Малая ядрышковая РНК SNORA73
Малая ядрышковая РНК семейства SNORA73 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORA73 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРА73 |
Альт. Символы | U17 |
Рфам | RF00045 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; HACA-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000594 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORA73 (также называемая РНК U17/E1 ) принадлежит к классу малых ядрышковых РНК H/ACA (snoRNA). У позвоночных U17 кодируется интроном и имеет длину от 200 до 230 нуклеотидов , что длиннее, чем у большинства мякРНК. Это одна из наиболее распространенных мякРНК в клетках человека , которая необходима для расщепления пре- рРНК внутри 5'-внешнего транскрибируемого спейсера (ETS). [ 1 ] Это расщепление приводит к образованию 18S рРНК. Области РНК U17 комплементарны рРНК и действуют как направляющие для взаимодействий РНК/РНК, хотя эти области, по-видимому, не очень хорошо консервативны между организмами. [ 2 ]
Имеются данные о том, что SNORA73 (изоформы: SNORA73A и SNORA73B) действует как регулятор функции хроматина. [ 3 ] SNORA73 представляет собой хроматин-ассоциированную РНК (каРНК), стабильно связанную с хроматином. [ 4 ] Примечательно, что SNORA73 может связываться с PARP1, что приводит к активации его функции ADPRylation (PAR). [ 5 ] SNORA73 взаимодействует с ДНК-связывающим доменом PARP1. Кроме того, PARP1-активируемый PARP1 ADPRилирует DDX21 в клетках, способствуя клеточной пролиферации. [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Энрайт К.А., Максвелл Э.С., Элисейри Г.Л., Солнер-Уэбб Б. (ноябрь 1996 г.). «Процессинг 5'ETS рРНК обеспечивается четырьмя малыми РНК: U14, E3, U17 и U3» . РНК . 2 (11): 1094–9. ПМЦ 1369439 . ПМИД 8903340 .
- ^ Сервелли М., Чеккони Ф., Джорджи М., Аннези Ф., Оливерио М., Мариоттини П. (февраль 2002 г.). «Сравнительный анализ структуры малой ядрышковой РНК U17 позвоночных (мяРНК)». Журнал молекулярной эволюции . 54 (2): 166–79. Бибкод : 2002JMolE..54..166C . дои : 10.1007/s00239-001-0065-2 . ПМИД 11821910 . S2CID 9424738 .
- ^ Шуберт, Т; Пуш, MC; Дирмайер, С; Бенеш, В; Креммер, Э; Имхоф, А; Самый длинный, G (9 ноября 2012 г.). «Белок Df31 и мякРНК поддерживают доступные структуры хроматина высшего порядка» . Молекулярная клетка . 48 (3): 434–44. doi : 10.1016/j.molcel.2012.08.021 . ПМИД 23022379 .
- ^ Шуберт, Т; Пуш, MC; Дирмайер, С; Бенеш, В; Креммер, Э; Имхоф, А; Самый длинный, G (9 ноября 2012 г.). «Белок Df31 и мякРНК поддерживают доступные структуры хроматина высшего порядка» . Молекулярная клетка . 48 (3): 434–44. doi : 10.1016/j.molcel.2012.08.021 . ПМИД 23022379 .
- ^ Ким, Д.С.; Камачо, резюме; Нагари, А; Маллади, В.С.; Чалла, С; Краус, В.Л. (19 сентября 2019 г.). «Активация PARP-1 мякРНК контролирует биогенез рибосом и рост клеток с помощью РНК-хеликазы DDX21» . Молекулярная клетка . 75 (6): 1270–1285.e14. doi : 10.1016/j.molcel.2019.06.020 . ПМК 6754283 . ПМИД 31351877 .
- ^ Ким, Д.С.; Камачо, резюме; Нагари, А; Маллади, В.С.; Чалла, С; Краус, В.Л. (19 сентября 2019 г.). «Активация PARP-1 мякРНК контролирует биогенез рибосом и рост клеток с помощью РНК-хеликазы DDX21» . Молекулярная клетка . 75 (6): 1270–1285.e14. doi : 10.1016/j.molcel.2019.06.020 . ПМК 6754283 . ПМИД 31351877 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]