Малая ядрышковая РНК snR48
Малая ядрышковая РНК snR48 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и консервативность последовательности snosnR48 | |
Идентификаторы | |
Символ | snosnR48 |
Рфам | RF00471 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0005730 ПОЙДИТЕ: 0006396 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК snR48 представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
snR48 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ] [ 2 ]
snR48 был идентифицирован у дрожжей ( Saccharomyces cerevisiae ) путем компьютерного скрининга дрожжевого генома. Предполагается, что эта мякРНК управляет метилированием 2'O-рибозы остатков 28S рибосомальной РНК (рРНК) Gm2788 и Gm2790. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Маленькие ядрышковые РНК: обширная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями» . Клетка . 109 (2): 145–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00718-3 . ПМИД 12007400 . S2CID 8968788 .
- ^ Лоу Т.М., Эдди С.Р. (февраль 1999 г.). «Вычислительный скрининг мякРНК, направляющих метилирование, в дрожжах». Наука . 283 (5405): 1168–71. Бибкод : 1999Sci...283.1168L . дои : 10.1126/science.283.5405.1168 . ПМИД 10024243 .