Pyrococcus C/D box Малая ядрышковая РНК
| Малая ядрышковая РНК Pyrococcus C/D box | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности snoPyro_CD | |
| Идентификаторы | |
| Символ | snoPyro_CD |
| Альт. Символы | CD_sno_Pyro |
| Рфам | RF00095 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Архея |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая Pyrococcus ядрышковая РНК C/D представляет собой некодирующей РНК молекулы (нкРНК), идентифицированные у архей рода Pyrococcus , которые участвуют в модификации рибосомальной РНК (рРНК) и транспортной РНК (тРНК). Модифицирующая РНК этого типа обычно расположена в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза рибосомальной РНК и мяРНК, но в клетках архей нет соответствующей видимой структуры. Эта группа нкРНК известна как малые ядрышковые РНК (snoRNA), а также часто упоминается как направляющие РНК, поскольку они направляют ассоциированные белковые ферменты на добавление модификации к конкретным нуклеотидам в РНК-мишенях. РНК C/D-бокса направляют добавление метильной группы (-CH 3 ) к положению 2'-O в основной цепи РНК.
Компьютерный скрининг геномов архей выявил мяРНК C/D-бокса в ряде геномов. [ 1 ] В частности, было идентифицировано 46 малых РНК, консервативных в геномах трех гипертермофильных видов Pyrococcus . [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Омер А.Д., Лоу Т.М., Рассел А.Г., Эбхардт Х., Эдди С.Р., Деннис П.П. (2000). «Гомологи малых ядрышковых РНК у архей» (PDF) . Наука . 288 (5465): 517–22. Бибкод : 2000Sci...288..517O . дои : 10.1126/science.288.5465.517 . ПМИД 10775111 . S2CID 15552500 . Архивировано из оригинала (PDF) 02 января 2020 г.
- ^ Гаспин С., Кавайе Дж., Эраузо Дж., Бачеллери Дж. П. (2000). «Архейные гомологи метилирования эукариот управляют малыми ядрышковыми РНК: уроки геномов Pyrococcus». Дж. Мол. Биол . 297 (4): 895–906. дои : 10.1006/jmbi.2000.3593 . ПМИД 10736225 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |