Малая ядрышковая РНК SNORD15
| Малая ядрышковая РНК SNORD15 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности SNORD15 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД15 |
| Альт. Символы | U15 |
| Рфам | RF00067 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0005730 ПОЙДИТЕ: 0006396 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORD15 ( также известный как U15 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации малых ядерных РНК (мяРНК, также тип нкРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
U15 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'- O -метилированием субстратных РНК. [ 1 ] Предполагается, что U15 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 28S рибосомальной РНК (рРНК) A3764. [ 2 ] [ 3 ]
У человека существуют две близкородственные копии мякРНК U15 (называемые SNORD15A и SNORD15B). Оба они кодируются в интронах рибосомального белка S3 . [ 4 ] У Xenopus laevis он расположен в интронах рибосомного белка S1. [ 5 ]
snoR75 из Arabidopsis thaliana [ 6 ] а гомологи в рисе Oryza sativa и других растениях также известны как U15 и, несмотря на значительно более короткую длину последовательности, по-видимому, родственны. [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кисс-Ласло З., Генри Ю., Бачеллери ЖП, Кайзерг-Феррер М., Кисс Т. (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК» . Клетка . 85 (7): 1077–88. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . ПМИД 8674114 . S2CID 10418885 .
- ^ Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Дополнение 1: Проблема с базой данных): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Тыковски К.Т., Шу, доктор медицинских наук, Стейц Дж.А. (1993). «Маленькая ядрышковая РНК процессируется из интрона человеческого гена, кодирующего рибосомальный белок S3» . Генс Дев . 7 (7А): 1176–90. дои : 10.1101/gad.7.7a.1176 . ПМИД 8319909 .
- ^ Пеллиццони Л., Крозио С., Кампиони Н., Лорени Ф., Пьерандрей-Амальди П. (1994). «Различные формы мякРНК U15 кодируются в интронах гена рибосомального белка S1 Xenopus laevis» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (22): 4607–13. дои : 10.1093/нар/22.22.4607 . ПМК 308507 . ПМИД 7984408 .
- ^ Барнеш Ф., Гаспин С., Гайо Р., Эчеверрия М. (2001). «Идентификация 66-боксовых мякРНК C/D у Arabidopsis thaliana: обширные дупликации генов привели к образованию множества изоформ, предсказывающих новые сайты 2'-O-метилирования рибосомальной РНК». Дж. Мол. Биол . 311 (1): 57–73. дои : 10.1006/jmbi.2001.4851 . ПМИД 11469857 .
- ^ Браун Дж.В., Эчеверрия М., Цюй Л.Х. и др. (2003). «База данных мякРНК растений» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (1): 432–5. дои : 10.1093/нар/gkg009 . ПМК 165456 . ПМИД 12520043 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD15 в Rfam
- Запись для SNORD15A на snorBase
- Запись для SNORD15B на snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |