ТАФ11

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

ТАФИИ28
ТАФИИ28
	Кристаллическая структура гетеродимера htafii18/htafii28 со связанными PCMB
Идентификаторы
Символ	ТАФИИ28
Пфам	PF04719
Пфам Клан	CL0012
ИнтерПро	ИПР006809
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1бх9 / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

ТАФ11
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1BH8, 1BH9
Идентификаторы
Псевдонимы	TAF11 , MGC:15243, TAF2I, TAFII28, PRO2134, фактор 11, связанный с белком, связывающим ТАТА-бокс.
Внешние идентификаторы	Опустить : 600772 ; МГИ : 1916026 ; Гомологен : 55918 ; Генные карты : TAF11 ; ОМА : TAF11 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	34,889,192 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	28,128,818 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	amniotic fluid; ; tibia; ; buccal mucosa cell; ; human penis; ; superior surface of tongue; ; palpebral conjunctiva; ; pylorus; ; lactiferous duct; ; urethra; ; parietal pleura;
	Top expressed in
	ventricular zone; ; zygote; ; tail of embryo; ; embryo; ; embryo; ; Ileal epithelium; ; genital tubercle; ; yolk sac; ; granulocyte; ; secondary oocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein heterodimerization activity; transcription coactivator activity; protein binding; vitamin D receptor binding; protein N-terminus binding; thyroid hormone receptor binding; DNA binding; transcription factor binding;
Cellular component	Golgi apparatus; transcription factor TFIID complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	RNA polymerase II preinitiation complex assembly; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; positive regulation by host of viral transcription; transcription, DNA-templated; snRNA transcription by RNA polymerase II; regulation of signal transduction by p53 class mediator; positive regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6882
	68776
	ENSG00000064995
	ENSMUSG00000024218
	Q15544
	Q99JX1
	НМ_001270488 ; НМ_005643
	НМ_026836 ; НМ_001379368
	НП_001257417 ; НП_005634
	НП_081112 ; НП_001366297
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор инициации транскрипции Субъединица 11 TFIID, также известная как TAFII28, представляет собой белок , который у человека кодируется TAF11 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белок, который координирует эту активность, представляет собой транскрипционный фактор IID (TFIID), который связывается с основным промотором, обеспечивая правильное положение полимеразы, служит основой для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из ТАТА-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF), чтобы облегчить сборку комплекса и инициацию транскрипции. Этот ген кодирует небольшую субъединицу TFIID, которая присутствует во всех комплексах TFIID и взаимодействует с TBP. Эта субъединица также взаимодействует с другой небольшой субъединицей, TAF13, с образованием гетеродимера со структурой, сходной со структурой ядра гистона. ^{[ 7 ]}

В молекулярной биологии TAFII28 относится к фактору, связанному с белком, связывающим TATA-бокс . Вместе с ТАТА-связывающим белком и другими TAF он образует общий фактор транскрипции TFIID. Они вместе участвуют в сборке транскрипции преинициаторного комплекса . Консервативная членов область находится на С-конце большинства белков- .

Структура

Кристаллическая структура hTAFII28 с hTAFII18 показывает, что эта область участвует в связывании этих двух субъединиц . Консервативная , область содержит четыре альфа-спирали и три петли расположенные как в гистоне H3. ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TAF11 взаимодействует с:

ГТФ2Ф1 , ^{[ 9 ]}
ПОЛР2А ^{[ 9 ]} и
ТАФ13 , ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]}
ТАФ15 , ^{[ 10 ]}
ТАТА-связывающий белок , ^{[ 5 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} и
Транскрипционный фактор II B . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064995 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000024218 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Менгус Дж., Мэй М., Жак Икс, Стауб А., Тора Л., Шамбон П., Дэвидсон I (май 1995 г.). «Клонирование и характеристика hTAFII18, hTAFII20 и hTAFII28: три субъединицы человеческого транскрипционного фактора TFIID» . ЭМБО Дж . 14 (7): 1520–31. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . ПМЦ 398239 . ПМИД 7729427 .
^ Кудзухара Т., Хорикоши М. (ноябрь 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей субъединицу TFIID человека, содержащую множество предполагаемых структурных мотивов, включая прямые повторы» . Биол. Фарм. Бык . 19 (1): 122–6. дои : 10.1248/bpb.19.122 . ПМИД 8820923 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TAF11 TAF11 РНК-полимераза II, фактор, связанный с TATA-бокс-связывающим белком (TBP), 28 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б Бирк С., Поч О., Ромье С., Рафф М., Менгус Дж., Лавин А.С., Дэвидсон И., Морас Д. (июль 1998 г.). «Человеческие TAF(II)28 и TAF(II)18 взаимодействуют через складку гистонов, кодируемую атипичными эволюционно консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . ПМИД 9695952 . S2CID 6274415 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .
^ Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делатр О., Тора Л. (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. дои : 10.1128/mcb.18.3.1489 . ПМЦ 108863 . ПМИД 9488465 .
^ Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .
^ Мэй М., Менгус Г., Лавин А.С., Шамбон П., Дэвидсон I (июнь 1996 г.). «Человеческий TAF(II28) способствует стимуляции транскрипции посредством активации функции 2 ретиноидных X-рецепторов» . ЭМБО Дж . 15 (12): 3093–104. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . ПМК 450252 . ПМИД 8670810 .

Дальнейшее чтение

Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1995). «Новый механизм и фактор регуляции ВИЧ-1 Tat» . ЭМБО Дж . 14 (2): 321–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . ПМК 398086 . ПМИД 7835343 .
Парада Калифорния, Юн Дж.Б., Редер Р.Г. (1995). «Новое ограничение транскрипции ВИЧ-1, опосредованное LBP-1, на уровне элонгации in vitro» . Ж. Биол. Хим . 270 (5): 2274–83. дои : 10.1074/jbc.270.5.2274 . ПМИД 7836461 .
Оу С.Х., Гарсия-Мартинес Л.Ф., Паулссен Э.Дж., Гейнор Р.Б. (1994). «Роль фланкирующих мотивов E-бокса в функции элемента TATA вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . ПМК 237158 . ПМИД 7933101 .
Кашанчи Ф., Пирас Г., Радонович М.Ф., Дюваль Дж.Ф., Фаттей А., Чан К.М., Редер Р.Г., Брейди Дж.Н. (1994). «Прямое взаимодействие TFIID человека с трансактиватором ВИЧ-1 tat». Природа . 367 (6460): 295–9. Бибкод : 1994Natur.367..295K . дои : 10.1038/367295a0 . ПМИД 8121496 . S2CID 4362048 .
Мэй М., Менгус Г., Лавин А.С., Шамбон П., Дэвидсон I (1996). «Человеческий TAF(II28) способствует стимуляции транскрипции посредством активации функции 2 ретиноидных X-рецепторов» . ЭМБО Дж . 15 (12): 3093–104. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . ПМК 450252 . ПМИД 8670810 .
Ван З., Моррис Г.Ф., Райс А.П., Сюн В., Моррис С.Б. (1996). «Дикий тип и дефектные по трансактивации мутанты белка Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 связывают человеческий ТАТА-связывающий белок in vitro» . Дж. Приобретение. Иммунный дефицит. Синдр. Хм. Ретровирол . 12 (2): 128–38. дои : 10.1097/00042560-199606010-00005 . ПМИД 8680883 .
Пендерграст П.С., Моррисон Д., Тэнси В.П., Эрнандес Н. (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене ТБФ одинаково влияют на синтез полноразмерных и коротких транскриптов вируса иммунодефицита человека типа 1» . Дж. Вирол . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . ЧВК 190456 . ПМИД 8764009 .
Кашанчи Ф., Хлейф С.Н., Дюваль Дж.Ф., Садайе М.Р., Радонович М.Ф., Чо М., Мартин М.А., Чен С.Ю., Вайнманн Р., Брейди Дж.Н. (1996). «Взаимодействие Tat вируса иммунодефицита человека типа 1 с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор Dr1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA» . Дж. Вирол . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . ПМК 190508 . ПМИД 8764062 .
Чжоу Ц, Шарп, Пенсильвания (1996). «Tat-SF1: кофактор стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука . 274 (5287): 605–10. Бибкод : 1996Sci...274..605Z . дои : 10.1126/science.274.5287.605 . ПМИД 8849451 . S2CID 13266489 .
Тао Й., Гермах М., Мартинес Э., Олгешлегер Т., Хасегава С., Такада Р., Ямамото Т., Хорикоши М., Рёдер Р.Г. (1997). «Специфические взаимодействия и потенциальные функции человеческого TAFII100» . Ж. Биол. Химия 272 (10): 6714–21. дои : 10.1074/jbc.272.10.6714 . ПМИД 9045704 .
Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор Р.Б. (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . Ж. Биол. Хим . 272 (11): 6951–8. дои : 10.1074/jbc.272.11.6951 . ПМИД 9054383 .
Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (1997). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .
Дантонель Дж.К., Мурти К.Г., Мэнли Дж.Л., Тора Л. (1997). «Фактор транскрипции TFIID рекрутирует фактор CPSF для образования 3'-конца мРНК». Природа . 389 (6649): 399–402. Бибкод : 1997Natur.389..399D . дои : 10.1038/38763 . ПМИД 9311784 . S2CID 4413324 .
Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делатр О., Тора Л. (1998). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. дои : 10.1128/mcb.18.3.1489 . ПМЦ 108863 . ПМИД 9488465 .
Гермах М., Малик С., Редер Р.Г. (1998). «Участие компонентов TFIID и США в транскрипционной активации промотора вируса иммунодефицита человека с помощью NF-kappaB и Sp1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (6): 3234–44. дои : 10.1128/mcb.18.6.3234 . ПМЦ 108905 . ПМИД 9584164 .
Фрейзер Р.А., Херд DJ, Адам С., Лавин AC, Ле Дуарен Б, Тора Л., Лоссон Р., Рошетт-Эгли С., Шамбон П. (1998). «Предполагаемый кофактор TIF1альфа представляет собой протеинкиназу, которая гиперфосфорилируется при взаимодействии с лигандированными ядерными рецепторами» . Ж. Биол. Хим . 273 (26): 16199–204. дои : 10.1074/jbc.273.26.16199 . ПМИД 9632676 .
Бирк С., Пох О., Ромье С., Рафф М., Менгус Г., Лавин А.С., Дэвидсон И., Морас Д. (1998). «Человеческие TAF(II)28 и TAF(II)18 взаимодействуют через складку гистонов, кодируемую атипичными эволюционно консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . ПМИД 9695952 . S2CID 6274415 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000064995 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000024218 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7729427-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Менгус Дж., Мэй М., Жак Икс, Стауб А., Тора Л., Шамбон П., Дэвидсон I (май 1995 г.). «Клонирование и характеристика hTAFII18, hTAFII20 и hTAFII28: три субъединицы человеческого транскрипционного фактора TFIID» . ЭМБО Дж . 14 (7): 1520–31. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07138.x . ПМЦ 398239 . ПМИД 7729427 .

[pmid8820923-6] Кудзухара Т., Хорикоши М. (ноябрь 1996 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей субъединицу TFIID человека, содержащую множество предполагаемых структурных мотивов, включая прямые повторы» . Биол. Фарм. Бык . 19 (1): 122–6. дои : 10.1248/bpb.19.122 . ПМИД 8820923 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TAF11 TAF11 РНК-полимераза II, фактор, связанный с TATA-бокс-связывающим белком (TBP), 28 кДа» .

[pmid9695952-8] Jump up to: ^а ^б Бирк С., Поч О., Ромье С., Рафф М., Менгус Дж., Лавин А.С., Дэвидсон И., Морас Д. (июль 1998 г.). «Человеческие TAF(II)28 и TAF(II)18 взаимодействуют через складку гистонов, кодируемую атипичными эволюционно консервативными мотивами, также обнаруженными в семействе SPT3» . Клетка . 94 (2): 239–49. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81423-3 . ПМИД 9695952 . S2CID 6274415 .

[pmid9159119-9] Jump up to: ^а ^б ^с Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вэй В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Дж.Д. (май 1997 г.). «BRCA1 является компонентом голофермента РНК-полимеразы II» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (11): 5605–10. Бибкод : 1997PNAS...94.5605S . дои : 10.1073/pnas.94.11.5605 . ПМК 20825 . ПМИД 9159119 .

[pmid9488465-10] Бертолотти А., Мелот Т., Акер Дж., Виньерон М., Делатр О., Тора Л. (март 1998 г.). «EWS, но не EWS-FLI-1, связан как с TFIID, так и с РНК-полимеразой II: взаимодействия между двумя членами семейства TET, EWS и hTAFII68, и субъединицами комплексов TFIID и РНК-полимеразы II» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1489–97. дои : 10.1128/mcb.18.3.1489 . ПМЦ 108863 . ПМИД 9488465 .

[pmid9153318-11] Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК 146709 . ПМИД 9153318 .

[pmid8670810-12] Мэй М., Менгус Г., Лавин А.С., Шамбон П., Дэвидсон I (июнь 1996 г.). «Человеческий TAF(II28) способствует стимуляции транскрипции посредством активации функции 2 ретиноидных X-рецепторов» . ЭМБО Дж . 15 (12): 3093–104. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00672.x . ПМК 450252 . ПМИД 8670810 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]