Малая ядрышковая РНК SNORD115
| Малая ядрышковая РНК SNORD115 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD115 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | СНОРД115 |
| Альт. Символы | сноHBII-52; ГБII-52 |
| Рфам | RF00105 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Джин ; мяРНК ; мякРНК ; CD-бокс |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0006396 ПОЙДИТЕ: 0005730 |
| ТАК | ТАК: 0000593 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии SNORD115 ( также известный как HBII-52 ) представляет собой молекулу некодирующей РНК (нкРНК), известную как малая ядрышковая РНК , которая обычно участвует в модификации других некодирующих РНК . Этот тип модифицирующей РНК обычно локализуется в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза мяРНК. HBII-52 относится к гену человека, тогда как RBII-52 используется для обозначения гена крысы, а MBII-52 используется для обозначения гена мыши.
HBII-52 принадлежит к классу C/D-боксов мякРНК, которые содержат мотивы консервативной последовательности , известные как C-бокс (UGAUGA) и D-бокс (CUGA). Большинство членов семейства box C/D участвуют в управлении сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. [ 1 ]
В геноме человека HBII-52 кодируется в тандемно повторяющемся массиве с другой мяРНК C/D-бокса, HBII-85 (SNORD116) , в синдрома Прадера-Вилли области (PWS) хромосомы 15 . [ 2 ] Однако микроделеция в одном семействе кластера мноРНК HBII-52 исключила его из роли в развитии заболевания. [ 3 ] HBII-52 обнаружен в 47 тандемных, почти идентичных копиях на хромосоме человека 15q11-13. Этот локус импринтируется по материнской линии, а это означает, что транскрибируется только отцовская копия локуса. HBII-52 экспрессируется исключительно в головном мозге, но отсутствует у пациентов с СПВ. HBII-52 не имеет какой-либо существенной комплементарности с рибосомальными РНК , но имеет 18- нуклеотидную область консервативной комплементарности мРНК рецептора серотонина 2C . [ 4 ] Рецептор серотонина 2C также экспрессируется в мозге. Было показано, что эта мякРНК, вероятно, связывается с молчащим элементом экзона Vb, увеличивая его включение и продукцию функциональной сплайс-формы рецептора серотонина 2C.
Хромосомный локус, содержащий кластер генов SNORD115, дублируется у многих людей с аутичными чертами . [ 5 ] [ 6 ] Модель мыши, созданная с дублированием кластера SNORD115, демонстрирует поведение, подобное аутизму. [ 7 ]
Имеются доказательства того, что укороченная форма MBII-52 (SNORD115, обнаруженная у мышей) регулирует альтернативный сплайсинг белков, кодирующих гены DPM2 , TAF1 , RALGPS1 , PBRM1 и CRHR1 . [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные мяРНП Box C/D способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663–6668. дои : 10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002 . ПМК 134041 . ПМИД 12215523 .
- ^ Кавайе Дж., Бьютинг К., Кифманн М. и др. (2000). «Идентификация специфичных для мозга и импринтированных генов малых ядрышковых РНК, демонстрирующих необычную геномную организацию» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (26): 14311–6. Бибкод : 2000PNAS...9714311C . дои : 10.1073/pnas.250426397 . ЧВК 18915 . ПМИД 11106375 .
- ^ Рунте М., Варон Р., Хорн Д., Хорстемке Б., Буйтинг К. (2005). «Исключение кластера генов мякоРНК C/D-бокса HBII-52 из его основной роли в синдроме Прадера-Вилли». Хум Жене . 116 (3): 228–30. дои : 10.1007/s00439-004-1219-2 . ПМИД 15565282 . S2CID 23190709 .
- ^ Кишор С., Стамм С. (январь 2006 г.). «МякоРНК HBII-52 регулирует альтернативный сплайсинг рецептора серотонина 2C» . Наука . 311 (5758): 230–2. Бибкод : 2006Sci...311..230K . дои : 10.1126/science.1118265 . ПМИД 16357227 . S2CID 44527461 .
- ^ Болтон П.Ф., Вельтман М.В., Вейсблатт Э. и др. (сентябрь 2004 г.). «Хромосомные аномалии 15q11-13 и другие заболевания у людей с расстройствами аутистического спектра». Психиатр. Жене . 14 (3): 131–7. дои : 10.1097/00041444-200409000-00002 . ПМИД 15318025 . S2CID 37344935 .
- ^ Кук Э.Х., Шерер С.В. (октябрь 2008 г.). «Вариации числа копий, связанные с нервно-психическими состояниями». Природа . 455 (7215): 919–23. Бибкод : 2008Natur.455..919C . дои : 10.1038/nature07458 . ПМИД 18923514 . S2CID 4377899 .
- ^ Накатани Дж., Тамада К., Хатанака Ф. и др. (июнь 2009 г.). «Аномальное поведение на мышиной модели, созданной с помощью хромосомной инженерии, для дупликации человеческого 15q11-13, наблюдаемой при аутизме» . Клетка . 137 (7): 1235–46. дои : 10.1016/j.cell.2009.04.024 . ПМК 3710970 . ПМИД 19563756 .
- ^ Кишор С., Ханна А., Чжан З., Хуэй Дж., Балвирц П.Дж., Стефан М., Бич С., Николлс Р.Д., Заволан М., Стамм С. (2010). «МноРНК MBII-52 (SNORD 115) процессируется в более мелкие РНК и регулирует альтернативный сплайсинг» . Хум Мол Жене . 19 (7): 1153–64. дои : 10.1093/hmg/ddp585 . ПМЦ 2838533 . ПМИД 20053671 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]