Малая ядрышковая РНК семейства Z195/SNORD33
| Семейство малых ядрышковых РНК Z195/SNORD33/SNORD32 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD33 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД33 |
| Альт. Символы | сноЗ195 |
| Рфам | RF00133 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии малая ядрышковая РНК Z195/SNORD33 (также известная как U33) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК Z195/SNORD33 принадлежит к классу мякРНК C/D-бокса , которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
Растительная мякРНК Z195 была идентифицирована при скрининге Arabidopsis thaliana . [ 2 ]
Эксперимент, в котором изучались 22 различные ткани немелкоклеточного рака легких , показал, что SNORD33, SNORD66 и SNORD76 сверхэкспрессируются по сравнению с соответствующими нераковыми тканями легких. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Маркер С, Земанн А, Терхёрст Т, Кифманн М, Кастенмайер Дж. П., Грин П., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж., Хюттенхофер А (декабрь 2002 г.). «Экспериментальная Рномика: идентификация 140 кандидатов на малые непосредственные РНК в растении Arabidopsis thaliana» . Современная биология . 12 (23): 2002–13. дои : 10.1016/S0960-9822(02)01304-0 . ПМИД 12477388 . S2CID 18112420 .
- ^ Ляо Дж., Ю Л., Мэй Ю., Гуарнера М., Шен Дж., Ли Р., Лю З., Цзян Ф. (июль 2010 г.). «Маленькие ядрышковые РНК как биомаркеры немелкоклеточного рака легких» . Молекулярный рак . 9 :198. дои : 10.1186/1476-4598-9-198 . ПМК 2919450 . ПМИД 20663213 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |