Малая ядрышковая РНК SNORD75
Малая ядрышковая РНК SNORD75 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD75 | |
Идентификаторы | |
Символ | ШНУР75 |
Рфам | RF00612 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК SNORD75 (также известная как U75 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК .
U75 (SNORD75) принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы C (UGAUGA) и D (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] Мышиная мякРНК Z19 ортологична человеческому U75. Предполагается, что U75 управляет метилированием 2'-O-рибозы остатка 28S рибосомальной РНК (рРНК) C4032. [ 2 ] У людей U75 имеет один и тот же некодирующий белок ген хозяина (gas5) с 9 другими мякРНК ( U44 , U47 , U74, U76, U77 , U78 , U79 , U80 и U81 ). [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158–162. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Смит К.М., Стейц Дж.А. (декабрь 1998 г.). «Классификация gas5 как гена-хозяина с множеством малых ядрышковых РНК (snoRNA) и члена семейства 5'-концевых олигопиримидиновых генов выявляет общие черты генов-хозяев snoRNA» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6897–6909. дои : 10.1128/mcb.18.12.6897 . ПМК 109273 . ПМИД 9819378 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]