TAF6

TAF6
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	5FUR
Идентификаторы
Псевдонимы	TO , MGC: 8964, TUGA270, TAF280, AFIGA2, TOGIGE-7000, 2000, 600, 6,5.
Внешние идентификаторы	Омим : 602955 ; MGI : 109129 ; Гомологен : 7561 ; GeneCards : TAF6 ; OMA : TAF6 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	100,119,841 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	138,185,713 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; right hemisphere of cerebellum; ; right frontal lobe; ; body of uterus; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; canal of the cervix; ; right ovary; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; yolk sac; ; muscle of thigh; ; neural layer of retina; ; right kidney; ; neural tube; ; internal carotid artery; ; spermatid;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein binding; protein heterodimerization activity; aryl hydrocarbon receptor binding;
Cellular component	MLL1 complex; transcription factor TFTC complex; cytosol; nucleus; nucleoplasm; SAGA complex; transcription factor TFIID complex; SLIK (SAGA-like) complex; protein-containing complex;
Biological process	negative regulation of cell cycle; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; transcription by RNA polymerase II; regulation of DNA-binding transcription factor activity; transcription, DNA-templated; DNA-templated transcription, initiation; negative regulation of cell population proliferation; regulation of transcription, DNA-templated; snRNA transcription by RNA polymerase II; regulation of signal transduction by p53 class mediator; chromatin organization; RNA polymerase II preinitiation complex assembly; regulation of transcription by RNA polymerase II; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6878
	21343
	ENSG00000106290
	Ensmusg00000036980
	P49848
	Q62311
showNM_001190415 ; NM_005641 ; NM_139122 ; NM_139123 ; NM_139315 ;
	NM_001364998; NM_001364999; NM_001365000; NM_001365001; NM_001365002; NM_001365003; NM_001365004
	NM_009315 ; NM_001356600 ; NM_001356601 ; NM_001356602
showNP_001177344 ; NP_005632 ; NP_647476 ; NP_001351927 ; NP_001351928 ;
	NP_001351929; NP_001351930; NP_001351931; NP_001351932; NP_001351933
	NP_033341 ; NP_001343529 ; NP_001343530 ; NP_001343531
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Фактор инициации транскрипции TFIID Субъединица 6 - это белок , который у людей кодируется TAF6 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Инициирование транскрипции с помощью РНК -полимеразы II требует активности более 70 полипептидов. Белок, который координирует эти действия, является транскрипционным фактором IID (TFIID), который связывается с промотором ядра для правильного расположения полимеразы, служит каркасом для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует в качестве канала для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или изменять общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сложного сборки и инициации транскрипции. Этот ген кодирует одну из меньших субъединиц TFIID, которая слабо связывается с TBP, но сильно с TAF1, самой большой субъединицей TFIID. Четыре изоформы были идентифицированы, но полные транскрипты были определены только для трех изоформ. Было показано, что одна из изоформ исключает связывание одной из других субъединиц TFIID, тем самым снижая транскрипцию и инициируя сигналы, которые вызывают апоптоз. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TAF6 взаимодействует :

TAF5 ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и
TATA -связывающий белок . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000106290 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036980 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Мате Г., Шварценберг Л., Галле-Панненко О., Симмлер М.К. (январь 1977 г.). «Документ для обсуждения: экспериментальные и клинические иммунофармакологические данные, применимые к иммунотерапии рака». Ann NY Acad Sci . 277 : 467–84. doi : 10.1111/j.1749-6632.1976.tb41721.x . PMID 826207 . S2CID 33523496 .
^ «Ген Entrez: TAF6 TAF6 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 80 кДа» .
^ Хси Ю.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковелман Р., Редер Р.Г. (ноябрь 1999). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множественными компонентами механизма РНК-полимеразы III и содержит гистон-специфическую активность ацетилтрансферазы» . Мол Клетка. Биол . 19 (11): 7697–704. doi : 10.1128/mcb.19.11.7697 . PMC 84812 . PMID 10523658 .
^ Тао Й, Герма М., Мартинес Е., Оэлгесчлагер Т., Хасегава С., Такада Р., Ямамото Т., Хорикоши М., Редер Р.Г. (март 1997 г.). "Конкретные взаимодействия и потенциальные функции человека TAFII100 " Дж. Биол. Химический 272 (10): 6714–2 Doi : 10.1074/ jbc.272.10.6 9045704PMID
^ Потчд Дж.С., Менгус Г., Брэнсини С., Монако Л., Парвинен М., Сассоне-Корси П., Дэвидсон I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралога транскрипционного фактора TFIID субъединицы TAF7, регулируется развитием во время дифференцировки зародышевых клеток мужского пола». J. Cell Sci . 116 (Pt 9): 1847–58. doi : 10.1242/jcs.00391 . PMID 12665565 . S2CID 24519687 .
^ Bellorini M, Lee Dk, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (июнь 1997 г.). «Связывание CCAAT NF-Y-TBP взаимодействия: NF-YB и NF-IC требуют коротких доменов, прилегающих к их гистоновым складным мотивам для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Res . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093/nar/25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .
^ Рупперт С., Ван Э.Х., Тджиан Р (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла» . Природа . 362 (6416): 175–9. Bibcode : 1993natur.362..175r . doi : 10.1038/362175A0 . PMID 7680771 . S2CID 4364676 .

Дальнейшее чтение

Klemm RD, Goodrich JA, Zhou S, Tjian R (1995). «Молекулярное клонирование и экспрессия субъединицы 32 кДа человеческого TFIID выявляют взаимодействия с VP16 и TFIIB, которые опосредуют активацию транскрипции» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (13): 5788–92. Bibcode : 1995pnas ... 92.5788K . doi : 10.1073/pnas.92.13.5788 . PMC 41586 . PMID 7597030 .
Chen Hi, Sudol M (1995). «Домен WW белка, ассоциированного с да, связывает богатый пролином лиганд, который отличается от консенсуса, установленного для 3-связывающих модулей SRC гомологии» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (17): 7819–23. Bibcode : 1995pnas ... 92.7819c . doi : 10.1073/pnas.92.17.7819 . PMC 41237 . PMID 7644498 .
Hysatake K, Ohta T, Takada R, Guermah M, Horikoshi M, Nakatani Y, Roeder RG (1995). «Эволюционное сохранение тата-связывающих полипептид-факторов человека и TAFII80 и взаимодействия TAFII80 с другими TAF и с общими факторами транскрипции» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (18): 8195–9. Bibcode : 1995pnas ... 92.8195h . doi : 10.1073/pnas.92.18.8195 . PMC 41123 . PMID 7667268 .
Zhou Q, Sharp PA (1995). «Новый механизм и фактор регуляции с помощью ВИЧ-1 Тат» . Embo j . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). «Новое LBP-1-опосредованное ограничение транскрипции ВИЧ-1 на уровне удлинения in vitro» . Дж. Биол. Химический 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
OU SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). «Роль фланкирования E -бокс мотивы в вирусе вируса иммунодефицита человека типа 1 функции TATA Element» . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/jvi.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). «Прямое взаимодействие человека TFIID с трансактиватором ВИЧ-1 TAT». Природа . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994natur.367..295k . doi : 10.1038/367295A0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). «Мутанты вируса иммунодефицита человека типа 1 типа и трансактивация мутантов вируса иммунодефицита человека связывают тата-связывающий белок человека in vitro» . J. Acquir. Иммунный дефицит. Синдром. Гул Ретровирол . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). «Мутации в карбокси-концевом домене TBP влияют на синтез вируса иммунодефицита человека типа 1 полной длины и коротких транскриптов аналогично» . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
Кашанчи Ф., Хлейф С.Н., Дюваль Дж. Ф., Садай М.Р., Радонович М.Ф., Чо М., Мартин М.А., Чен Си, Вайнманн Р., Брэди Дж.Н. (1996). «Взаимодействие вируса вируса иммунодефицита человека типа 1 с уникальным сайтом TFIID ингибирует отрицательный кофактор DR1 и стабилизирует комплекс TFIID-TFIIA» . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/jvi.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
Zhou Q, Sharp PA (1996). «TAT-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью ВИЧ-1 ТАТ». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996sci ... 274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
Тао Й., Герма М., Мартинес Е., Оэлгешлагер Т., Хасегава С., Такада Р., Ямамото Т., Хорикош М., Редер Р.Г. (1997). "Конкретные взаимодействия и потенциальные функции человека TAFII100 " Дж. Биол. Химический 272 (10): 6714–2 Doi : 10.1074/ jbc.272.10.6 9045704PMID
García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). «Ассоциация ТАТ с очищенными комплексами транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2 транскрипции» . Дж. Биол. Химический 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
Mahanta SK, Scholl T, Yang FC, Strominger JL (1997). «Трансактивация с помощью CIITA, фактор, связанный с синдромом лимфоцитов, связанный с синдромом лимфоцитов, требует участия множества областей белка, связывающего TATA-бокс» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (12): 6324–9. Bibcode : 1997pnas ... 94.6324M . doi : 10.1073/pnas.94.12.6324 . PMC 21048 . PMID 9177216 .
Герма М., Малик С., Редер Р.Г. (1998). «Участие компонентов TFIID и США в транскрипционной активации промотора вируса иммунодефицита человека с помощью NF-Kappab и SP1» . Мол Клетка. Биол . 18 (6): 3234–44. doi : 10.1128/mcb.18.6.3234 . PMC 108905 . PMID 9584164 .
Бренд М., Моггс Дж.Г., Оулад-Абдельгани М., Лежен Ф., Дилворт Ф.Дж., Стивенин Дж., Альмузни Г., Тора Л (2001). «Ультрафиолетовый ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждения ДНК с ацетилированием нуклеосом» . Embo j . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (2001). «Человеческий комплекс Staga представляет собой хроматин-ацетилирующий транскрипционный коактиватор, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и повреждения ДНК in vivo» . Мол Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/mcb.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
Bell B, Scheer E, Tora L (2001). «Идентификация HTAF (II) 80 Delta связывает апоптотические сигнальные пути с фактором транскрипции TFIID» . Мол Клетка . 8 (3): 591–600. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00325-2 . PMID 11583621 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P49848 (коэффициент инициации транскрипции TFIID 6) в PDBE-KB .

Эта статья о гене о хромосоме человека 7 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000106290 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000036980 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid826207-5] Мате Г., Шварценберг Л., Галле-Панненко О., Симмлер М.К. (январь 1977 г.). «Документ для обсуждения: экспериментальные и клинические иммунофармакологические данные, применимые к иммунотерапии рака». Ann NY Acad Sci . 277 : 467–84. doi : 10.1111/j.1749-6632.1976.tb41721.x . PMID 826207 . S2CID 33523496 .

[entrez-6] «Ген Entrez: TAF6 TAF6 РНК-полимераза II, фактор, связывающий белок TATA (TBP), 80 кДа» .

[pmid10523658-7] Хси Ю.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковелман Р., Редер Р.Г. (ноябрь 1999). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множественными компонентами механизма РНК-полимеразы III и содержит гистон-специфическую активность ацетилтрансферазы» . Мол Клетка. Биол . 19 (11): 7697–704. doi : 10.1128/mcb.19.11.7697 . PMC 84812 . PMID 10523658 .

[pmid9045704-8] Тао Й, Герма М., Мартинес Е., Оэлгесчлагер Т., Хасегава С., Такада Р., Ямамото Т., Хорикоши М., Редер Р.Г. (март 1997 г.). "Конкретные взаимодействия и потенциальные функции человека TAFII100 " Дж. Биол. Химический 272 (10): 6714–2 Doi : 10.1074/ jbc.272.10.6 9045704PMID

[pmid12665565-9] Потчд Дж.С., Менгус Г., Брэнсини С., Монако Л., Парвинен М., Сассоне-Корси П., Дэвидсон I (май 2003 г.). «Внутриклеточная локализация TAF7L, паралога транскрипционного фактора TFIID субъединицы TAF7, регулируется развитием во время дифференцировки зародышевых клеток мужского пола». J. Cell Sci . 116 (Pt 9): 1847–58. doi : 10.1242/jcs.00391 . PMID 12665565 . S2CID 24519687 .

[pmid9153318-10] Bellorini M, Lee Dk, Dantonel JC, Zemzoumi K, Roeder RG, Tora L, Mantovani R (июнь 1997 г.). «Связывание CCAAT NF-Y-TBP взаимодействия: NF-YB и NF-IC требуют коротких доменов, прилегающих к их гистоновым складным мотивам для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Res . 25 (11): 2174–81. doi : 10.1093/nar/25.11.2174 . PMC 146709 . PMID 9153318 .

[pmid7680771-11] Рупперт С., Ван Э.Х., Тджиан Р (март 1993 г.). «Клонирование и экспрессия человеческого TAFII250: TBP-ассоциированный фактор, участвующий в регуляции клеточного цикла» . Природа . 362 (6416): 175–9. Bibcode : 1993natur.362..175r . doi : 10.1038/362175A0 . PMID 7680771 . S2CID 4364676 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]