Jump to content

УБТФ

УБТФ
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы UBTF , NOR-90, UBF, UBF-1, UBF1, UBF2, транскрипционный фактор восходящего связывания, РНК-полимераза I, CONDBA, транскрипционный фактор восходящего связывания
Внешние идентификаторы Опустить : 600673 ; МГИ : 98512 ; Гомологен : 7970 ; GeneCards : UBTF ; ОМА : UBTF — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001076683
НМ_001076684
НМ_014233

RefSeq (белок)

НП_001070151
НП_001070152
НП_055048

н/д

Местоположение (UCSC) Чр 17: 44,21 – 44,22 Мб Чр 11: 102,2 – 102,21 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фактор транскрипции восходящего связывания (UBTF) , или фактор восходящего связывания (UBF), представляет собой белок , который у человека кодируется UBTF геном . [ 5 ] [ 6 ]

У человека ген UBTF кодирует белок, состоящий из 764 аминокислот, и расположен на хромосоме 17 в положении q21.31. [ 7 ] [ 8 ] У мышей UBTF обнаруживается на хромосоме 11. [ нужна ссылка ] .

Структура

[ редактировать ]

UBTF содержит шесть групповых боксов с высокой подвижностью ( HMG-боксы ), которые позволяют ему связываться с ДНК. [ 9 ] UBTF также содержит гиперкислотный карбокси-концевой домен, который необходим для активации транскрипции, и мотив димерации спираль-разрыв-спираль (поскольку считается, что UBTF часто действует как димер). [ 9 ] [ 10 ]

У людей альтернативный сплайсинг может привести к образованию изоформ UBTF1 или UBTF2, масса которых составляет 97 кДа и 94 кДа соответственно. [ 11 ] В UBTF2 отсутствует экзон 8 более крупной изоформы UBTF1, которая кодирует часть HMG Box 2. [ 12 ]

UBTF представляет собой фактор транскрипции, необходимый для экспрессии рибосомальных РНК 18S, 5,8S и 28S, а также SL1 (комплекс TBP (MIM 600075) и трех TBP-ассоциированных факторов или «TAF»). [ нужна ссылка ] .

UBTF представляет собой ядрышковый фосфопротеин с ДНК-связывающим и трансактивационным доменами. Специфическое для последовательности связывание ДНК с ядром и вышестоящими контрольными элементами промотора рРНК человека опосредовано через несколько боксов HMG. [ 13 ] [предоставлено OMIM] [ 6 ]

У позвоночных UBTF играет решающую роль в поддержании хроматина рДНК в эухроматическом состоянии. Следовательно, связывание UBTF является одной из характеристик эухроматических транскрипционно активных повторов рДНК. [ 14 ]

Было обнаружено, что UBTF2 регулирует транскрипцию мРНК с помощью РНК-полимеразы II. [ 9 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

UBTF может играть роль в развитии рака. Повышенное связывание UBF с рДНК наблюдалось в раковых клетках и связано с повышенной транскрипцией рДНК и выживаемостью опухолевых клеток. [ 15 ] В подтверждение этого было обнаружено, что цисплатин, химиотерапевтический препарат, может вытеснять UBTF из рДНК, вызывая снижение синтеза рРНК и последующий p53-независимый апоптоз. [ 16 ]

Кроме того, было обнаружено, что UBTF способствует развитию меланомы, стимулируя экспрессию GIT1, которая, в свою очередь, активирует сигнальные пути MEK1/2-ERK1/2. [ 17 ]

UBTF также может быть важен для неврологического функционирования. развития . Было обнаружено, что мутация de novo в отношении усиления функции UBTF (c.628G>A) вызывает нейрорегрессию [ 12 ] Эта мутация заменяет глутаминовую кислоту лизином в положении 210 полипептидной цепи (p.Glu210Lys), что приводит к более сильному взаимодействию UBTF с ДНК. [ 18 ] В 2022 году у пробанда с тяжелой ранней задержкой развития был выявлен еще один вероятный патогенный вариант (Gln203Arg). [ 19 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что UBTF взаимодействует с:

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000108312 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020923 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Матера А.Г., Ву В., Имаи Х., О'Киф С.Л., Чан Э.К. (май 1997 г.). «Молекулярное клонирование гена транскрипционного фактора РНК-полимеразы I hUBF / NOR-90 (UBTF) и локализация на 17q21.3 путем флуоресцентной гибридизации in situ и радиационного гибридного картирования». Геномика . 41 (1): 135–8. дои : 10.1006/geno.1997.4647 . ПМИД   9126496 .
  6. ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: транскрипционный фактор, связывающий UBTF, РНК-полимераза I» .
  7. ^ Джонс К.А., Блэк DM, Гриффитс Б.Л., Соломон Э. (декабрь 1995 г.). «Локализация гена транскрипционного фактора РНК-полимеразы I человека (UBTF) в локусе D17S183 на хромосоме 17q21 и построение карты дальнего ограничения региона». Геномика . 30 (3): 602–4. дои : 10.1006/geno.1995.1283 . ПМИД   8825649 .
  8. ^ Эдвардсон С., Николае С.М., Агравал П.Б., Миньо С., Пейн К. и др. (август 2017 г.). «Гетерозиготный вариант усиления функции De Novo UBTF связан с нейродегенерацией в детстве» . Американский журнал генетики человека . 101 (2): 267–73. дои : 10.1016/j.ajhg.2017.07.002 . ПМЦ   5544390 . ПМИД   28777933 .
  9. ^ Перейти обратно: а б с Санидж Э., Диш Дж., Лесмана А., Поортинга Г., Хейн Н. и др. (февраль 2015 г.). «Новая роль транскрипционного фактора Pol I UBTF в поддержании стабильности генома посредством регуляции высокотранскрибируемых генов Pol II» . Геном Рез . 25 (2): 201–12. дои : 10.1101/гр.176115.114 . ПМЦ   4315294 . ПМИД   25452314 .
  10. ^ Шнапп Г., Сантори Ф., Карлес К., Рива М., Груммт И. (январь 1994 г.). «Ядрышковый фактор транскрипции UBF, содержащий HMG-бокс, взаимодействует со специфической субъединицей РНК-полимеразы I» . ЭМБО Дж . 13 (1): 190–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06248.x . ПМЦ   394792 . ПМИД   394792 .
  11. ^ Белл С.П., Лирден Р.М., Янцен Х.М., Тцзян Р. (сентябрь 1988 г.). «Функциональная кооперативность между факторами транскрипции UBF1 и SL1 опосредует синтез рибосомальной РНК человека». Наука . 241 (4870): 1192–7. Бибкод : 1988Sci...241.1192B . дои : 10.1126/science.3413483 . ПМИД   3413483 .
  12. ^ Перейти обратно: а б Торо С., Хори Р.Т., Маликдан М.С., Тиффт С.Дж., Гольдштейн А. и др. (февраль 2018 г.). «Рекуррентная миссенс-мутация de novo в UBTF вызывает нейрорегрессию развития» . ЭМБО Дж . 27 (4): 691–705. дои : 10.1093/hmg/ddx435 . ПМЦ   5886272 . ПМИД   29300972 .
  13. ^ Янцен Х.М., Адмон А., Белл С.П., Тцзян Р. (апрель 1990 г.). «Ядрышковый фактор транскрипции hUBF содержит ДНК-связывающий мотив, гомологичный белкам HMG» . Природа . 344 (6269): 830–6. Бибкод : 1990Natur.344..830J . дои : 10.1038/344830a0 . ПМИД   2330041 . S2CID   4280039 .
  14. ^ Санидж Э., Ханнан Р. (август 2009 г.). «Роль UBF в регуляции структуры и динамики транскрипционно активного хроматина рДНК» . Эпигенетика . 4 (6): 374–82. дои : 10.4161/epi.4.6.9449 . ПМИД   19717978 . S2CID   30922645 .
  15. ^ Диш Дж., Байуотер М.Дж., Санидж Э., Кэмерон Д.П., Ширдинг В. и др. (январь 2019 г.). «Изменения в дальних взаимодействиях рДНК-генома связаны с измененными генными программами РНК-полимеразы II во время злокачественной трансформации» . Коммуникационная биология . 2 : е39 (2019). дои : 10.1038/s42003-019-0284-y . ПМК   6349880 . ПМИД   30701204 . S2CID   210151479 .
  16. ^ Хамдейн Н., Хердман С., Марс Дж., Стефановский В., Трембле М.Г., Мосс Т. (сентябрь 2015 г.). «Истощение фактора HMGB-бокса UBF, нацеленного на цисплатин, избирательно индуцирует p53-независимую апоптозную смерть в трансформированных клетках» . Онкотаргет . 6 (29): 27519–27536. дои : 10.18632/oncotarget.4823 . ПМК   4695006 . ПМИД   26317157 .
  17. ^ Чжан Дж., Чжан Дж., Лю В., Гэ Р., Гао Т. и др. (октябрь 2021 г.). «UBTF способствует прогрессированию меланомы посредством модуляции сигнальных путей MEK1/2-ERK1/2 путем стимулирования транскрипции GIT1» . Международная организация раковых клеток . 21 (1): 543 (2021). дои : 10.1186/s12935-021-02237-8 . ПМЦ   8522148 . ПМИД   34663332 .
  18. ^ Эдвардсон С., Николае С.М., Агравал П.Б., Миньо С., Пейн К. и др. (август 2017 г.). «Гетерозиготный вариант усиления функции De Novo UBTF связан с нейродегенерацией в детстве» . Американский журнал генетики человека . 101 (2): 267–73. дои : 10.1016/j.ajhg.2017.07.002 . ПМЦ   5544390 . ПМИД   28777933 .
  19. ^ Тинкер Р.Дж., Гесс Т., Ринкер Д.С., Шихан Дж.Х., Любарски Д. и др. (декабрь 2022 г.). «Новый, вероятно патогенный вариант нейродегенерации, связанной с UBTF, с атрофией мозга связан с тяжелым дивергентным фенотипом развития нервной системы» . Молекулярная генетика и геномная медицина . 10 (12): е2054. дои : 10.1002/mgg3.2054 . ПМЦ   9747545 . ПМИД   36106513 .
  20. ^ Войт Р., Кун А., Сандер Э.Э., Груммт I (июль 1995 г.). «Активация транскрипции рибосомальных генов млекопитающих требует фосфорилирования ядрышкового фактора транскрипции UBF» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (14): 2593–9. дои : 10.1093/нар/23.14.2593 . ПМК   307079 . ПМИД   7651819 .
  21. ^ Ханнан К.М., Ханнан Р.Д., Смит С.Д., Джефферсон Л.С., Лун М., Ротблюм Л.И. (октябрь 2000 г.). «Rb и p130 регулируют транскрипцию РНК-полимеразы I: Rb нарушает взаимодействие между UBF и SL-1» . Онкоген . 19 (43): 4988–99. дои : 10.1038/sj.onc.1203875 . ПМИД   11042686 .
  22. ^ Войт Р., Груммт I (ноябрь 2001 г.). «Фосфорилирование UBF по серину 388 необходимо для взаимодействия с РНК-полимеразой I и активации транскрипции рДНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (24): 13631–6. Бибкод : 2001PNAS...9813631V . дои : 10.1073/pnas.231071698 . ПМК   61092 . ПМИД   11698641 .
  23. ^ Чжай В., Комай Л. (август 2000 г.). «Репрессия транскрипции РНК-полимеразы I супрессором опухоли р53» . Мол. Клетка. Биол . 20 (16): 5930–8. дои : 10.1128/mcb.20.16.5930-5938.2000 . ПМК   86070 . ПМИД   10913176 .
  24. ^ Лин С.И., Туан Дж., Скалиа П., Буй Т., Комай Л. (декабрь 2002 г.). «Фактор регулирования клеточного цикла TAF1 стимулирует транскрипцию рибосомальной ДНК путем связывания с активатором UBF» . Курс. Биол . 12 (24): 2142–6. дои : 10.1016/s0960-9822(02)01389-1 . ПМИД   12498690 . S2CID   16352280 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: dd2cbb94c7ce1641d3e8bdf8a6f1c00f__1701133440
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/dd/0f/dd2cbb94c7ce1641d3e8bdf8a6f1c00f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
UBTF - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)