Малая ядрышковая РНК SNORA77
Малая ядрышковая РНК SNORA77 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORA77 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРА77 |
Рфам | RF00599 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; H/ACA-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000594 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORA77 (также известная как ACA63) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мяРНК).
SNORA77 был идентифицирован с помощью компьютерного скрининга, и его экспрессия у мышей экспериментально подтверждена с помощью нозерн-блоттинга и анализа удлинения праймера. [ 1 ] Он принадлежит к классу мякРНК H/ACA-бокса , поскольку имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост» и консервативные мотивы H/ACA-бокса. [ 2 ]
Предполагается, что SNORA77 управляет псевдоуридилированием остатка 18S рибосомальной РНК (рРНК) U814. [ 3 ] Псевдоуридилирование — это изомеризация нуклеозида уридина в другую изомерную форму псевдоуридина .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу Т.М. (январь 2006 г.). «Вычислительный скрининг направляющих псевдоуридилирования РНК H/ACA млекопитающих» . РНК . 12 (1): 15–25. дои : 10.1261/rna.2210406 . ПМЦ 1370881 . ПМИД 16373490 .
- ^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]