Jump to content

ТАФ9

ТАФ9
Идентификаторы
Псевдонимы TAF9 , MGC:5067, STAF31/32, TAF2G, TAFII-31, TAFII-32, TAFII31, TAFII32, TAFIID32, фактор 9, связанный с белком, связывающим ТАТА-бокс.
Внешние идентификаторы Опустить : 600822 ; МГИ : 1888697 ; Гомологен : 39986 ; Генные карты : TAF9 ; ОМА : TAF9 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_003187
НМ_001015892

НМ_001015889
НМ_027139

RefSeq (белок)

НП_001015892
НП_003178

НП_001015889
НП_081415

Местоположение (UCSC) Chr 5: 69,36 – 69,37 Мб Чр 13: 100,79 – 100,79 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

РНК-полимераза II TAF9, фактор, связанный с белком TATA-бокса (TBP), 32 кДа , также известный как TAF9 , представляет собой белок , который у людей кодируется TAF9 геном . [ 5 ] [ 6 ]

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белковый комплекс, который координирует эти действия, представляет собой транскрипционный фактор IID ( TFIID ), который связывается с основным промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит основой для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из ТАТА-связывающего белка ( TBP ) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, функционировать в распознавании промотора или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF), чтобы облегчить сборку комплекса и инициацию транскрипции. Этот ген кодирует одну из меньших субъединиц TFIID, которая связывается с базальным фактором транскрипции GTF2B, а также с несколькими активаторами транскрипции, такими как p53 и VP16 . Похожий, но отличный ген ( TAF9B ) был обнаружен на Х-хромосоме и псевдогене. был идентифицирован на хромосоме 19 . Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. [ 5 ]

Структура

[ редактировать ]

Сообщалось, что трансактивирующие домены длиной 17 аминокислот (TAD) нескольких факторов транскрипции напрямую связываются с TAF9: p53, VP16, HSF1 , NF-IL6 , NFAT1 , NF-κB и ALL1/MLL1. [ 7 ] из девяти аминокислот Внутри этих 17 аминокислот для каждого зарегистрированного фактора транскрипции был идентифицирован уникальный домен трансактивации (9aaTAD). [ 8 ] 9aaTAD представляет собой новый домен, общий для большого суперсемейства эукариотических транскрипционных факторов, представленных Gal4 , Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4 , Gln4, Gcn4 у дрожжей и p53, NFAT, NF-κB и VP16 у млекопитающих. [ 9 ] Предполагается, что TAF9 является универсальным кофактором трансактивации транскрипционных факторов 9aaTAD. [ 8 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что TAF9 взаимодействует с:

  1. ^ Jump up to: а б с ENSG00000276463 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000273841, ENSG00000276463 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052293 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: TAF9 TAF9 РНК-полимераза II, фактор, связанный с белком TATA-бокса (TBP), 32 кДа» .
  6. ^ Эванс СК, Фостер С.Дж., Эль-Наггар АК, Лозано Дж. (апрель 1999 г.). «Картирование и мутационный анализ человеческого гена TAF2G, кодирующего кофактор p53». Геномика . 57 (1): 182–3. дои : 10.1006/geno.1999.5745 . ПМИД   10191103 .
  7. ^ Уэсуги М., Ньянгиле О., Лу Х., Левин А.Дж., Вердин Г.Л. (август 1997 г.). «Индуцированная альфа-спираль в домене активации VP16 при связывании с человеческим TAF». Наука . 277 (5330): 1310–3. дои : 10.1126/science.277.5330.1310 . ПМИД   9271577 . Уэсуги М., Вердин Г.Л. (декабрь 1999 г.). «Альфа-спиральный мотив FXXPhiPhi в p53: взаимодействие TAF и дискриминация с помощью MDM2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (26): 14801–6. Бибкод : 1999PNAS...9614801U . дои : 10.1073/pnas.96.26.14801 . ПМК   24728 . ПМИД   10611293 . Чой Ю, Асада С, Уэсуги М (май 2000 г.). «Дивергентные мотивы связывания hTAFII31, скрытые в доменах активации» . Ж. Биол. Хим . 275 (21): 15912–6. дои : 10.1074/jbc.275.21.15912 . ПМИД   10821850 . Вено С., Маратрат М., Сьерра В., Консейлер Э., Дебуше Л. (апрель 1999 г.). «Определение мутанта с дефицитом функции трансактивации p53 и характеристика двух независимых субдоменов трансактивации p53» . Онкоген . 18 (14): 2405–10. дои : 10.1038/sj.onc.1202539 . ПМИД   10327062 . Лин Дж., Чен Дж., Эленбаас Б., Левин А.Дж. (май 1994 г.). «Несколько гидрофобных аминокислот в аминоконцевом домене р53 необходимы для активации транскрипции, связывания с mdm-2 и белком 55-кДа аденовируса 5 E1B» . Генс Дев . 8 (10): 1235–46. дои : 10.1101/gad.8.10.1235 . ПМИД   7926727 .
  8. ^ Jump up to: а б Пискачек С., Грегор М., Неметова М., Грабнер М., Коварик П., Пискачек М. (июнь 2007 г.). «Домен трансактивации девяти аминокислот: утилиты создания и прогнозирования» . Геномика . 89 (6): 756–68. дои : 10.1016/j.ygeno.2007.02.003 . ПМИД   17467953 .
  9. ^ Прогноз для 9aa TAD (как для кислотных, так и для гидрофильных доменов трансактивации) доступен онлайн на сайте National EMBnet-Node Austria ( «Веб-инструмент для прогнозирования 9aaTAD» . EMBnet АВСТРИЯ. Архивировано из оригинала 1 июля 2007 г. Проверено 10 января 2009 г. )
  10. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лаймар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Хаит Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами, связывающими повреждение ДНК, in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 21 (20): 6782–95. дои : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . ПМК   99856 . ПМИД   11564863 .
  11. ^ Лю X, Тесфай Дж., Эврард Ю.А., Дент С.Ю., Мартинес Э. (май 2003 г.). «Домен трансформации c-Myc рекрутирует человеческий комплекс STAGA и требует активности ацетилазы TRRAP и GCN5 для активации транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 278 (22): 20405–12. дои : 10.1074/jbc.M211795200 . ПМК   4031917 . ПМИД   12660246 .
  12. ^ Тао Й., Гермах М., Мартинес Э., Эльгешлегер Т., Хасегава С., Такада Р., Ямамото Т., Хорикоши М., Рёдер Р.Г. (март 1997 г.). «Специфические взаимодействия и потенциальные функции человеческого TAFII100» . Ж. Биол. Химия 272 (10): 6714–21. дои : 10.1074/jbc.272.10.6714 . ПМИД   9045704 .
  13. ^ Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж.К., Земзуми К., Редер Р.Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «Взаимодействия CCAAT, связывающие NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, прилегающих к их мотивам гистоновых складок, для ассоциации с основными остатками TBP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (11): 2174–81. дои : 10.1093/нар/25.11.2174 . ПМК   146709 . ПМИД   9153318 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: a9b1e28416284f49d65cb4fd276e00c6__1691952240
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/a9/c6/a9b1e28416284f49d65cb4fd276e00c6.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
TAF9 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)