TAK13

TAK13
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1BH8, 1BH9
Идентификаторы
Псевдонимы	TAK13 , Pay (II) 18, TAF2K, GOI-18, GOI18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18, TATA18 18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tata18, Tatao18
Внешние идентификаторы	Омим : 600774 ; MGI : 1913500 ; Гомологен : 4126 ; GeneCards : TAF13 ; OMA : TAF13 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	109,076,012 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	108,490,538 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	internal globus pallidus; ; lateral nuclear group of thalamus; ; gingival epithelium; ; Brodmann area 23; ; amniotic fluid; ; pars reticulata; ; endothelial cell; ; pons; ; subthalamic nucleus; ; Pars compacta;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; zone of skin; ; layer of retina; ; neural layer of retina; ; quadriceps femoris muscle; ; morula; ; ventricular zone; ; spermatid;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; protein C-terminus binding; protein binding; protein heterodimerization activity; DNA binding; transcription coregulator activity;
Cellular component	nucleolus; transcription factor TFIID complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, initiation; snRNA transcription by RNA polymerase II; regulation of signal transduction by p53 class mediator; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6884
	99730
	ENSG00000197780
	ENSMUSG00000048100
	Q15543
	P61216
	NM_005645
	NM_025444
	NP_005636
	NP_079720
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор инициации транскрипции TFIID Субъединица 13 - это белок , который у людей кодируется TAF13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Инициирование транскрипции с помощью РНК -полимеразы II требует активности более 70 полипептидов. Белок, который координирует эти действия, является транскрипционным фактором IID (TFIID), который связывается с промотором ядра для правильного расположения полимеразы, служит каркасом для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует в качестве канала для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или изменять общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сложного сборки и инициации транскрипции. Этот ген кодирует небольшую субъединицу, связанную с подмножеством комплексов TFIID. Эта субъединица взаимодействует с TBP и с двумя другими небольшими субъединицами TFIID, TAF10 и TAF11. На хромосоме 6 расположен псевдоген. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TAF13 взаимодействует с TAF15 , ^{[ 7 ]} TAF11 , ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} Вы знаете10 ^{[ 5 ]} и TATA -связывающий белок . ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000197780 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000048100 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (май 1995). «Клонирование и характеристика HTAFII18, HTAFII20 и HTAFII28: три субъединицы транскрипционного фактора человека» . Embo j . 14 (7): 1520–31. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TAF13 TAF13 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 18 кДа» .
^ Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
^ Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (июль 1998). «Человеческий TAF (II) 28 и TAF (II) 18 взаимодействуют через гистоновую складку, кодируемую атипичными эволюционными консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81423-3 . PMID 9695952 . S2CID 6274415 .

Дальнейшее чтение

Zhou Q, Sharp PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции с помощью ВИЧ-1 Тат» . Embo j . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне удлинения in vitro» . Дж. Биол. Химический 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
OU SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирования E -бокс мотивы в вирусе вируса иммунодефицита человека типа 1 функции TATA Element» . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/jvi.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). «Прямое взаимодействие человека TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 TAT». Природа . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994natur.367..295k . doi : 10.1038/367295A0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). «Мутанты вируса иммунодефицита человека типа 1 типа и трансактивация мутантов вируса иммунодефицита человека связывают тата-связывающий белок человека in vitro» . J. Acquir. Иммунный дефицит. Синдром. Гул Ретровирол . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене TBP влияют на синтез вируса иммунодефицита человека типа 1 полной длины и коротких транскриптов аналогично» . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
Кашанчи Ф., Хлейф С.Н., Дюваль Дж. Ф., Садай М.Р., Радонович М.Ф., Чо М., Мартин М.А., Чен Си, Вайнманн Р., Брэди Дж.Н. (1996). «Взаимодействие вируса вируса иммунодефицита человека типа 1 с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор DR1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA» . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/jvi.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
Zhou Q, Sharp PA (1996). «TAT-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью ВИЧ-1 ТАТ». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996sci ... 274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). «Ассоциация ТАТ с очищенными комплексами транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2 транскрипции» . Дж. Биол. Химический 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). «Транскрипционный фактор TFIID Рекрутирует фактор CPSF для образования 3 'конца мРНК». Природа . 389 (6649): 399–402. Bibcode : 1997natur.389..399d . doi : 10.1038/38763 . PMID 9311784 . S2CID 4413324 .
Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (1998). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .
Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (1998). «Человеческий TAF (II) 28 и TAF (II) 18 взаимодействуют через гистоновую складку, кодируемую атипичными эволюционными консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81423-3 . PMID 9695952 . S2CID 6274415 .
Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, Isogai T, Hata J, Toyama Y, Umezawa A (2003). «Redifferentiation дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросферы с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Эксплуат Ячейка . 288 (1): 35–50. doi : 10.1016/s0014-4827 (03) 00130-7 . PMID 12878157 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q15543 (коэффициент инициации транскрипции TFIID 13) в PDBE-KB .

Эта статья о гене о хромосоме человека 1 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000197780 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000048100 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7729427-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Mengus G, May M, Jacq X, Staub A, Tora L, Chambon P, Davidson I (май 1995). «Клонирование и характеристика HTAFII18, HTAFII20 и HTAFII28: три субъединицы транскрипционного фактора человека» . Embo j . 14 (7): 1520–31. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . PMC 398239 . PMID 7729427 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: TAF13 TAF13 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 18 кДа» .

[pmid9488465-7] Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делаттр О., Тора Л (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-Fli-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и HTAFII68 и субъединиц комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 .

[pmid9695952-8] Birck C, Poch O, Romier C, Ruff M, Mengus G, Lavigne AC, Davidson I, Moras D (июль 1998). «Человеческий TAF (II) 28 и TAF (II) 18 взаимодействуют через гистоновую складку, кодируемую атипичными эволюционными консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81423-3 . PMID 9695952 . S2CID 6274415 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]