Малая ядрышковая РНК SNORA2
| Малые ядрышковые РНК семейства SNORA2/SNORA34 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORA2 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРА2 |
| Альт. Символы | snoACA2 |
| Рфам | RF00410 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; HACA-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000594 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORA2 ( также известный как ACA2 ) представляет собой некодирующую РНК (нкРНК), которая модифицирует другие малые ядерные РНК (мяРНК). Это член H/ACA класса малых ядрышковых РНК , которые направляют сайты модификации уридинов в псевдоуридины . [ 1 ]
Первоначально ACA2 был клонирован из клеток HeLa путем ассоциации с белком GAR1 . Он имеет предсказанную структуру «шпилька-петля-шпилька-хвост» и имеет консервативные мотивы H/ACA-box. Первоначально были идентифицированы два варианта последовательности ACA2 (названные ACA2a и ACA2b). Оба варианта примерно на 66% идентичны последовательности другой мякРНК, охарактеризованной в том же исследовании, под названием ACA34 (также известной как SNORA34). Обнаружено, что в геноме человека все три мякРНК (ACA2a, ACA2b и ACA34) расположены в интронах одного и того же гена . Этот ген кодирует предполагаемый белок, называемый FLJ20436. [ 1 ]
Оба варианта ACA2 имеют одни и те же два предполагаемых сайта-мишени (U4263 и U4282) в 28S рибосомальной РНК (рРНК). Предполагается также, что ACA34 будет нацелен на один из этих сайтов (U4282) в дополнение к U4269 28S рРНК. [ 1 ] [ 2 ] Сходство последовательностей, геномное расположение и предсказанные сайты-мишени этих трех мякРНК позволяют предположить, что они были созданы в результате последующих дупликаций генов в ходе эволюции. [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .
- ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). «snoRNA-LBME-db, полная база данных мякРНК H/ACA и C/D-бокса человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D158-62. CiteSeerX 10.1.1.105.7552 . дои : 10.1093/нар/gkj002 . ПМЦ 1347365 . ПМИД 16381836 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница малой ядрышковой РНК SNORA2 в Rfam
- Запись для ACA34 на snorBase
- Запись для ACAA2a на snorNABase
- Запись для ACA32b на snoRNABase
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |