрышковая РНК R41
| Малая ядрышковая РНК R41 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snoR41 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | сноР41 |
| Рфам | RF00205 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК R41 (также известная как snoR41 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), идентифицированную в растениях, которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
snoR41 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
snoR41 был идентифицирован в результате компьютерного скрининга генома риса Oryza sativa и, как ожидается, будет действовать как проводник метилирования для 18S и 25S рибосомальных РНК (рРНК). snoR41 в рисе альтернативно назывался snoZ154 и snoZ231. Сообщается, что сайт метилирования 18S гомологичен сайту, на который нацелен U62 у людей, но, по-видимому, между двумя мякРНК имеется небольшое сходство последовательностей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК R41 в Rfam
- Страница малой ядрышковой РНК SNORD62 в Rfam
- база данных мякРНК растений
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |