Малая ядрышковая РНК SNORD50
| Малая ядрышковая РНК SNORD50 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD50 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД50 |
| Альт. Символы | U50 |
| Рфам | RF00278 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U50 (также известная как SNORD50 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U50 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] [ 2 ]
U50 представляет собой интронный ген мякоРНК, расположенный на хромосоме 6q15, в точке разрыва хромосомной транслокации t(3;6)(q27;q15). Ген U50HG состоит из шести экзонов , сплайсированные транскрипты которых имеют небольшой потенциал для кодирования белка, а его интроны продуцируют как U50, так и U50-подобные (U50') мякРНК, локализованные в ядрышках. [ 3 ] Имеются данные о том, что паралоги U50 образуют новое семейство генов, контролирующих онкогенез и чувствительность к терапии рака. [ 4 ] [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кисс-Ласло, З; Генри Ю; Холостяк JP; Кайзерг-Феррер М; Поцелуй Т (1996). «Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК» . Клетка . 85 (7): 1077–1088. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . ПМИД 8674114 . S2CID 10418885 .
- ^ Танака, Р; Сато Х; Морияма М; Сато К; Моришита Ю; Ёсида С; Ватанабэ Т; Накамура Ю; Мори С (2000). «Ген хозяина интронной малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50, не имеющий потенциала кодирования белка, картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) B-клеточной лимфомы человека» . Генные клетки . 5 (4): 277–287. дои : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . ПМИД 10792466 .
- ^ Муртада-Маарабуни М., Пикард М.Р., Хедж В.Л., Фарзане Ф., Уильямс Г.Т. (октябрь 2008 г.). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз, и его активность снижается при раке молочной железы» . Онкоген . 28 (2): 195–208. дои : 10.1038/onc.2008.373 . ПМИД 18836484 .
- ^ Донг XY, Го П., Бойд Дж. и др. (август 2009 г.). «Влияние мякРНК U50 на рак молочной железы человека» . Дж Генет Геномикс . 36 (8): 447–54. дои : 10.1016/S1673-8527(08)60134-4 . ПМЦ 2854654 . ПМИД 19683667 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD50 в Rfam
- Запись на SNORD50 на snorBase
- Запись для SNORD50B на snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |