Малая ядрышковая РНК SNORD62
Малая ядрышковая РНК SNORD62 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD62 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД62 |
Альт. Символы | U62 |
Рфам | RF00153 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U62 (также известная как SNORD62 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U62 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
В геноме человека есть две идентичные копии мякоРНК U62 (называемые U62A и U62B), обе из которых расположены в интронах одного и того же гена-хозяина, кодирующего гипотетический белок (KIAA0515). [ 2 ] Предполагается, что U62 управляет метилированием 2'O-рибозы остатка 18S рибосомальной РНК (рРНК) A590. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Тыковски К.Т., Смит К.М., Шу М.Д., Стейц Дж.А. (декабрь 1996 г.). «Небольшая потребность в ядрышковой РНК для сайт-специфического рибозного метилирования рРНК у Xenopus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (25): 14480–5. Бибкод : 1996PNAS...9314480T . дои : 10.1073/pnas.93.25.14480 . ПМК 26158 . ПМИД 8962077 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD62 в Rfam
- Запись для SNORD62A на snoRNABase
- Запись для SNORD62B на snoRNABase