Малая ядрышковая РНК SNORD90
Малая ядрышковая РНК SNORD90 | |
---|---|
![]() Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD90 | |
Идентификаторы | |
Символ | СНОРД90 |
Альт. Символы | сноHBII-295 |
Рфам | RF00579 |
Другие данные | |
РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; C/D-бокс |
Домен(ы) | Эукариоты |
ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
ТАК | ТАК: 0000593 |
PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мякРНК SNORD90 (HBII-295) представляет собой некодирующую РНК , принадлежащую к семейству C/D мякРНК . Первоначально описан как HBII-295. [ 1 ] Эта РНК теперь получила обозначение SNORD70 Комитетом по номенклатуре генов HUGO. Это человеческий ортолог мышиного MBII-295, для которого не установлена идентифицированная РНК- мишень. [ 2 ] Эта РНК экспрессируется из интрона гена MNAB/OR1K1.
Имеются доказательства того, что SNORD90 участвует в проведении модификаций N6-метиладенозина (m6A) в транскриптах РНК-мишени. [ 3 ] В частности, было показано, что SNORD90 увеличивает уровни m6A в нейрегулин 3 (NRG3), что приводит к его снижению за счет распознавания YTHDF2 . [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Хюттенхофер А., Кифманн М., Мейер-Эверт С., О'Брайен Дж., Лерах Х., Бачеллери Дж. П., Брозиус Дж. (июнь 2001 г.). «RNomics: экспериментальный подход, который идентифицирует 201 кандидата на новые небольшие несвязные РНК у мышей» . Журнал ЭМБО . 20 (11): 2943–53. дои : 10.1093/emboj/20.11.2943 . ПМК 125495 . ПМИД 11387227 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
- ^ Jump up to: а б Линь, Рисин; Кос, Арон; Лопес, Хуан Пабло; Обедайте, Жюльен; Фиори, Лаура М; Ян, Дженни; Бен-Эфраим, Яир; Ауабед, Захия; Ибрагим, Паскаль; Мицухаси, Харука; Вонг, Так Пан; Ибрагим, Эль Шериф; Бельзунг, Кэтрин; Блиер, Пьер; Фарзан, Фаранак (11 июля 2023 г.). Уэст, Энн Э; Вонг, Ма-Ли (ред.). «SNORD90 индуцирует глутаматергическую передачу сигналов после лечения моноаминергическими антидепрессантами» . электронная жизнь . 12 : е85316. doi : 10.7554/eLife.85316 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 10335830 . ПМИД 37432876 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORD90 в Rfam
- Запись о HBII-295 на сайте snoRNABase
- Запись в базе данных HGNC [ постоянная мертвая ссылка ]