Малая ядрышковая РНК SNORD42
| Малая ядрышковая РНК SNORD42 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD42 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ШНУР42 |
| Альт. Символы | U42 |
| Рфам | RF00150 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U42 (также известная как SNORD42 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в модификации других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U42 принадлежит к классу C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O-метилированием субстратных РНК. [ 1 ] [ 2 ]
В геноме человека есть две близкородственные копии U42 (называемые U42A и U42B), обе расположены в интронах гена рибосомного белка L23a (RPL23a). Предполагается, что обе мякРНК управляют сайт-специфическим 2'O-рибозным метилированием остатка 18S рибосомальной РНК (рРНК) U116. [ 3 ] мышиный ортолог (MBII-287). Также был идентифицирован [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди С., Фатика А., Бачи А., Скалони А., Пресутти С., Боццони I (октябрь 2002 г.). «Очищенные боксерские C/D-snoRNP способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–8. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Поцелуй Т (апрель 2002 г.). «Маленькие ядрышковые РНК: обширная группа некодирующих РНК с разнообразными клеточными функциями» . Клетка . 109 (2): 145–8. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00718-3 . ПМИД 12007400 . S2CID 8968788 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD42 в Rfam
- Запись для SNORD42A на сайте snoRNABase
- Запись для SNORD42B на snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |