Малая ядрышковая РНК SNORD36
| Малая ядрышковая РНК SNORD36 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD36 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД36 |
| Альт. Символы | U36 |
| Рфам | RF00049 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК U36 (также известная как SNORD36) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), которая участвует в биогенезе (модификации) других малых ядерных РНК (мяРНК). Этот тип модифицирующей РНК расположен в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. Она известна как малая ядрышковая РНК (мякРНК), а также ее часто называют направляющей РНК.
мякРНК U36 является членом класса C/D-бокса мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности, известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
U36 кодируется в интроне рибосомного белка rpL7a и имеет две области комплементарности 18S и 28S рибосомальной РНК. Эта комплементарность предполагает, что U36 действует как проводник метилирования 2'-О-рибозы. [ 2 ] [ 3 ] Эта мякРНК также родственна другим мякРНК (snoR47 и Z100), выявленным у растения риса Oryza sativa . [ 3 ] [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Николозо М., Цюй Л.Х., Мишо Б., Бачеллери Дж.П. (1996). «Кодируемые интронами антисмысловые малые ядрышковые РНК: характеристика девяти новых видов указывает на их прямую роль в качестве проводников 2'-О-рибозо-метилирования рРНК». Дж. Мол. Биол . 260 (2): 178–95. дои : 10.1006/jmbi.1996.0391 . ПМИД 8764399 .
- ^ Jump up to: а б Гилли Дж., Фрид М. (1998). «Эволюция мякРНК U24 и U36, кодируемых в интронах гомологов гена rpL7a позвоночных: уникальные особенности вариантов U36 млекопитающих». ДНК Клеточная Биол . 17 (7): 591–602. дои : 10.1089/dna.1998.17.591 . ПМИД 9703018 .
- ^ Лян Д., Чжоу Х., Чжан П. и др. (2002). «Новая организация генов: интронные кластеры генов мякРНК из Oryza sativa» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (14): 3262–72. дои : 10.1093/нар/gkf426 . ПМК 135747 . ПМИД 12136108 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD36 в Rfam
- Запись для SNORD36A на сайте snoRNABase
- Запись для SNORD36B на snoRNABase
- Запись для SNORD36C на snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |