Фактор транскрипции II D

Транскрипционный фактор II D ( TF _II D ) является одним из нескольких общих факторов транскрипции , которые составляют РНК -полимеразы II предварительный комплекс . Голофермент РНК -полимеразы II является формой эукариотической РНК -полимеразы II , которая рекрутируется на промоторы генов, кодирующих белок, в живых клетках. Он состоит из РНК -полимеразы II , подмножества общих транскрипционных факторов и регуляторных белков , известных как белки SRB. Перед началом транскрипции комплекс транскрипции II D (TF _II D) связывается с ДНК промотора ядра гена посредством специфического распознавания мотивов последовательности промоторных последовательностей, включая TATA Box , инициатор , нижний промотор , мотива или регуляторный регулятор элементы. ^{[ 1 ]}

Функции

Координирует активность более 70 полипептидов, необходимых для инициации транскрипции с помощью РНК -полимеразы II
Связывается с промотором ядра для правильного расположения полимеразы
Служит каркасом для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса
Действует как канал для регулирующих сигналов

Структура

TF _II D сами состоит из TBP и нескольких субъединиц, называемых TATA-связывающим белком, связанными с факторами ( факторы, связанные с TBP , или TAF ). В тестовой трубе необходимо только TBP для транскрипции у промоторов , которые содержат коробку TATA . ^{[ 2 ]} TAF, однако, добавляют промоторскую селективность, особенно если нет последовательности TATA Box для TBP. ^{[ 1 ]} Тафы включены в два различных комплекса, TF _II D ^{[ 3 ]} и B-TF _II D. ^{[ 4 ]} Комплекс TF _II D состоит из TBP и более восьми TAF. Но большая часть TBP присутствует в комплексе B-TF _II D, который состоит из TBP и TAFII170 ( BTAF1 ) в соотношении 1: 1. ^{[ 5 ]} TF _II D и B-TF _II D не являются эквивалентными, поскольку реакции транскрипции, использующие TF _II D, реагируют на специфические гены факторы транскрипции, такие как SP1, в то время как реакции, восстановленные B-TF _II D, не являются. ^{[ 5 ]}

Субъединицы в комплексе TF _II D включают: ^{[ 2 ]}

TBP (TATA -связывающий белок), или:
- Связанные с TBP факторы у животных ( TBPL1 ; TBPL2 ) ^{[ 6 ]}
TAF1 (WAST250)
TAF2 (CIF150)
TAF3 (TAFII140)
TAF4 (потерь130 / 135)
TAF4B (FIXED105)
TAF5 (тратя100)
TAF6 (TAFII70/80)
TAF7 (TAFII55)
TAF8 (GOI43)
Тавер9 (GOII31 / 32)
TAF9B (на ASSI31)
TAF10 (TAFII30)
TAF11 (Fasty28)
TAF12 (TAFII20/15)
TAV13 (GOI18)
TAF15 (WAST68)

Смотрите также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Громче, rk; Привет; Лопес-Бланко, младший; Клык, J; Чакон, P; Nogales, E (2016). «Структура TFIID и модели комплекса предварительного инициализации человека» . Природа . 531 (7596): 604–609. Bibcode : 2016natur.531..604l . doi : 10.1038/nature17394 . PMC 4856295 . PMID 27007846 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ли, Тонг Ин; Янг, Ричард А. (2000). «Транскрипция генов кодирования эукариотического белка». Анну. Преподобный Генет . 34 : 77–137. doi : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 .
^ Dynlacht, Брайан Дэвид; Хои, Тимоти; Tjian, Robert (август 1991 г.). «Выделение ко-активаторов, связанных с TATA-связывающим белком, который опосредует активацию транскрипции». Клетка . 66 (3): 563–576. doi : 10.1016/0092-8674 (81) 90019-2 . PMID 1907890 . S2CID 5000858 .
^ «NCBI Entrez Geneid: 9044 BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, B-TFIID, связанный с фактором транскрипции, 170 кДа (MOT1 Homolog, S. cerevisiae )» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Timmers, H.; Мейерс, ре; Шарп, Пенсильвания (сентябрь 1992). «Композиция транскрипционного фактора B-tfiid» . Proc Natl Acad Sci USA . 89 (17): 8140–4. Bibcode : 1992pnas ... 89.8140t . doi : 10.1073/pnas.89.17.8140 . PMC 49872 . PMID 1387711 .
^ Duttke, SH (март 2015 г.). «Эволюция и диверсификация базальной транскрипционной машины» . Тенденции в биохимических науках . 40 (3): 127–9. doi : 10.1016/j.tibs.2015.01.005 . PMC 4410091 . PMID 25661246 .

Внешние ссылки

Транскрипция+фактор+Tfiid в Национальной библиотеке медицинских предметов США (Mesh)
3D Электронная микроскопия структуры TFIID из EM Bank (EMDB)

Эта Genetics статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[:0-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Громче, rk; Привет; Лопес-Бланко, младший; Клык, J; Чакон, P; Nogales, E (2016). «Структура TFIID и модели комплекса предварительного инициализации человека» . Природа . 531 (7596): 604–609. Bibcode : 2016natur.531..604l . doi : 10.1038/nature17394 . PMC 4856295 . PMID 27007846 .

[Lee-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Ли, Тонг Ин; Янг, Ричард А. (2000). «Транскрипция генов кодирования эукариотического белка». Анну. Преподобный Генет . 34 : 77–137. doi : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . PMID 11092823 .

[Dynlacht-3] Dynlacht, Брайан Дэвид; Хои, Тимоти; Tjian, Robert (август 1991 г.). «Выделение ко-активаторов, связанных с TATA-связывающим белком, который опосредует активацию транскрипции». Клетка . 66 (3): 563–576. doi : 10.1016/0092-8674 (81) 90019-2 . PMID 1907890 . S2CID 5000858 .

[BTAF-4] «NCBI Entrez Geneid: 9044 BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, B-TFIID, связанный с фактором транскрипции, 170 кДа (MOT1 Homolog, S. cerevisiae )» .

[Timmers-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Timmers, H.; Мейерс, ре; Шарп, Пенсильвания (сентябрь 1992). «Композиция транскрипционного фактора B-tfiid» . Proc Natl Acad Sci USA . 89 (17): 8140–4. Bibcode : 1992pnas ... 89.8140t . doi : 10.1073/pnas.89.17.8140 . PMC 49872 . PMID 1387711 .

[pmid25661246-6] Duttke, SH (март 2015 г.). «Эволюция и диверсификация базальной транскрипционной машины» . Тенденции в биохимических науках . 40 (3): 127–9. doi : 10.1016/j.tibs.2015.01.005 . PMC 4410091 . PMID 25661246 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]