УБТФ
УБТФ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | UBTF , NOR-90, UBF, UBF-1, UBF1, UBF2, транскрипционный фактор восходящего связывания, РНК-полимераза I, CONDBA, транскрипционный фактор восходящего связывания | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 600673 ; МГИ : 98512 ; Гомологен : 7970 ; GeneCards : UBTF ; ОМА : UBTF — ортологи | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Фактор транскрипции восходящего связывания (UBTF) , или фактор восходящего связывания (UBF), представляет собой белок , который у человека кодируется UBTF геном . [ 5 ] [ 6 ]
Ген
[ редактировать ]У человека ген UBTF кодирует белок, состоящий из 764 аминокислот, и расположен на хромосоме 17 в положении q21.31. [ 7 ] [ 8 ] У мышей UBTF обнаруживается на хромосоме 11. [ нужна ссылка ] .
Структура
[ редактировать ]UBTF содержит шесть групповых боксов с высокой подвижностью ( HMG-боксы ), которые позволяют ему связываться с ДНК. [ 9 ] UBTF также содержит гиперкислотный карбокси-концевой домен, который необходим для активации транскрипции, и мотив димерации спираль-разрыв-спираль (поскольку считается, что UBTF часто действует как димер). [ 9 ] [ 10 ]
У людей альтернативный сплайсинг может привести к образованию изоформ UBTF1 или UBTF2, масса которых составляет 97 кДа и 94 кДа соответственно. [ 11 ] В UBTF2 отсутствует экзон 8 более крупной изоформы UBTF1, которая кодирует часть HMG Box 2. [ 12 ]
Функция
[ редактировать ]UBTF представляет собой фактор транскрипции, необходимый для экспрессии рибосомальных РНК 18S, 5,8S и 28S, а также SL1 (комплекс TBP (MIM 600075) и трех TBP-ассоциированных факторов или «TAF»). [ нужна ссылка ] .
UBTF представляет собой ядрышковый фосфопротеин с ДНК-связывающим и трансактивационным доменами. Специфическое для последовательности связывание ДНК с ядром и вышестоящими контрольными элементами промотора рРНК человека опосредовано через несколько боксов HMG. [ 13 ] [предоставлено OMIM] [ 6 ]
У позвоночных UBTF играет решающую роль в поддержании хроматина рДНК в эухроматическом состоянии. Следовательно, связывание UBTF является одной из характеристик эухроматических транскрипционно активных повторов рДНК. [ 14 ]
Было обнаружено, что UBTF2 регулирует транскрипцию мРНК с помощью РНК-полимеразы II. [ 9 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]UBTF может играть роль в развитии рака. Повышенное связывание UBF с рДНК наблюдалось в раковых клетках и связано с повышенной транскрипцией рДНК и выживаемостью опухолевых клеток. [ 15 ] В подтверждение этого было обнаружено, что цисплатин, химиотерапевтический препарат, может вытеснять UBTF из рДНК, вызывая снижение синтеза рРНК и последующий p53-независимый апоптоз. [ 16 ]
Кроме того, было обнаружено, что UBTF способствует развитию меланомы, стимулируя экспрессию GIT1, которая, в свою очередь, активирует сигнальные пути MEK1/2-ERK1/2. [ 17 ]
UBTF также может быть важен для неврологического функционирования. развития . Было обнаружено, что мутация de novo в отношении усиления функции UBTF (c.628G>A) вызывает нейрорегрессию [ 12 ] Эта мутация заменяет глутаминовую кислоту лизином в положении 210 полипептидной цепи (p.Glu210Lys), что приводит к более сильному взаимодействию UBTF с ДНК. [ 18 ] В 2022 году у пробанда с тяжелой ранней задержкой развития был выявлен еще один вероятный патогенный вариант (Gln203Arg). [ 19 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что UBTF взаимодействует с:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000108312 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020923 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Матера А.Г., Ву В., Имаи Х., О'Киф С.Л., Чан Э.К. (май 1997 г.). «Молекулярное клонирование гена транскрипционного фактора РНК-полимеразы I hUBF / NOR-90 (UBTF) и локализация на 17q21.3 путем флуоресцентной гибридизации in situ и радиационного гибридного картирования». Геномика . 41 (1): 135–8. дои : 10.1006/geno.1997.4647 . ПМИД 9126496 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: транскрипционный фактор, связывающий UBTF, РНК-полимераза I» .
- ^ Джонс К.А., Блэк DM, Гриффитс Б.Л., Соломон Э. (декабрь 1995 г.). «Локализация гена транскрипционного фактора РНК-полимеразы I человека (UBTF) в локусе D17S183 на хромосоме 17q21 и построение карты дальнего ограничения региона». Геномика . 30 (3): 602–4. дои : 10.1006/geno.1995.1283 . ПМИД 8825649 .
- ^ Эдвардсон С., Николае С.М., Агравал П.Б., Миньо С., Пейн К. и др. (август 2017 г.). «Гетерозиготный вариант усиления функции De Novo UBTF связан с нейродегенерацией в детстве» . Американский журнал генетики человека . 101 (2): 267–73. дои : 10.1016/j.ajhg.2017.07.002 . ПМЦ 5544390 . ПМИД 28777933 .
- ^ Перейти обратно: а б с Санидж Э., Диш Дж., Лесмана А., Поортинга Г., Хейн Н. и др. (февраль 2015 г.). «Новая роль транскрипционного фактора Pol I UBTF в поддержании стабильности генома посредством регуляции высокотранскрибируемых генов Pol II» . Геном Рез . 25 (2): 201–12. дои : 10.1101/гр.176115.114 . ПМЦ 4315294 . ПМИД 25452314 .
- ^ Шнапп Г., Сантори Ф., Карлес К., Рива М., Груммт И. (январь 1994 г.). «Ядрышковый фактор транскрипции UBF, содержащий HMG-бокс, взаимодействует со специфической субъединицей РНК-полимеразы I» . ЭМБО Дж . 13 (1): 190–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06248.x . ПМЦ 394792 . ПМИД 394792 .
- ^ Белл С.П., Лирден Р.М., Янцен Х.М., Тцзян Р. (сентябрь 1988 г.). «Функциональная кооперативность между факторами транскрипции UBF1 и SL1 опосредует синтез рибосомальной РНК человека». Наука . 241 (4870): 1192–7. Бибкод : 1988Sci...241.1192B . дои : 10.1126/science.3413483 . ПМИД 3413483 .
- ^ Перейти обратно: а б Торо С., Хори Р.Т., Маликдан М.С., Тиффт С.Дж., Гольдштейн А. и др. (февраль 2018 г.). «Рекуррентная миссенс-мутация de novo в UBTF вызывает нейрорегрессию развития» . ЭМБО Дж . 27 (4): 691–705. дои : 10.1093/hmg/ddx435 . ПМЦ 5886272 . ПМИД 29300972 .
- ^ Янцен Х.М., Адмон А., Белл С.П., Тцзян Р. (апрель 1990 г.). «Ядрышковый фактор транскрипции hUBF содержит ДНК-связывающий мотив, гомологичный белкам HMG» . Природа . 344 (6269): 830–6. Бибкод : 1990Natur.344..830J . дои : 10.1038/344830a0 . ПМИД 2330041 . S2CID 4280039 .
- ^ Санидж Э., Ханнан Р. (август 2009 г.). «Роль UBF в регуляции структуры и динамики транскрипционно активного хроматина рДНК» . Эпигенетика . 4 (6): 374–82. дои : 10.4161/epi.4.6.9449 . ПМИД 19717978 . S2CID 30922645 .
- ^ Диш Дж., Байуотер М.Дж., Санидж Э., Кэмерон Д.П., Ширдинг В. и др. (январь 2019 г.). «Изменения в дальних взаимодействиях рДНК-генома связаны с измененными генными программами РНК-полимеразы II во время злокачественной трансформации» . Коммуникационная биология . 2 : е39 (2019). дои : 10.1038/s42003-019-0284-y . ПМК 6349880 . ПМИД 30701204 . S2CID 210151479 .
- ^ Хамдейн Н., Хердман С., Марс Дж., Стефановский В., Трембле М.Г., Мосс Т. (сентябрь 2015 г.). «Истощение фактора HMGB-бокса UBF, нацеленного на цисплатин, избирательно индуцирует p53-независимую апоптозную смерть в трансформированных клетках» . Онкотаргет . 6 (29): 27519–27536. дои : 10.18632/oncotarget.4823 . ПМК 4695006 . ПМИД 26317157 .
- ^ Чжан Дж., Чжан Дж., Лю В., Гэ Р., Гао Т. и др. (октябрь 2021 г.). «UBTF способствует прогрессированию меланомы посредством модуляции сигнальных путей MEK1/2-ERK1/2 путем стимулирования транскрипции GIT1» . Международная организация раковых клеток . 21 (1): 543 (2021). дои : 10.1186/s12935-021-02237-8 . ПМЦ 8522148 . ПМИД 34663332 .
- ^ Эдвардсон С., Николае С.М., Агравал П.Б., Миньо С., Пейн К. и др. (август 2017 г.). «Гетерозиготный вариант усиления функции De Novo UBTF связан с нейродегенерацией в детстве» . Американский журнал генетики человека . 101 (2): 267–73. дои : 10.1016/j.ajhg.2017.07.002 . ПМЦ 5544390 . ПМИД 28777933 .
- ^ Тинкер Р.Дж., Гесс Т., Ринкер Д.С., Шихан Дж.Х., Любарски Д. и др. (декабрь 2022 г.). «Новый, вероятно патогенный вариант нейродегенерации, связанной с UBTF, с атрофией мозга связан с тяжелым дивергентным фенотипом развития нервной системы» . Молекулярная генетика и геномная медицина . 10 (12): е2054. дои : 10.1002/mgg3.2054 . ПМЦ 9747545 . ПМИД 36106513 .
- ^ Войт Р., Кун А., Сандер Э.Э., Груммт I (июль 1995 г.). «Активация транскрипции рибосомальных генов млекопитающих требует фосфорилирования ядрышкового фактора транскрипции UBF» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (14): 2593–9. дои : 10.1093/нар/23.14.2593 . ПМК 307079 . ПМИД 7651819 .
- ^ Ханнан К.М., Ханнан Р.Д., Смит С.Д., Джефферсон Л.С., Лун М., Ротблюм Л.И. (октябрь 2000 г.). «Rb и p130 регулируют транскрипцию РНК-полимеразы I: Rb нарушает взаимодействие между UBF и SL-1» . Онкоген . 19 (43): 4988–99. дои : 10.1038/sj.onc.1203875 . ПМИД 11042686 .
- ^ Войт Р., Груммт I (ноябрь 2001 г.). «Фосфорилирование UBF по серину 388 необходимо для взаимодействия с РНК-полимеразой I и активации транскрипции рДНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (24): 13631–6. Бибкод : 2001PNAS...9813631V . дои : 10.1073/pnas.231071698 . ПМК 61092 . ПМИД 11698641 .
- ^ Чжай В., Комай Л. (август 2000 г.). «Репрессия транскрипции РНК-полимеразы I супрессором опухоли р53» . Мол. Клетка. Биол . 20 (16): 5930–8. дои : 10.1128/mcb.20.16.5930-5938.2000 . ПМК 86070 . ПМИД 10913176 .
- ^ Лин С.И., Туан Дж., Скалиа П., Буй Т., Комай Л. (декабрь 2002 г.). «Фактор регулирования клеточного цикла TAF1 стимулирует транскрипцию рибосомальной ДНК путем связывания с активатором UBF» . Курс. Биол . 12 (24): 2142–6. дои : 10.1016/s0960-9822(02)01389-1 . ПМИД 12498690 . S2CID 16352280 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Чан Э.К., Имаи Х., Хамель Дж.К., Тан Э.М. (1991). «Человеческое аутоантитело к фактору транскрипции РНК-полимеразы I hUBF. Молекулярная идентичность аутоантигена NOR-90 области ядрышкового организатора и фактора связывания выше транскрипции рибосомальной РНК» . Дж. Эксп. Мед . 174 (5): 1239–44. дои : 10.1084/jem.174.5.1239 . ПМК 2119007 . ПМИД 1940801 .
- Янцен Х.М., Адмон А., Белл С.П., Тцзян Р. (1990). «Ядрышковый фактор транскрипции hUBF содержит ДНК-связывающий мотив, гомологичный белкам HMG» . Природа . 344 (6269): 830–6. Бибкод : 1990Natur.344..830J . дои : 10.1038/344830a0 . ПМИД 2330041 . S2CID 4280039 .
- Белл С.П., Лирден Р.М., Янцен Х.М., Тцзян Р. (1988). «Функциональная кооперативность между факторами транскрипции UBF1 и SL1 опосредует синтез рибосомальной РНК человека». Наука . 241 (4870): 1192–7. Бибкод : 1988Sci...241.1192B . дои : 10.1126/science.3413483 . ПМИД 3413483 .
- Войт Р., Кун А., Сандер Э.Э., Груммт I (1995). «Активация транскрипции рибосомальных генов млекопитающих требует фосфорилирования ядрышкового фактора транскрипции UBF» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (14): 2593–9. дои : 10.1093/нар/23.14.2593 . ПМК 307079 . ПМИД 7651819 .
- Хемпель В.М., Кавано А.Х., Ханнан Р.Д., Тейлор Л., Ротблюм Л.И. (1996). «Видоспецифичный фактор транскрипции РНК-полимеразы I SL-1 связывается с вышестоящим связывающим фактором» . Мол. Клетка. Биол . 16 (2): 557–63. дои : 10.1128/MCB.16.2.557 . ПМК 231034 . ПМИД 8552083 .
- Ханада К., Сонг Ч.З., Ямамото К., Яно К., Маэда Ю., Ямагути К., Мурамацу М. (1996). «Фактор 53, ассоциированный с РНК-полимеразой I, связывается с ядрышковым фактором транскрипции UBF и участвует в специфической транскрипции рДНК» . ЭМБО Дж . 15 (9): 2217–26. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00575.x . ПМК 450146 . ПМИД 8641287 .
- Плута А.Ф., Эрншоу У.К. (1996). «Специфическое взаимодействие между кинетохорным белком человека CENP-C и ядрышковым регулятором транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 271 (31): 18767–74. дои : 10.1074/jbc.271.31.18767 . ПМИД 8702533 .
- Уайтхед СМ, Винкфейн Р.Дж., Фрицлер М.Дж., Раттнер Дж.Б. (1997). «ASE-1: новый белок фибриллярных центров ядрышка и области ядрышкового организатора митотических хромосом». Хромосома . 106 (8): 493–502. дои : 10.1007/s004120050271 . ПМИД 9426281 . S2CID 10684078 .
- Войт Р., Хоффманн М., Груммт И. (1999). «Фосфорилирование G1-специфичными комплексами cdk-циклин активирует ядрышковый фактор транскрипции UBF» . ЭМБО Дж . 18 (7): 1891–9. дои : 10.1093/emboj/18.7.1891 . ПМЦ 1171274 . ПМИД 10202152 .
- Лю CJ, Ван Х, Лендьел П. (1999). «Интерферон-индуцируемый ядрышковый белок p204 связывает фактор транскрипции UBF1, специфичный для рибосомальной РНК, и ингибирует транскрипцию рибосомальной РНК» . ЭМБО Дж . 18 (10): 2845–54. дои : 10.1093/emboj/18.10.2845 . ПМЦ 1171365 . ПМИД 10329630 .
- Ханнан К.М., Ханнан Р.Д., Смит С.Д., Джефферсон Л.С., Лун М., Ротблюм Л.И. (2000). «Rb и p130 регулируют транскрипцию РНК-полимеразы I: Rb нарушает взаимодействие между UBF и SL-1» . Онкоген . 19 (43): 4988–99. дои : 10.1038/sj.onc.1203875 . ПМИД 11042686 .
- Калоусек И, Кризкова П (2000). «Митогенная трансформация лимфоцитов сопровождается фосфорилированием ядрышкового фактора транскрипции UBF». Клетка. Мол. Биол. (Шумный-ле-гранд) . 46 (7): 1163–71. ПМИД 11075946 .
- Пеллетье Г., Стефановский В.Ю., Фобладье М., Хиршлер-Лашкевич И., Савар Дж., Ротблюм Л.И., Коте Ж., Мосс Т. (2000). «Конкурентное привлечение CBP и Rb-HDAC регулирует ацетилирование UBF и транскрипцию рибосом» . Мол. Клетка . 6 (5): 1059–66. дои : 10.1016/S1097-2765(00)00104-0 . ПМИД 11106745 .
- Миллер Г., Панов К.И., Фридрих Дж.К., Тринкль-Мулкахи Л., Ламонд А.И., Зомердейк Дж.К. (2001). «hRRN3 необходим для опосредованного SL1 рекрутирования РНК-полимеразы I на промоторы гена рРНК» . ЭМБО Дж . 20 (6): 1373–82. дои : 10.1093/emboj/20.6.1373 . ПМЦ 145519 . ПМИД 11250903 .
- Зейтер П., Ибен С., Тири М., Груммт I (2001). «PAF67, новый белок, связанный с компетентной инициацией формой РНК-полимеразы I». Биол. Хим . 382 (8): 1163–70. дои : 10.1515/BC.2001.146 . ПМИД 11592397 . S2CID 28819190 .
- Войт Р., Груммт I (2001). «Фосфорилирование UBF по серину 388 необходимо для взаимодействия с РНК-полимеразой I и активации транскрипции рДНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (24): 13631–6. Бибкод : 2001PNAS...9813631V . дои : 10.1073/pnas.231071698 . ПМК 61092 . ПМИД 11698641 .
- Стефановский В.Я., Пеллетье Дж., Ханнан Р., Ганьон-Кюглер Т., Ротблюм Л.И., Мосс Т. (2001). «Немедленный ответ рибосомальной транскрипции на стимуляцию фактором роста у млекопитающих опосредован фосфорилированием ERK UBF» . Мол. Клетка . 8 (5): 1063–73. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00384-7 . ПМИД 11741541 .
- Андерсен Дж.С., Лион CE, Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х., Манн М., Ламонд А.И. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 . S2CID 14132033 .
- Дюр С., Торрес-Монтанер А., Астола А., Гарсия-Косар Ф.Дж., Пендон С., Боливар Х., Вальдивия М.М. (2001). «Молекулярный анализ 5'-области рибосомального фактора транскрипции человека UBF». Секв. ДНК . 12 (4): 267–72. дои : 10.3109/10425170109025001 . ПМИД 11916260 . S2CID 11173681 .