TAF7

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Tafii55_n
Tafii55_n
Идентификаторы
Символ	Tafii55_n
Pfam	PF04658
InterPro	IPR006751
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

TAF7
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4RGW, 5FUR
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF7 , TAF2F, TAFII55, TATA-BOX-связывающий белок, связанный с фактором 7
Внешние идентификаторы	Омим : 600573 ; MGI : 1346348 ; Гомологен : 133942 ; GeneCards : TAF7 ; OMA : TAF7 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	141,320,784 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	37,777,257 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; islet of Langerhans; ; ventricular zone; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; gastrocnemius muscle; ; Epithelium of choroid plexus; ; right ventricle; ; vastus lateralis muscle;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; granulocyte; ; blastocyst; ; morula; ; embryo; ; epiblast; ; Gonadal ridge; ; primary oocyte; ; genital tubercle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; transcription factor binding; thyroid hormone receptor binding; protein binding; histone acetyltransferase binding; vitamin D receptor binding; protein heterodimerization activity; H3K27me3 modified histone binding; TFIIH-class transcription factor complex binding; P-TEFb complex binding;
Cellular component	cytoplasm; Golgi apparatus; transcription factor TFTC complex; MLL1 complex; cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex; nucleus; nucleoplasm; transcription regulator complex; transcription factor TFIID complex;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of protein kinase activity; regulation of transcription by RNA polymerase II; spermine transport; RNA polymerase II preinitiation complex assembly; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, initiation; negative regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of histone acetylation; intracellular estrogen receptor signaling pathway; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6879
	24074
	ENSG00000178913
	Ensmusg00000051316
	Q15545
	Q9R1C0
	NM_005642
	NM_175770
	NP_005633
	NP_786964
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор инициации транскрипции TFIID субъединица 7, также известная как TAFII55, является белком , который у людей кодируется TAF7 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Безмолвный ген для этого коактиватора транскрипции расположен между кластерами бета -протокадгерина и гамма -гена на хромосоме 5. Белок, кодируемый этим геном, является компонентом комплекса белка TFIID, комплекс, который связывается с коробкой TATA в промоторах II класса II и рекурент. РНК -полимераза II и другие факторы. Эта конкретная субъединица взаимодействует с самой большой субъединицей TFIID, а также с несколькими активаторами транскрипции. Белок необходим для транскрипции промоторами, нацеленными на РНК -полимеразу II. ^{[ 6 ]}

Общий фактор транскрипции , TFIID, состоит из TATA-связывающего белка (TBP), связанного с серией факторов, связанных с TBP (TAF), которые вместе участвуют в сборке транскрипции предварительного комплекса . TAFII55 связывается с TAFII250 и ингибирует его активность ацетилтрансферазы. Точная роль TAFII55 в настоящее время неизвестна, но исследования показали, что он взаимодействует с путем C-Jun . ^{[ 7 ]} Консервативная область расположена в направлении N - концевого белка. ^{[ 8 ]} Эта запись рассказывает о N-концевой домене.

Кристаллографические исследования выявили очень значительный гидрофобный карман между TAF7 и TAF1, его главным партнером по связыванию. Благодаря невероятной гидрофобности этого взаимодействия маловероятно, что TAF1 сможет правильно сложить без присутствия TAF7. Таким образом, возможно, что TAF7 необходим для правильного производства TAF1 ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TAF7 взаимодействует :

TAF15 , ^{[ 10 ]}
TAF1 , ^{[ 8 ]} и
TATA -связывающий белок . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000178913 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000051316 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Chiang CM, Roeder RG (январь 1995 г.). «Клонирование внутренней субъединицы TFIID человека, которая взаимодействует с множественными активаторами транскрипции». Наука . 267 (5197): 531–6. Bibcode : 1995sci ... 267..531c . doi : 10.1126/science.7824954 . PMID 7824954 . S2CID 21236901 .
^ «Ген Entrez: TAF7 TAF7 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 55 кДа» .
^ Munz C, Psichiri E, Mandilis D, Lavigne AC, Siligom M, Oehler T, Davidon I, Tora L, Angel P, Pintzas A (июнь 2003 г.). «TAF7 (THII55) играет роль в активации транспрессии с помощью C-Jun » Журнал биологической химии 278 (24): 21510–6 Doi : 10.1074/jbc.m22764200 . PMID 12676957
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Gegonne A, Weissman JD, Singer DS (октябрь 2001 г.). «Связывание TAFII55 с TAFII250 ингибирует его активность ацетилтрансферазы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (22): 12432–7. Bibcode : 2001pnas ... 9812432G . doi : 10.1073/pnas.211444798 . PMC 60071 . PMID 11592977 .
^ Bhattacharya S, Lou X, Hwang P, Rajashankar KR, Wang X, Gustafsson Jå , Fletterick RJ, Jacobson RH, Webb P (июнь 2014 г.). «Структурное и функциональное понимание TAF1-TAF7, подкомплекса транскрипционного фактора II D» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (25): 9103–8. BIBCODE : 2014PNAS..111.9103B . doi : 10.1073/pnas.1408293111 . PMC 4078864 . PMID 24927529 .
^ Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
^ Потчд Дж.С., Менгус Г., Брэнсини С., Монако Л., Парвинен М., Сассоне-Корси П., Дэвидсон I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралога транскрипционного фактора TFIID субъединицы TAF7, регулируется развитием во время дифференцировки зародышевых клеток мужского пола». Журнал сотовой науки . 116 (Pt 9): 1847–58. doi : 10.1242/jcs.00391 . PMID 12665565 . S2CID 24519687 .
^ Bellorini M, Lee Dk, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (июнь 1997 г.). «Связывание CCAAT NF-Y-TBP взаимодействия: NF-YB и NF-IC требуют коротких доменов, прилегающих к их гистоновым складным мотивам для ассоциации с основными остатками TBP» . Исследование нуклеиновых кислот . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093/nar/25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .

Дальнейшее чтение

Чжоу Q, Sharp PA (январь 1995 г.). «Новый механизм и фактор регуляции с помощью ВИЧ-1 Тат» . Embo Journal . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (февраль 1995 г.). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне удлинения in vitro» . Журнал биологической химии . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
OU SH, Garcia-Martínez LF, Paulsen EJ, Gaynor RB (ноябрь 1994). «Роль фланкирующих мофтов по борьбе в ящиках в вирусе вируса иммунодефицита человека типа 1 Функция TATA -элемента » Журнал вирусологии 68 (11): 7188–9 Doi : 10.1128/ jvi.68.11.7188-7 237158PMC PMID 7933101
Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (март 1994 г.). «Очистка островов CPG с использованием метилированной ДНК -связывающей колонны». Природа генетика . 6 (3): 236–44. doi : 10.1038/ng0394-236 . PMID 8012384 . S2CID 12847618 .
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (январь 1994). «Прямое взаимодействие человека TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 TAT». Природа . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994natur.367..295k . doi : 10.1038/367295A0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (июнь 1996 г.). «Мутанты вируса иммунодефицита человека типа 1 типа и трансактивация мутантов вируса иммунодефицита человека связывают тата-связывающий белок человека in vitro» . Журнал синдромов приобретенного иммунного дефицита и ретровирологии человека . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
Lavigne AC, Mengus G, May M, Dubrovskaya V, Tora L, Chambon P, Davidson I (август 1996 г.). «Многочисленные взаимодействия между HTAFII55 и другими субъединицами TFIID. Требования к образованию стабильных тройных комплексов между HTAFII55 и TATA-связывающим белком» . Журнал биологической химии . 271 (33): 19774–80. doi : 10.1074/jbc.271.33.19774 . PMID 8702684 .
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (август 1996 г.). «Мутации в карбокси-концевом домене TBP влияют на синтез вируса иммунодефицита человека типа 1 полной длины и коротких транскриптов аналогично» . Журнал вирусологии . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
Radovich MR. Tfiid-tfiid-tfiid-tfiid-tfiia комплекс " Журнал вирусологии 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/JVI.70.503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
Rowlands JC, McEwan IJ, Gustafsson JA (сентябрь 1996 г.). «Транс-активация человеческими белками ядерного транслокатора-арилового углеводородного рецептора и арилглетоглерода-рецептора ядерного транслокатора: прямое взаимодействие с базальными транскрипционными факторами». Молекулярная фармакология . 50 (3): 538–48. PMID 8794892 .
Чжоу Q, Sharp PA (октябрь 1996 г.). «TAT-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью ВИЧ-1 ТАТ». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996sci ... 274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (март 1997 г.). «Ассоциация ТАТ с очищенными комплексами транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2 транскрипции» . Журнал биологической химии . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (сентябрь 1997 г.). «Транскрипционный фактор TFIID Рекрутирует фактор CPSF для образования 3 'конца мРНК». Природа . 389 (6649): 399–402. Bibcode : 1997natur.389..399d . doi : 10.1038/38763 . PMID 9311784 . S2CID 4413324 .
Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
Фрейзер Р.А., Херд, диджей, Адам С., Лавин А.К., Ле Дуарин Б., Тора Л., Унига Р., Рошет-Эгли С, Шамбон П (июнь 1998 г.). «Предполагаемый кофактор Tif1alpha представляет собой протеинкиназу, которая гиперфосфорилируется при взаимодействии с ядерными рецепторами с лигированными ядерными рецепторами» . Журнал биологической химии . 273 (26): 16199–204. doi : 10.1074/jbc.273.26.16199 . PMID 9632676 .
Furukawa T, Tanese N (сентябрь 2000 г.). «Сборка частичных комплексов TFIID в клетках млекопитающих выявляет различную активность, связанную с отдельными факторами, связанными с белком TATA-связывающим белком» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29847–56. doi : 10.1074/jbc.m002989200 . PMID 10896937 .
Yuan CX, Gurley WB (июль 2000 г.). «Потенциальные цели для HSF1 в предварительном комплексе» . Клеточный стресс и шапероны . 5 (3): 229–42. PMC 312889 . PMID 11005381 .
Wu Q, Zhang T, Cheng JF, Kim Y, Grimwood J, Schmutz J, Dickson M, Noonan JP, Zhang MQ, Myers RM, Maniatis T (март 2001 г.). «Сравнительный анализ последовательности ДНК кластеров генов протокадерина мыши и человека» . Исследование генома . 11 (3): 389–404. doi : 10.1101/gr.167301 . PMC 311048 . PMID 11230163 .
Чжоу Т., Чианг СМ (июль 2001 г.). «Ген без интронов и не без таты человека TAF (II) 55 содержит функциональный инициатор и элемент промотора нижнего течения» . Журнал биологической химии . 276 (27): 25503–11. doi : 10.1074/jbc.m102875200 . PMID 11340078 .

Внешние ссылки

ФАКТРИЗКА TAF7
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q15545 (коэффициент инициации транскрипции TFIID 7) в PDBE-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000178913 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000051316 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7824954-5] Chiang CM, Roeder RG (январь 1995 г.). «Клонирование внутренней субъединицы TFIID человека, которая взаимодействует с множественными активаторами транскрипции». Наука . 267 (5197): 531–6. Bibcode : 1995sci ... 267..531c . doi : 10.1126/science.7824954 . PMID 7824954 . S2CID 21236901 .

[entrez-6] «Ген Entrez: TAF7 TAF7 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 55 кДа» .

[pmid12676957-7] Munz C, Psichiri E, Mandilis D, Lavigne AC, Siligom M, Oehler T, Davidon I, Tora L, Angel P, Pintzas A (июнь 2003 г.). «TAF7 (THII55) играет роль в активации транспрессии с помощью C-Jun » Журнал биологической химии 278 (24): 21510–6 Doi : 10.1074/jbc.m22764200 . PMID 12676957

[pmid11592977-8] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Gegonne A, Weissman JD, Singer DS (октябрь 2001 г.). «Связывание TAFII55 с TAFII250 ингибирует его активность ацетилтрансферазы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (22): 12432–7. Bibcode : 2001pnas ... 9812432G . doi : 10.1073/pnas.211444798 . PMC 60071 . PMID 11592977 .

[9] Bhattacharya S, Lou X, Hwang P, Rajashankar KR, Wang X, Gustafsson Jå , Fletterick RJ, Jacobson RH, Webb P (июнь 2014 г.). «Структурное и функциональное понимание TAF1-TAF7, подкомплекса транскрипционного фактора II D» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (25): 9103–8. BIBCODE : 2014PNAS..111.9103B . doi : 10.1073/pnas.1408293111 . PMC 4078864 . PMID 24927529 .

[pmid9488465-10] Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .

[pmid12665565-11] Потчд Дж.С., Менгус Г., Брэнсини С., Монако Л., Парвинен М., Сассоне-Корси П., Дэвидсон I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралога транскрипционного фактора TFIID субъединицы TAF7, регулируется развитием во время дифференцировки зародышевых клеток мужского пола». Журнал сотовой науки . 116 (Pt 9): 1847–58. doi : 10.1242/jcs.00391 . PMID 12665565 . S2CID 24519687 .

[pmid9153318-12] Bellorini M, Lee Dk, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (июнь 1997 г.). «Связывание CCAAT NF-Y-TBP взаимодействия: NF-YB и NF-IC требуют коротких доменов, прилегающих к их гистоновым складным мотивам для ассоциации с основными остатками TBP» . Исследование нуклеиновых кислот . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093/nar/25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]