Малая ядрышковая РНК SNORD102
| Малая ядрышковая РНК SNORD102 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD102 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД102 |
| Альт. Символы | U102 |
| Рфам | RF00187 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U102 (также известная как SNORD102 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U102 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U102 был идентифицирован путем компьютерного скрининга интронов генов рибосомальных белков на предмет консервативных мотивов последовательности C/D-бокса и экспрессии, экспериментально подтвержденной с помощью нозерн-блоттинга . [ 2 ] Он находится во втором интроне гена рибосомального белка L21. мякоРНК ACA27 H/ACA-бокса обнаружена в том же гене-хозяине в другом интроне. [ 3 ]
Предполагается, что U102 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 28S рибосомальной РНК (рРНК) G4020. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Бачеллери Дж.П., Хюттенхофер А., Кавайе Дж. (2003). «Идентификация 13 новых направляющих РНК для модификации человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (22): 6543–51. дои : 10.1093/nar/gkg849 . ПМК 275545 . ПМИД 14602913 .
- ^ Jump up to: а б Лестрейд, Лоран; Вебер, Мишель Дж. (2006). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Дополнение 1: Проблема с базой данных): D158–D162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |