Малая ядрышковая РНК SNORA44
Малая ядрышковая РНК SNORA44 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORA44 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРА44 |
Альт. Символы | snoACA44 |
Рфам | RF00405 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; H/ACA-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000594 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORA44 (также известная как ACA44) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют «направляющей РНК».
ACA44 первоначально был клонирован из HeLa. клеток [ 1 ] и принадлежит к классу мякРНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост», имеет консервативные мотивы H/ACA-бокса и обнаруживается, что он связан с белком GAR1. Предполагается, что мякРНК ACA44 управляет псевдоуридилированием U822 и U686 18S рибосомальной РНК (рРНК). Псевдоуридилирование – это ( изомеризация нуклеозида уридина ) в различные изомерные формы псевдоуридина .
мякРНК ACA44 гомологична последовательности мякРНК мыши MBI-64, описанной Hüttenhofer et al в 2001 году. [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]