ТАФ1

ТАФ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1EQF, 3AAD, 3UV4, 3UV5, 4RGW, 4YYM, 4YYN, 5I29, 5I1Q, 5FUR
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF1 , BA2R, CCG1, CCGS, DYT3, DYT3/KAT4, N-NSCL2, OF, P250, TAF(II)250, TAF2A, TAFII-250, TAFII250, XDP, MRXS33, фактор 1, связывающий белок TATA-бокса
Внешние идентификаторы	Опустить : 313650 ; МГИ : 1336878 ; Гомологен : 37942 ; Генные карты : TAF1 ; ОМА : TAF1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	71,532,374 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	100,645,395 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; Achilles tendon; ; epithelium of colon; ; urethra; ; tonsil; ; left ovary; ; lactiferous duct; ; pericardium; ; corpus callosum; ; body of uterus;
	Top expressed in
	hand; ; neural layer of retina; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; Gonadal ridge; ; Rostral migratory stream; ; ventricular zone; ; maxillary prominence; ; ventral tegmental area; ; tail of embryo; ; arcuate nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; DNA binding; transcription coactivator activity; p53 binding; transcription factor binding; protein binding; lysine-acetylated histone binding; TBP-class protein binding; acyltransferase activity; ATP binding; protein serine/threonine kinase activity; histone acetyltransferase activity; kinase activity; protein heterodimerization activity; H3K27me3 modified histone binding; ubiquitin conjugating enzyme activity; acetyl-CoA binding; sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Cellular component	nucleoplasm; MLL1 complex; nucleus; nucleolus; transcription regulator complex; transcription factor TFIID complex;
Biological process	phosphorylation; RNA polymerase II preinitiation complex assembly; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; transcription, DNA-templated; peptidyl-serine phosphorylation; DNA-templated transcription, initiation; protein autophosphorylation; cell cycle; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; peptidyl-threonine phosphorylation; positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of signal transduction by p53 class mediator; viral process; histone acetylation; protein polyubiquitination; protein phosphorylation; cellular response to DNA damage stimulus; negative regulation of gene expression; midbrain development; positive regulation of protein binding; cellular response to UV; transcription factor catabolic process; protein stabilization; regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; cellular response to ATP; regulation of cell cycle G1/S phase transition; negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding; negative regulation of protein autoubiquitination; negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; positive regulation of androgen receptor activity; positive regulation of transcription by RNA polymerase I; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6872
	270627
	ENSG00000147133
	ENSMUSG00000031314
	P21675
	Q80UV9
	НМ_001286074 ; НМ_004606 ; НМ_138923
	НМ_001081008 ; НМ_001290729
	НП_001273003 ; НП_004597 ; НП_620278
	НП_001277658 ; НП_001392888 ; НП_001392889 ; НП_001392890 ; НП_001392891
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор инициации транскрипции, субъединица 1 TFIID , также известный как субъединица фактора инициации транскрипции TFIID 250 кДа (TAFII-250) или TBP-ассоциированный фактор 250 кДа (p250), представляет собой белок , который у людей кодируется TAF1 геном . ^[5]^[6]

Функция

Для инициации транскрипции РНК -полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белок, который координирует эти действия, представляет собой базальный фактор транскрипции TFIID , который связывается с основным промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит основой для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из ТАТА-связывающего белка ( TBP ) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами , функционировать в распознавании промотора или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF), чтобы облегчить сборку комплекса и инициацию транскрипции. Этот ген кодирует самую большую субъединицу TFIID. Эта субъединица связывается с последовательностями основного промотора, охватывающими сайт начала транскрипции. Он также связывается с активаторами и другими регуляторами транскрипции, и эти взаимодействия влияют на скорость инициации транскрипции. Эта субъединица содержит две независимые протеинкиназные домены на N- и C-концах, но также обладает ацетилтрансферазной активностью и может действовать как убиквитин -активирующий/конъюгирующий фермент. Для этого гена идентифицированы два транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^[5]Гистоны часто ацетилируются, открывая ДНК для транскрипции. TAF1 содержит два бромодомена, каждый из которых может связывать один из двух остатков ацетиллизина в положениях 5 и 12 хвоста H4, чтобы стабилизировать бокс-комплекс TBP-TATA.

Клиническое значение

Была идентифицирована мутация в TAF1, которая способствует фенотипу с тяжелой умственной отсталостью (ID), характерной межъягодичной складкой и характерными чертами лица, включая широкий, вздернутый нос, обвисшие щеки, наклоненные вниз глазные щели, выраженные периорбитальные гребни, глубокие морщины. посаженные глаза, относительный гипертелоризм, тонкая верхняя губа, высокое небо, оттопыренные уши с утолщенными завитками, заостренный подбородок. ^[7]^[8] Это несинонимичное изменение в TAF1, которое приводит к замене изолейцина (гидрофобного) на треонин (полярный) 1337-го аминокислотного остатка в белке (NP_001273003.1). Две другие мутации были зарегистрированы в TAF1 в двух семьях с умственной отсталостью, хотя дальнейшие клинические подробности не сообщались. ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что TAF1 взаимодействует с:

См. также

Транскрипционный фактор II D

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147133 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031314 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TAF1 TAF1 РНК-полимераза II, фактор, связанный с белком TATA-бокса (TBP), 250 кДа» .
^ Секигути Т., Ёсида М.К., Секигути М., Нишимото Т. (апрель 1987 г.). «Выделение человеческого гена, связанного с Х-хромосомой, необходимого для перехода от фазы G1 к фазе S клеточного цикла». Эксп. Сотовый Res . 169 (2): 395–407. дои : 10.1016/0014-4827(87)90200-X . ПМИД 3556424 .
^ Хе М, Персон Т.Н., Хеббринг С.Дж., Хайнцен Э., Йе З., Шроди С.Дж., Макферсон Э.В., Лин С.М., Пейссиг П.Л., Бриллиант М.Х., О'Рэйв Дж., Робисон Р.Дж., Лайон Г.Дж., Ван К. (январь 2015 г.). «SeqHBase: набор инструментов для работы с большими данными для анализа данных семейного секвенирования» . Журнал медицинской генетики . 52 (4): 282–8. doi : 10.1136/jmedgenet-2014-102907 . ПМЦ 4382803 . ПМИД 25587064 .
^ О'Рэйве Дж.А., Ву Й., Дорфель М.Дж., Роуп А.Ф., Ау П.И., Парбузингх Дж.С., Мун С., Куси М., Косма К., Смит К.С., Цетис М., Шютте Дж.Л., Хуфнагель Р.Б., Прада CE, Мартинес Ф., Орельяна К., Крейн Дж., Каро-Ллопис А., Олтра С., Монфорт С., Хименес-Баррон Л.Т., Свенсен Дж., Эллингвуд С., Смит Р., Фанг Х., Оспина С., Стегманн С., Ден Холландер Н., Миттельман Д., Хайнам Дж., Робисон Р., Ян Э, Фавр Л, Руберти А, Ривьер ЖБ, Монаган К.Г., Ван К., Дэвис Э.Э., Кацанис Н., Калшойер В.М., Ван Э.Х., Меткалф К., Клифстра Т., Иннес А.М., Кициу-Цели С., Розелло М., Киган С.Э., Лион Дж.Дж. (2015). «Вариант TAF1 связан с новым синдромом с тяжелой умственной отсталостью и характерными дисморфическими особенностями» . Американский журнал генетики человека . 97 (6): 922–932. дои : 10.1016/j.ajhg.2015.11.005 . ПМЦ 4678794 . ПМИД 26637982 .
^ Ху Х, Хаас С.А., Челли Дж., Ван Эш Х., Рейно М., де Брауэр А.П., Вайнерт С., Фройен Г., Фринц С.Г., Лаумонье Ф., Земойтель Т., Лав Ми., Ричард Х., Эмде А.К., Бьенек М., Йенсен С., Хэмброк М, Фишер Ю, Ланник С, Фельдкамп М, Виссинк-Линдхаут В, Лебрен Н, Кастельно Л, Руччи Дж, Монжан Р, Дорсей О, Биллюарт П, Стульманн Т, Шоу М, Корбетт М.А., Гарднер А, Уиллис-Оуэн С, Тан С, Френд К.Л., Белет С., ван Роозендаль К.Е., Хименес-Поке М., Мойар М.П., Ронсе Н., Сан Р., О'Киф С., Ченна Р., ван Бёммель А., Гёке Дж., Хакетт А., Филд М., Кристи Л., Бойл Дж., Хаан Э., Нельсон Дж., Тернер Дж., Байнам Дж., Гиллессен-Кесбах Г., Мюллер У., Стейнбергер Д., Бадни Б., Бадура-Стронка М., Латос-Беленьска А., Усагер Л.Б., Викер П., Родригес Криадо. Г, Бондесон МЛ, Аннерен Г, Дюфке А, Коэн М, Ван Малдергем Л, Винсент-Делорм С, Эшенн Б, Саймон-Буи Б, Клифстра Т, Виллемсен М, Фринс Дж. П., Девриендт К, Ульманн Р, Вингрон М, Рогеманн К., Винкер Т.Ф., Чах А., ван Боховен Х., Геч Дж., Йентч Т.Дж., Чен В., Роперс Х.Х., Кальшойер В.М. (февраль 2015 г.). «Секвенирование X-экзома 405 неразрешенных семей выявило семь новых генов умственной отсталости» (PDF) . Молекулярная психиатрия . 21 (1): 133–48. дои : 10.1038/mp.2014.193 . ПМК 5414091 . ПМИД 25644381 .
^ Альенде-Вега Н., Маккензи Л., Мик Д. (сентябрь 2008 г.). «Фактор транскрипции TAFII250 фосфорилирует кислый домен Mdm2 за счет привлечения протеинкиназы CK2». Мол. Клетка. Биохим . 316 (1–2): 99–106. дои : 10.1007/s11010-008-9816-3 . ПМИД 18548200 . S2CID 25685775 .
^ Аднане Дж., Шао З., Роббинс П.Д. (январь 1999 г.). «Циклин D1 связывается с TBP-ассоциированным фактором TAF (II) 250, чтобы регулировать транскрипцию, опосредованную Sp1» . Онкоген . 18 (1): 239–47. дои : 10.1038/sj.onc.1202297 . ПМИД 9926939 .
^ Jump up to: ^а ^б Зигерт Дж.Л., Раштон Дж.Дж., Селлерс В.Р., Кэлин В.Г., Роббинс П.Д. (ноябрь 2000 г.). «Циклин D1 подавляет опосредованное белком ретинобластомы ингибирование активности киназы TAFII250» . Онкоген . 19 (50): 5703–11. дои : 10.1038/sj.onc.1203966 . ПМИД 11126356 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Зигерт Дж.Л., Роббинс П.Д. (январь 1999 г.). «Rb ингибирует внутреннюю киназную активность фактора TAFII250, связанного с ТАТА-связывающим белком» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. дои : 10.1128/MCB.19.1.846 . ПМК 83941 . ПМИД 9858607 .
^ Дикштейн Р., Руперт С., Тиан Р. (март 1996 г.). «TAFII250 представляет собой двудольную протеинкиназу, которая фосфорилирует базовый фактор транскрипции RAP74» . Клетка . 84 (5): 781–90. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81055-7 . ПМИД 8625415 .
^ Руперт С., Тиан Р. (ноябрь 1995 г.). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: значение для инициации РНК-полимеразы II» . Генс Дев . 9 (22): 2747–55. дои : 10.1101/gad.9.22.2747 . ПМИД 7590250 .
^ Малик С., Гермах М., Редер Р.Г. (март 1998 г.). «Динамическая модель функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (5): 2192–7. Бибкод : 1998PNAS...95.2192M . дои : 10.1073/pnas.95.5.2192 . ЧВК 19292 . ПМИД 9482861 .
^ Шао З., Руперт С., Роббинс П.Д. (апрель 1995 г.). «Продукт гена предрасположенности к ретинобластоме напрямую связывается с фактором TAFII250, связанным с ТАТА-связывающим белком человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3115–9. Бибкод : 1995PNAS...92.3115S . дои : 10.1073/pnas.92.8.3115 . ПМК 42115 . ПМИД 7724524 .
^ Шао З., Зигерт Дж.Л., Руперт С., Роббинс П.Д. (июль 1997 г.). «Rb взаимодействует с TAF(II)250/TFIID через несколько доменов» . Онкоген . 15 (4): 385–92. дои : 10.1038/sj.onc.1201204 . ПМИД 9242374 .
^ Гегонн А., Вайсман Дж.Д., Сингер Д.С. (октябрь 2001 г.). «Связывание TAFII55 с TAFII250 ингибирует его ацетилтрансферазную активность» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (22): 12432–7. Бибкод : 2001PNAS...9812432G . дои : 10.1073/pnas.211444798 . ПМК 60071 . ПМИД 11592977 .
^ Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .
^ Руперт С., Ван Э.Х., Цзян Р. (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: фактор, связанный с ТБФ, участвующий в регуляции клеточного цикла» . Природа . 362 (6416): 175–9. Бибкод : 1993Natur.362..175R . дои : 10.1038/362175a0 . ПМИД 7680771 . S2CID 4364676 .
^ О'Брайен Т., Тиан Р. (май 1998 г.). «Функциональный анализ N-концевого киназного домена TAFII250 человека» . Мол. Клетка . 1 (6): 905–11. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80089-1 . ПМИД 9660973 .
^ Лин С.И., Туан Дж., Скалиа П., Буй Т., Комай Л. (декабрь 2002 г.). «Фактор регулирования клеточного цикла TAF1 стимулирует транскрипцию рибосомальной ДНК путем связывания с активатором UBF» . Курс. Биол . 12 (24): 2142–6. дои : 10.1016/s0960-9822(02)01389-1 . ПМИД 12498690 .

Дальнейшее чтение

Вассарман Д.А., Зауэр Ф (2001). «TAF (II) 250: набор инструментов для транскрипции». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 16): 2895–902. дои : 10.1242/jcs.114.16.2895 . ПМИД 11686293 .
Ха я, Лейн В.С., Рейнберг Д. (1991). «Клонирование человеческого гена, кодирующего общий фактор инициации транскрипции IIB». Природа . 352 (6337): 689–95. Бибкод : 1991Natur.352..689H . дои : 10.1038/352689a0 . ПМИД 1876184 . S2CID 4267950 .
Секигути Т., Нохиро Ю., Накамура Ю., Хисамото Н., Нишимото Т. (1991). «Ген CCG1 человека, необходимый для развития фазы G1, кодирует ядерный ДНК-связывающий белок массой 210 килодальтон» . Мол. Клетка. Биол . 11 (6): 3317–25. дои : 10.1128/mcb.11.6.3317 . ПМК 360184 . ПМИД 2038334 .
Секигути Т., Мията Т., Нисимото Т. (1988). «Молекулярное клонирование кДНК гена X-хромосомы человека (CCG1), который дополняет чувствительные к температуре мутанты G1, tsBN462 и ts13, клеточной линии BHK» . ЭМБО Дж . 7 (6): 1683–7. дои : 10.1002/j.1460-2075.1988.tb02996.x . ПМЦ 457153 . ПМИД 3169001 .
Секигути Т., Ёсида М.К., Секигути М., Нисимото Т. (1987). «Выделение человеческого гена, связанного с Х-хромосомой, необходимого для перехода от фазы G1 к фазе S клеточного цикла». Эксп. Сотовый Res . 169 (2): 395–407. дои : 10.1016/0014-4827(87)90200-X . ПМИД 3556424 .
Руперт С., Тиан Р. (1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: значение для инициации РНК-полимеразы II» . Генс Дев . 9 (22): 2747–55. дои : 10.1101/gad.9.22.2747 . ПМИД 7590250 .
Хисатакэ К., Охта Т., Такада Р., Гермах М., Хорикоши М., Накатани Ю., Редер Р.Г. (1995). «Эволюционная консервативность человеческих факторов, связанных с ТАТА-связывающими полипептидами TAFII31 и TAFII80, и взаимодействие TAFII80 с другими TAF и с общими факторами транскрипции» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (18): 8195–9. Бибкод : 1995PNAS...92.8195H . дои : 10.1073/pnas.92.18.8195 . ПМЦ 41123 . ПМИД 7667268 .
Руперт С., Ван Э.Х., Цзян Р. (1993). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: фактор, связанный с ТБФ, участвующий в регуляции клеточного цикла» . Природа . 362 (6416): 175–9. Бибкод : 1993Natur.362..175R . дои : 10.1038/362175a0 . ПМИД 7680771 . S2CID 4364676 .
Шао З., Руперт С., Роббинс П.Д. (1995). «Продукт гена предрасположенности к ретинобластоме напрямую связывается с фактором TAFII250, связанным с ТАТА-связывающим белком человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3115–9. Бибкод : 1995PNAS...92.3115S . дои : 10.1073/pnas.92.8.3115 . ПМК 42115 . ПМИД 7724524 .
ДеДжонг Дж., Бернштейн Р., Редер Р.Г. (1995). «Общий фактор транскрипции человека TFIIA: характеристика кДНК, кодирующей малую субъединицу, и потребность в базальной и активированной транскрипции» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3313–7. Бибкод : 1995PNAS...92.3313D . дои : 10.1073/pnas.92.8.3313 . ПМК 42156 . ПМИД 7724559 .
Тут С.Дж., Чен Дж.Л., Клемм Р., Тцзян Р. (1995). «Активация транскрипции p53, опосредованная коактиваторами TAFII40 и TAFII60». Наука . 267 (5194): 100–4. дои : 10.1126/science.7809597 . ПМИД 7809597 .
Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1995). «Новый механизм и фактор регуляции ВИЧ-1 Tat» . ЭМБО Дж . 14 (2): 321–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . ПМК 398086 . ПМИД 7835343 .
Парада Калифорния, Юн Дж.Б., Редер Р.Г. (1995). «Новое ограничение транскрипции ВИЧ-1, опосредованное LBP-1, на уровне элонгации in vitro» . Ж. Биол. Хим . 270 (5): 2274–83. дои : 10.1074/jbc.270.5.2274 . ПМИД 7836461 .
Жак Икс, Бру С, Лутц Ю, Дэвидсон И, Шамбон П, Тора Л (1994). «Человеческий TAFII30 присутствует в отдельном комплексе TFIID и необходим для активации транскрипции рецептором эстрогена». Клетка . 79 (1): 107–17. дои : 10.1016/0092-8674(94)90404-9 . ПМИД 7923369 . S2CID 19698550 .
Оу С.Х., Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Паулссен Э.Дж., Гейнор Р.Б. (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . ПМК 237158 . ПМИД 7933101 .
Сан Х, Ма Д., Шелдон М., Юнг К., Рейнберг Д. (1994). «Восстановление активности TFIIA человека из рекомбинантных полипептидов: роль в транскрипции, опосредованной TFIID» . Генс Дев . 8 (19): 2336–48. дои : 10.1101/gad.8.19.2336 . ПМИД 7958900 .
Мец Р., Баннистер А.Дж., Сазерленд Дж.А., Хагемайер С., О'Рурк ЕС, Кук А., Браво Р., Кузаридес Т. (1994). «c-Fos-индуцированная активация промотора, содержащего ТАТА-бокс, включает прямой контакт с белком, связывающим ТАТА-бокс» . Мол. Клетка. Биол . 14 (9): 6021–9. дои : 10.1128/MCB.14.9.6021 . ПМК 359128 . ПМИД 8065335 .
Кашанчи Ф., Пирас Г., Радонович М.Ф., Дюваль Дж.Ф., Фаттей А., Чан К.М., Редер Р.Г., Брейди Дж.Н. (1994). «Прямое взаимодействие TFIID человека с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа . 367 (6460): 295–9. Бибкод : 1994Natur.367..295K . дои : 10.1038/367295a0 . ПМИД 8121496 . S2CID 4362048 .
Накашима Т., Секигути Т., Сунамото Х., Юра К., Томода С., Го М., Кере Дж., Шлессингер Д., Нишимото Т. (1994). «Структура человеческого гена CCG1: взаимосвязь между экзонами/интронами и функциональным доменом/модулями белка». Джин . 141 (2): 193–200. дои : 10.1016/0378-1119(94)90570-3 . ПМИД 8163188 .
Ма Д., Ватанабэ Х., Мермельштейн Ф., Адмон А., Огури К., Сан Х, Вада Т., Имаи Т., Широя Т., Рейнберг Д. (1993). «Выделение кДНК, кодирующей самую большую субъединицу TFIIA, выявляет функции, важные для активированной транскрипции» . Джинс Дев 7 (11): 2246–57. дои : 10.1101/gad.7.11.2246 . ПМИД 8224850 .

Внешние ссылки

ФакторБук TAF1
Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о Х-сцепленной дистонии-паркинсонизме
http://biorxiv.org/content/early/2015/01/21/014050
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P21675 (фактор инициации транскрипции, субъединица TFIID 1) на PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147133 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031314 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TAF1 TAF1 РНК-полимераза II, фактор, связанный с белком TATA-бокса (TBP), 250 кДа» .

[pmid3556424-6] Секигути Т., Ёсида М.К., Секигути М., Нишимото Т. (апрель 1987 г.). «Выделение человеческого гена, связанного с Х-хромосомой, необходимого для перехода от фазы G1 к фазе S клеточного цикла». Эксп. Сотовый Res . 169 (2): 395–407. дои : 10.1016/0014-4827(87)90200-X . ПМИД 3556424 .

[7] Хе М, Персон Т.Н., Хеббринг С.Дж., Хайнцен Э., Йе З., Шроди С.Дж., Макферсон Э.В., Лин С.М., Пейссиг П.Л., Бриллиант М.Х., О'Рэйв Дж., Робисон Р.Дж., Лайон Г.Дж., Ван К. (январь 2015 г.). «SeqHBase: набор инструментов для работы с большими данными для анализа данных семейного секвенирования» . Журнал медицинской генетики . 52 (4): 282–8. doi : 10.1136/jmedgenet-2014-102907 . ПМЦ 4382803 . ПМИД 25587064 .

[8] О'Рэйве Дж.А., Ву Й., Дорфель М.Дж., Роуп А.Ф., Ау П.И., Парбузингх Дж.С., Мун С., Куси М., Косма К., Смит К.С., Цетис М., Шютте Дж.Л., Хуфнагель Р.Б., Прада CE, Мартинес Ф., Орельяна К., Крейн Дж., Каро-Ллопис А., Олтра С., Монфорт С., Хименес-Баррон Л.Т., Свенсен Дж., Эллингвуд С., Смит Р., Фанг Х., Оспина С., Стегманн С., Ден Холландер Н., Миттельман Д., Хайнам Дж., Робисон Р., Ян Э, Фавр Л, Руберти А, Ривьер ЖБ, Монаган К.Г., Ван К., Дэвис Э.Э., Кацанис Н., Калшойер В.М., Ван Э.Х., Меткалф К., Клифстра Т., Иннес А.М., Кициу-Цели С., Розелло М., Киган С.Э., Лион Дж.Дж. (2015). «Вариант TAF1 связан с новым синдромом с тяжелой умственной отсталостью и характерными дисморфическими особенностями» . Американский журнал генетики человека . 97 (6): 922–932. дои : 10.1016/j.ajhg.2015.11.005 . ПМЦ 4678794 . ПМИД 26637982 .

[9] Ху Х, Хаас С.А., Челли Дж., Ван Эш Х., Рейно М., де Брауэр А.П., Вайнерт С., Фройен Г., Фринц С.Г., Лаумонье Ф., Земойтель Т., Лав Ми., Ричард Х., Эмде А.К., Бьенек М., Йенсен С., Хэмброк М, Фишер Ю, Ланник С, Фельдкамп М, Виссинк-Линдхаут В, Лебрен Н, Кастельно Л, Руччи Дж, Монжан Р, Дорсей О, Биллюарт П, Стульманн Т, Шоу М, Корбетт М.А., Гарднер А, Уиллис-Оуэн С, Тан С, Френд К.Л., Белет С., ван Роозендаль К.Е., Хименес-Поке М., Мойар М.П., Ронсе Н., Сан Р., О'Киф С., Ченна Р., ван Бёммель А., Гёке Дж., Хакетт А., Филд М., Кристи Л., Бойл Дж., Хаан Э., Нельсон Дж., Тернер Дж., Байнам Дж., Гиллессен-Кесбах Г., Мюллер У., Стейнбергер Д., Бадни Б., Бадура-Стронка М., Латос-Беленьска А., Усагер Л.Б., Викер П., Родригес Криадо. Г, Бондесон МЛ, Аннерен Г, Дюфке А, Коэн М, Ван Малдергем Л, Винсент-Делорм С, Эшенн Б, Саймон-Буи Б, Клифстра Т, Виллемсен М, Фринс Дж. П., Девриендт К, Ульманн Р, Вингрон М, Рогеманн К., Винкер Т.Ф., Чах А., ван Боховен Х., Геч Дж., Йентч Т.Дж., Чен В., Роперс Х.Х., Кальшойер В.М. (февраль 2015 г.). «Секвенирование X-экзома 405 неразрешенных семей выявило семь новых генов умственной отсталости» (PDF) . Молекулярная психиатрия . 21 (1): 133–48. дои : 10.1038/mp.2014.193 . ПМК 5414091 . ПМИД 25644381 .

[pmid18548200-10] Альенде-Вега Н., Маккензи Л., Мик Д. (сентябрь 2008 г.). «Фактор транскрипции TAFII250 фосфорилирует кислый домен Mdm2 за счет привлечения протеинкиназы CK2». Мол. Клетка. Биохим . 316 (1–2): 99–106. дои : 10.1007/s11010-008-9816-3 . ПМИД 18548200 . S2CID 25685775 .

[pmid9926939-11] Аднане Дж., Шао З., Роббинс П.Д. (январь 1999 г.). «Циклин D1 связывается с TBP-ассоциированным фактором TAF (II) 250, чтобы регулировать транскрипцию, опосредованную Sp1» . Онкоген . 18 (1): 239–47. дои : 10.1038/sj.onc.1202297 . ПМИД 9926939 .

[pmid11126356-12] Jump up to: ^а ^б Зигерт Дж.Л., Раштон Дж.Дж., Селлерс В.Р., Кэлин В.Г., Роббинс П.Д. (ноябрь 2000 г.). «Циклин D1 подавляет опосредованное белком ретинобластомы ингибирование активности киназы TAFII250» . Онкоген . 19 (50): 5703–11. дои : 10.1038/sj.onc.1203966 . ПМИД 11126356 .

[pmid9858607-13] Jump up to: ^а ^б ^с Зигерт Дж.Л., Роббинс П.Д. (январь 1999 г.). «Rb ингибирует внутреннюю киназную активность фактора TAFII250, связанного с ТАТА-связывающим белком» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. дои : 10.1128/MCB.19.1.846 . ПМК 83941 . ПМИД 9858607 .

[pmid8625415-14] Дикштейн Р., Руперт С., Тиан Р. (март 1996 г.). «TAFII250 представляет собой двудольную протеинкиназу, которая фосфорилирует базовый фактор транскрипции RAP74» . Клетка . 84 (5): 781–90. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81055-7 . ПМИД 8625415 .

[pmid7590250-15] Руперт С., Тиан Р. (ноябрь 1995 г.). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: значение для инициации РНК-полимеразы II» . Генс Дев . 9 (22): 2747–55. дои : 10.1101/gad.9.22.2747 . ПМИД 7590250 .

[pmid9482861-16] Малик С., Гермах М., Редер Р.Г. (март 1998 г.). «Динамическая модель функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (5): 2192–7. Бибкод : 1998PNAS...95.2192M . дои : 10.1073/pnas.95.5.2192 . ЧВК 19292 . ПМИД 9482861 .

[pmid7724524-17] Шао З., Руперт С., Роббинс П.Д. (апрель 1995 г.). «Продукт гена предрасположенности к ретинобластоме напрямую связывается с фактором TAFII250, связанным с ТАТА-связывающим белком человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (8): 3115–9. Бибкод : 1995PNAS...92.3115S . дои : 10.1073/pnas.92.8.3115 . ПМК 42115 . ПМИД 7724524 .

[pmid9242374-18] Шао З., Зигерт Дж.Л., Руперт С., Роббинс П.Д. (июль 1997 г.). «Rb взаимодействует с TAF(II)250/TFIID через несколько доменов» . Онкоген . 15 (4): 385–92. дои : 10.1038/sj.onc.1201204 . ПМИД 9242374 .

[pmid11592977-19] Гегонн А., Вайсман Дж.Д., Сингер Д.С. (октябрь 2001 г.). «Связывание TAFII55 с TAFII250 ингибирует его ацетилтрансферазную активность» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (22): 12432–7. Бибкод : 2001PNAS...9812432G . дои : 10.1073/pnas.211444798 . ПМК 60071 . ПМИД 11592977 .

[pmid9153318-20] Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .

[pmid7680771-21] Руперт С., Ван Э.Х., Цзян Р. (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: фактор, связанный с ТБФ, участвующий в регуляции клеточного цикла» . Природа . 362 (6416): 175–9. Бибкод : 1993Natur.362..175R . дои : 10.1038/362175a0 . ПМИД 7680771 . S2CID 4364676 .

[pmid9660973-22] О'Брайен Т., Тиан Р. (май 1998 г.). «Функциональный анализ N-концевого киназного домена TAFII250 человека» . Мол. Клетка . 1 (6): 905–11. дои : 10.1016/s1097-2765(00)80089-1 . ПМИД 9660973 .

[pmid12498690-23] Лин С.И., Туан Дж., Скалиа П., Буй Т., Комай Л. (декабрь 2002 г.). «Фактор регулирования клеточного цикла TAF1 стимулирует транскрипцию рибосомальной ДНК путем связывания с активатором UBF» . Курс. Биол . 12 (24): 2142–6. дои : 10.1016/s0960-9822(02)01389-1 . ПМИД 12498690 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]